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大白菜抗芜菁花叶病毒SSR标记及其系统获得性抗性反应基因表达分析

摘要第5-6页
Abstract第6页
1.前言第8-22页
    1.1 分子标记技术研究进展第8-10页
    1.2 表达序列标签微卫星标记的开发第10-12页
    1.3 芜菁花叶病毒(TuMV)的特点及基因组结构功能第12-16页
        1.3.1 TuMV的危害第12页
        1.3.2 TuMV株系的分类第12-13页
        1.3.3 控制TuMV的传播第13页
        1.3.4 TuMV的基因组结构和基因功能第13-15页
        1.3.5 TuMV的致病决定因素第15-16页
    1.4 芸薹属植物中的抗TuMV基因及其它抗性基因第16-20页
        1.4.1 芸薹属植物中的抗TuMV基因第16-19页
        1.4.2 芸薹属植物中与抗病相关的QTL第19-20页
    1.5 植物对病毒的抗性反应第20-21页
    1.6 DNA Microarray在植物基因差异表达分析上的应用第21-22页
2.材料和方法第22-31页
    2.1 SSR标记筛选第22页
        2.1.1 EST序列来源第22页
        2.1.2 EST序列的片段重叠群分析第22页
        2.1.3 EST序列中SSR筛选第22页
        2.1.4 SSR分布区域的确定第22页
    2.2 大白菜抗芜菁花叶病毒EST-SSR标记的筛选第22-26页
        2.2.1 植物材料第22-23页
        2.2.2 基因组DNA的提取第23页
        2.2.3 引物设计第23-24页
        2.2.4 PCR扩增第24页
        2.2.5 变性聚丙烯酰氨凝胶电泳检测SSR多态性第24-26页
    2.3 高抗和高感芜菁花叶病毒大白菜基因表达差异分析第26-31页
        2.3.1 植物材料第26页
        2.3.2 接种病毒第26-27页
        2.3.3 酶联免疫法鉴定抗、感材料的抗病性第27-28页
        2.3.4 TE3D法提取植物总RNA第28-29页
        2.3.5 大白菜DNA微阵列第29页
        2.3.6 RNA样品的纯化、荧光标记及Microarray杂交第29-31页
3.结果与分析第31-41页
    3.1 EST-SSR分布情况第31-32页
    3.2 EST不同区域的SSR分布比较第32-33页
    3.3 大白菜EST-SSRs的多态性分析第33-34页
    3.4 抗、感品种的抗病性鉴定第34-35页
    3.5 高抗和高感芜菁花叶病毒大白菜基因表达差异分析第35-36页
    3.6 差异表达基因功能分类第36-38页
    3.7 与系统获得抗性反应相关的上调表达蛋白第38-41页
        3.7.1 与细胞防卫有关的上调表达蛋白第38-39页
        3.7.2 与信号转导有关的上调表达蛋白第39页
        3.7.3 与水杨酸、茉莉酸介导的信号转导途径有关的上调表达蛋白第39页
        3.7.4 上调表达的转录因子第39-41页
4.讨论第41-49页
    4.1 EST-SSR频率和分布第41-42页
    4.2 EST-SSR标记的开发第42-44页
    4.3 抗、感材料间的抗病性差异及遗传背景差异第44页
    4.4 差异基因表达聚类分析第44-45页
    4.5 系统获得抗性(SAR)的诱导第45-46页
    4.6 与病程相关蛋白第46页
    4.7 抗病信号传导途径第46-47页
    4.8 转录因子WRKY的功能第47-49页
参考文献第49-57页
致谢第57-58页
附录Ⅰ 在大白菜4份自交系材料中具有多态性的EST-SSR标记第58-60页
附录Ⅱ 大白菜高抗TuMV自交系中与防御相关的上调表达蛋白第60-61页

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