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猪β防御素2体外抗大肠杆菌作用机理的初步研究

致谢第4-8页
摘要第8-10页
1. 文献综述第10-17页
    1.1 猪β防御素的概况第10-12页
        1.1.1 猪β防御素的分类第10-11页
        1.1.2 猪β防御素的结构、表达与分布第11页
        1.1.3 猪β防御素的克隆表达第11-12页
    1.2 防御素的抗菌机理第12-13页
    1.3 差异表达基因的研究方法第13-17页
        1.3.1 传统差异表达基因的研究方法第14页
        1.3.2 mRNA差异显示技术及其他差异基因分析方法第14-15页
        1.3.3 ACPT~(TM)技术和GeneFishing~(TM) DEG Premix Kits第15-17页
2. 引言第17-18页
3. 材料与方法第18-36页
    3.1 实验材料第18-19页
        3.1.1 引物合成、质粒和菌种第18页
        3.1.2 酶和试剂盒第18页
        3.1.3 培养基第18页
        3.1.4 主要试剂及配制第18-19页
        3.1.5 主要的仪器与设备第19页
        3.1.6 主要应用软件第19页
    3.2 实验方法第19-36页
        3.2.1 重组工程菌株pBD-2的诱导表达第19-20页
        3.2.2 重组目的蛋白的提取和纯化第20-21页
            3.2.2.1 试剂配制第20-21页
            3.2.2.2 目的蛋白的纯化第21页
        3.2.3 蛋白浓度的测定第21页
        3.2.4 SDS-PAGE电泳第21-23页
            3.2.4.1 相关溶液的配制第21-22页
            3.2.4.2 SDS-PAGE胶的制作第22-23页
            3.2.4.3 SDS-PAGE电泳第23页
        3.2.5 蛋白功能活性的分析第23-24页
        3.2.6 样本的采集和处理第24页
        3.2.7 细菌总RNA的提取、纯化和质量检测方法第24-25页
            3.2.7.1 大肠杆菌RNA提取第24页
            3.2.7.2 细菌总RNA浓度测定第24页
            3.2.7.3 各组细菌总RNA池的建立第24页
            3.2.7.4 细菌总RNA池的纯化第24-25页
            3.2.7.5 纯化后总RNA的浓度和质量检测第25页
        3.2.8 管家基因RT-PCR操作方法第25-27页
            3.2.8.1 管家基因引物设计方法第25-26页
            3.2.8.2 合成引物的稀释与处理方法第26页
            3.2.8.3 管家基因RT-PCR方法第26-27页
        3.2.9 GeneFishing~(TM)差异显示方法第27-28页
            3.2.9.1 GeneFishng~(TM)差异显示RT-PCR方法第27-28页
            3.2.9.2 GeneFishing产物的电泳检测第28页
        3.2.10 差异片段回收、克隆、测序方法第28-30页
            3.2.10.1 差异片段的回收第28-29页
            3.2.10.2 克隆载体的构建第29页
            3.2.10.3 感受态细胞的制备与转化第29-30页
            3.2.10.4 测序第30页
        3.2.11 差异表达基因序列分析第30页
        3.2.12 半定量RT-PCR二次验证方法第30-33页
            3.2.12.1 引物设计方法第30-32页
            3.2.12.2 半定量RT-PCR方法第32-33页
            3.2.12.3 半定量RT-PCR产物的电泳检测第33页
        3.2.13 荧光定量反转录PCR(FQRT-PCR)的试验方法第33-36页
            3.2.13.1 FQRT-PCR的试验步骤第33-35页
            3.2.13.2 FQRT-PCR结果分析方法第35页
            3.2.13.3 目的基因表达量的计算方法第35页
            3.2.13.4 数据分析方法第35-36页
4. 结果与分析第36-51页
    4.1 目的蛋白的诱导表达及纯化第36-37页
    4.2 目的蛋白与大肠杆菌共培养生长趋势分析及抑菌活性分析第37-38页
    4.3 总RNA提取、纯化与检测结果第38页
    4.4 差异表达基因片段获得结果第38-42页
        4.4.1 第一链cDNA质量检测结果第38-39页
        4.4.2 GeneFishing~(TM)RT-PCR获得的差异显示片段结果第39-42页
            4.4.2.1 差异表达片段数目统计结果第39页
            4.4.2.2 GeneFishing~(TM)差异显示RT-PCR电泳结果第39-42页
            4.4.2.3 差异表达条带的回收、克隆和测序结果第42页
    4.5 差异表达基因片段在NCBI网站进行BLAST搜索结果第42-44页
    4.6 半定量RT-PCR验证结果第44-46页
    4.7 实时荧光定量RT-PCR验证结果第46-51页
        4.7.1 差异表达基因荧光定量数据结果第46-47页
        4.7.2 差异表达基因荧光定量数据作图分析结果第47-51页
5. 结论与讨论第51-58页
    5.1 pBD-2的表达、纯化和抑菌第51页
    5.2 GeneFishing~(TM)RT-PCR反应第51-52页
        5.2.1 GeneFishing~(TM)RT-PCR基因差异表达研究方法第51-52页
        5.2.2 GeneFishing~(TM)RT-PCR差异表达结果第52页
        5.2.3 差异条带的回收、克隆和测序第52页
    5.3 半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR验证差异表达基因第52-53页
    5.4 获得的差异表达基因序列分析第53-57页
    5.5 小结第57-58页
参考文献第58-64页
ABSTRACT第64-65页
附件第66-68页

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