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黄曲霉相关肝癌的基因组特征研究

英文缩略词第7-9页
摘要第9-10页
ABSTRACT第10-11页
前言第12-26页
材料与方法第26-50页
    1 实验材料第26-34页
        1.1 肝癌标本第26-28页
        1.2 试剂盒和主要试剂第28页
        1.3 耗材第28-29页
        1.4 抗体第29页
        1.5 主要仪器设备第29-30页
        1.6 引物序列第30-34页
    2 实验方法第34-50页
        2.1 组织DNA提取第34-35页
        2.2 外周血白细胞DNA提取第35页
        2.3 DNA浓度和质量检测第35-36页
        2.4 第二代高通量测序DNA文库构建第36-42页
        2.5 上机测序第42页
        2.6 生物信息学分析第42-48页
            2.6.1 全基因组测序分析第42-43页
            2.6.2 全外显子组测序分析第43页
            2.6.3 H BV病毒基因组整合位点分析第43-44页
            2.6.4 转录因子结合区的突变位点分析第44-47页
            2.6.5 突变模式分析第47页
            2.6.6 突变相关新生抗原肽分析第47-48页
        2.7 突变位点测序验证第48页
        2.8 免疫组织化学染色第48-49页
        2.9 统计学分析第49-50页
实验结果第50-99页
    3.1 AFB1在食物和人体中的检测第50-52页
    3.2 全基因组测序及全外显子测序数据的质控第52-57页
    3.3 黄曲霉相关肝癌的突变模式第57-65页
    3.4 每个AF-HCC标本的突变模式第65-70页
    3.5 黄曲霉相关肝癌的突变图谱第70-81页
    3.6 非编区的突变分布第81-84页
    3.7 普通人群肝癌的隐匿性黄曲霉相关肝癌的鉴定第84-95页
    3.8 黄曲霉相关肝癌可能对抗PD-1/PD-L1治疗敏感第95-99页
讨论第99-106页
小结第106-107页
参考文献第107-112页
综述 肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤发生发展以及免疫应答中的作用第112-121页
    参考文献第117-121页
致谢第121-123页
个人简历第123-124页
基金资助第124-125页

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