| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩写 | 第7-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-31页 |
| 1.1 Small RNA的研究进展 | 第12页 |
| 1.2 sRNA的发现及分类 | 第12-14页 |
| 1.3 miRNA的生物发生过程及研究进展 | 第14-17页 |
| 1.4 miRNA在植物中的功能研究 | 第17-19页 |
| 1.4.1 miRNA参与植物激素信号通路的调节 | 第17-18页 |
| 1.4.2 miRNA在植物器官发育形成中的作用 | 第18-19页 |
| 1.4.3 miRNA在植物中的其他生物学功能 | 第19页 |
| 1.5 miR156及其靶基因SPL的功能研究进展 | 第19-23页 |
| 1.6 百脉根在生物学中的研究意义 | 第23-25页 |
| 1.7 百脉根与根瘤菌共生的分子调控机制 | 第25-26页 |
| 1.8 第二代测序技术 | 第26-27页 |
| 1.9 植物体内黄酮类化合物生物合成的研究及其意义 | 第27-29页 |
| 1.10 本研究的目的、内容和意义 | 第29-31页 |
| 第二章 miR156在光叶百脉根中的功能研究 | 第31-73页 |
| 2.1 材料和主要试剂 | 第31-33页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第31页 |
| 2.1.2 宿主菌和质粒载体 | 第31页 |
| 2.1.3 主要试剂和溶液的配制 | 第31-33页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第33页 |
| 2.2 载体构建和遗传转化 | 第33-51页 |
| 2.2.1 LjmiR156α的分子克隆 | 第33-38页 |
| 2.2.1.1 RNA的提取 | 第33-35页 |
| 2.2.1.2 cDNA第一链的合成 | 第35页 |
| 2.2.1.3 利用PCR克隆目标基因 | 第35页 |
| 2.2.1.4 PCR产物的回收 | 第35-36页 |
| 2.2.1.5 回收片段与克隆载体的连接 | 第36-37页 |
| 2.2.1.6 感受态细胞的制备及重组质粒对大肠杆菌的转化 | 第37-38页 |
| 2.2.2 过表达载体的构建 | 第38页 |
| 2.2.3 含有过表达载体的农杆菌的获得 | 第38-39页 |
| 2.2.3.1 农杆菌感受态细胞的制备 | 第38-39页 |
| 2.2.3.2 农杆菌的电转化 | 第39页 |
| 2.2.4 光叶百脉根的遗传转化 | 第39-41页 |
| 2.2.5 转基因光叶百脉根的筛选与鉴定 | 第41-45页 |
| 2.2.5.1 转基因植株的PCR鉴定 | 第41-42页 |
| 2.2.5.2 转基因株系的Southern印迹分析 | 第42-45页 |
| 2.2.6 LjmiR156靶基因的筛选及鉴定 | 第45-48页 |
| 2.2.6.1 LjmiR156靶基因的生物信息学筛选 | 第45-46页 |
| 2.2.6.2 LjmiR156靶基因切割位点的验证 | 第46-48页 |
| 2.2.7 基因表达量的检测 | 第48页 |
| 2.2.8 原花青素的组织化学染色 | 第48页 |
| 2.2.9 光叶百脉根与根瘤菌的共生 | 第48-50页 |
| 2.2.10 根瘤发生相关基因的表达分析 | 第50-51页 |
| 2.2.11 统计学分析 | 第51页 |
| 2.3 结果与分析 | 第51-68页 |
| 2.3.1 LjmiR156a的分子克隆及在光叶百脉根中的过表达 | 第51-54页 |
| 2.3.2 过表达载体的构建 | 第54-56页 |
| 2.3.3 miR156过表达光叶百脉根的获得 | 第56-57页 |
| 2.3.4 miR156过表达光叶百脉根株系的Southern杂交验证 | 第57-59页 |
| 2.3.5 miR156过表达植株的表型特征 | 第59-61页 |
| 2.3.6 光叶百脉根miR156靶基因的预测及检验 | 第61-65页 |
| 2.3.6.1 光叶百脉根miR156潜在靶基因的预测分析 | 第61-62页 |
| 2.3.6.2 Lj-miR156对靶基因的调控作用 | 第62-65页 |
| 2.3.7 过表达miR156对光叶百脉根与根瘤菌共生的影响 | 第65-67页 |
| 2.3.8 miR156可以影响黄酮类化合物的分布 | 第67-68页 |
| 2.4 讨论 | 第68-73页 |
| 第三章 百脉根转录组及表达谱的测定 | 第73-87页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第73-76页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第73页 |
| 3.1.2 RNA的提取 | 第73页 |
| 3.1.3 转录组测定 | 第73-74页 |
| 3.1.4 数据分析 | 第74-76页 |
| 3.2 百脉根转录组的分析 | 第76-84页 |
| 3.2.1 测序结果分析 | 第76-77页 |
| 3.2.2 百脉根转录组与光叶百脉根基因组的比较 | 第77-78页 |
| 3.2.3 对拼接序列进行基因功能注释 | 第78-79页 |
| 3.2.4 类黄酮合成代谢途径相关基因 | 第79-83页 |
| 3.2.5 百脉根转录组中的转录因子 | 第83-84页 |
| 3.3 各器官基因的数字表达谱分析 | 第84-86页 |
| 3.4 讨论 | 第86-87页 |
| 结论 | 第87-88页 |
| 附录 | 第88-91页 |
| 附表1 论文中所使用的引物 | 第88-91页 |
| 参考文献 | 第91-102页 |
| 攻读博士学位期间取得的学术成果 | 第102-103页 |
| 个人简介 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
