摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
主要符号表 | 第10-12页 |
第1章 前言 | 第12-20页 |
1.1 转录组学及转录组研究概述 | 第12-13页 |
1.1.1 转录组学 | 第12页 |
1.1.2 转录组研究现状 | 第12-13页 |
1.2 转录组测序技术 | 第13-16页 |
1.2.1 高通量测序技术 | 第13-14页 |
1.2.2 RNA-Seq技术 | 第14-15页 |
1.2.3 转录组分析概述 | 第15-16页 |
1.3 线粒体转录组作图概述 | 第16-17页 |
1.3.1 线粒体基因组 | 第16页 |
1.3.2 线粒体转录组研究 | 第16-17页 |
1.4 直翅目昆虫及转录组研究概述 | 第17-19页 |
1.4.1 直翅目昆虫研究 | 第17-18页 |
1.4.2 短角外斑腿及其研究现状 | 第18-19页 |
1.5 本课题研究的目的及意义 | 第19-20页 |
第2章 实验材料、方法和实验结果 | 第20-30页 |
2.1 实验材料 | 第20-22页 |
2.1.1 实验标本 | 第20页 |
2.1.2 主要实验仪器 | 第20-21页 |
2.1.3 主要实验试剂 | 第21页 |
2.1.4 常用实验试剂配制 | 第21-22页 |
2.2 实验方法 | 第22-25页 |
2.2.1 实验准备 | 第22页 |
2.2.2 蝗虫RNA提取注意事项 | 第22-23页 |
2.2.3 短角外斑腿蝗总RNA的提取及纯化 | 第23页 |
2.2.4 总RNA样品质量检测 | 第23-24页 |
2.2.5 转录组文库(cDNA)的构建 | 第24-25页 |
2.3 实验结果 | 第25-30页 |
2.3.1 总RNA质量检测 | 第25-28页 |
2.3.2 测序结果统计 | 第28-30页 |
第3章 短角外斑腿蝗转录组的全局分析和三个样本的差异表达基因分析 | 第30-62页 |
3.1 转录组全局分析 | 第30-42页 |
3.1.1 分析方法 | 第30-32页 |
3.1.2 分析结果 | 第32-42页 |
3.2 差异表达基因分析 | 第42-52页 |
3.2.1 分析方法 | 第42-44页 |
3.2.2 结果与分析 | 第44-52页 |
3.3 功能基因深入挖掘 | 第52-59页 |
3.3.1 注释到免疫的功能基因 | 第52-53页 |
3.3.2 注释到功能分子的功能基因 | 第53-54页 |
3.3.3 注释到新陈代谢的功能基因 | 第54-55页 |
3.3.4 注释到生殖与性别形成的功能基因 | 第55-59页 |
3.4 小结与分析 | 第59-62页 |
第4章 qRT-PCR实验验证 | 第62-70页 |
4.1 qRT-PCR实验验证方法 | 第62-64页 |
4.1.1 RNA提取和cDNA合成 | 第62-63页 |
4.1.2 引物设计 | 第63-64页 |
4.1.3 qRT-PCR反应 | 第64页 |
4.2 qRT-PCR实验验证结果 | 第64-65页 |
4.3 分析与讨论 | 第65-70页 |
第5章 短角外斑腿蝗线粒体转录组作图分析 | 第70-76页 |
5.1 研究方法 | 第70-71页 |
5.1.1 线粒体基因组序列和转录组序列来源 | 第70页 |
5.1.2 线粒体转录组作图方法 | 第70-71页 |
5.2 结果与讨论 | 第71-75页 |
5.3 小结 | 第75-76页 |
总结 | 第76-78页 |
参考文献 | 第78-90页 |
致谢 | 第90-92页 |
攻读硕士学位期间研究成果 | 第92页 |