| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第15-29页 |
| 1.1 副溶血弧菌及其对食品安全的危害 | 第15-19页 |
| 1.1.1 食品安全性与致病微生物 | 第15-16页 |
| 1.1.2 副溶血弧菌的分布及其危害 | 第16页 |
| 1.1.3 副溶血弧菌的生物学性状 | 第16-17页 |
| 1.1.4 副溶血弧菌的流行病学特征 | 第17-18页 |
| 1.1.5 副溶血弧菌的毒力因子 | 第18-19页 |
| 1.2 副溶血弧菌检测方法 | 第19-24页 |
| 1.2.1 传统检测方法 | 第19-21页 |
| 1.2.2 快速检测方法 | 第21-23页 |
| 1.2.3 PCR 方法检测副溶血弧菌的靶基因及其优缺点 | 第23-24页 |
| 1.3 生物信息技术与分子检测靶点的发掘 | 第24-28页 |
| 1.3.1 生物信息学简介 | 第24页 |
| 1.3.2 生物信息数据库网络组织 | 第24-26页 |
| 1.3.3 GenBank 数据库介绍 | 第26页 |
| 1.3.4 序列分析方法 | 第26-28页 |
| 1.4 生物信息学在食品安全检测中的应用 | 第28-29页 |
| 2 用生物信息学的方法发掘副溶血弧菌分子检测靶点 | 第29-50页 |
| 2.1 方法与流程概述 | 第30-31页 |
| 2.2 基于本地化的生物分析体系的构建 | 第31-34页 |
| 2.2.1 系统平台与运行环境 | 第31页 |
| 2.2.2 BLAST 软件的获得及安装 | 第31页 |
| 2.2.3 细菌数据库来源及本地化处理 | 第31-33页 |
| 2.2.4 副溶血弧菌核酸序列来源 | 第33-34页 |
| 2.3 副溶血弧菌特异性基因序列的发掘 | 第34-48页 |
| 2.3.1 副溶血弧菌CDS 文件的自动切割 | 第34-38页 |
| 2.3.2 多文件连续BLAST 自动比对 | 第38-40页 |
| 2.3.3 比对结果分析筛选 | 第40-44页 |
| 2.3.4 筛选结果与分析 | 第44-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-50页 |
| 3 副溶血弧菌特异性检测靶点的PCR 评价 | 第50-65页 |
| 3.1 材料与方法 | 第50-57页 |
| 3.1.1 菌种 | 第50-52页 |
| 3.1.2 试剂及培养基的制备 | 第52页 |
| 3.1.3 仪器和设备 | 第52-53页 |
| 3.1.4 副溶血弧菌模板DNA 的提取及纯度分析 | 第53页 |
| 3.1.5 PCR 实验方法 | 第53-55页 |
| 3.1.6 电泳检测 | 第55页 |
| 3.1.7 候选靶点的PCR 验证 | 第55-57页 |
| 3.2 结果与分析 | 第57-63页 |
| 3.2.1 PCR 反应体系优化 | 第57-59页 |
| 3.2.2 副溶血弧菌PCR 引物的特异性验证 | 第59页 |
| 3.2.3 纯模板DNA 检测的灵敏度 | 第59-61页 |
| 3.2.4 副溶血弧菌纯培养物的检测灵敏度 | 第61-62页 |
| 3.2.5 抗干扰能力检测 | 第62-63页 |
| 3.3 讨论 | 第63-65页 |
| 4 总结与展望 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第74页 |