| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第10-23页 |
| 1.1 野生稻的基因组类型分布及利用 | 第10-13页 |
| 1.1.1 野生稻的基因组类型及分布 | 第10-11页 |
| 1.1.2 野生稻基因资源利用 | 第11-12页 |
| 1.1.3 普通野生稻功能基因的研究 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻干旱胁迫基因的研究进展 | 第13-20页 |
| 1.2.1 干旱胁迫下水稻基因的功能与表达 | 第14-15页 |
| 1.2.2 水稻转录因子编码基因干旱胁迫下的功能和表达 | 第15-17页 |
| 1.2.3 水稻中干旱胁迫响应蛋白激酶基因 | 第17-18页 |
| 1.2.4 水稻干旱胁迫下渗透保护剂基因的表达与功能 | 第18页 |
| 1.2.5 激素对水稻干旱应答基因的表达影响 | 第18-19页 |
| 1.2.6 水稻中干旱与冷、盐胁迫信号响应间的关系 | 第19-20页 |
| 1.3 水稻根系及干旱胁迫相关基因研究进展 | 第20-21页 |
| 1.3.1 水稻根系干旱相关基因的研究 | 第20页 |
| 1.3.2 水稻根特异表达基因研究 | 第20-21页 |
| 1.4 普通野生稻干旱相关基因研究进展 | 第21页 |
| 1.5 高通量测序技术 | 第21-22页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23-24页 |
| 2.1.2 转录组测序样品的处理及采样 | 第24页 |
| 2.1.3 普通野生稻不同干旱胁迫时段的处理 | 第24页 |
| 2.1.4 普通野生稻不同生长时期的不同组织取样 | 第24页 |
| 2.1.5 实验试剂及仪器 | 第24页 |
| 2.2 实验方法与步骤 | 第24-31页 |
| 2.2.1 普通野生稻转录组测序不同样品的RNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.2 RNA文库的构建、库检及测序 | 第25-26页 |
| 2.2.3 Illumina测序结果分析 | 第26-28页 |
| 2.2.4 差异基因的筛选及分析 | 第28页 |
| 2.2.5 qRT-PCR引物设计 | 第28-29页 |
| 2.2.6 Real-Time PCR检测验证及鉴定 | 第29页 |
| 2.2.7 引物合成 | 第29页 |
| 2.2.8 RT-PCR引物设计 | 第29-30页 |
| 2.2.9 RT-PCR检测 | 第30-31页 |
| 3 结果及分析 | 第31-52页 |
| 3.1 普通野生稻RNA文库的构建及转录组测序分析 | 第31-41页 |
| 3.1.1 普通野生稻总RNA提取 | 第31-32页 |
| 3.1.2 测序数据及转录组拼接质量分析 | 第32-33页 |
| 3.1.3 Unigene的分类和功能注释 | 第33-35页 |
| 3.1.4 Unigene GO和KOG功能注释 | 第35-38页 |
| 3.1.5 Unigene KEGG分类 | 第38页 |
| 3.1.6 EST-SSR标记 | 第38-39页 |
| 3.1.7 普通野生稻不同组织以及不同实验条件下的基因表达水平分析 | 第39-41页 |
| 3.2 普通野生稻组织特异性干旱相关差异基因分析及鉴定 | 第41-49页 |
| 3.2.1 差异表达基因的DEGs分析 | 第41-44页 |
| 3.2.2 库中差异表达基因Real-Time PCR验证 | 第44-48页 |
| 3.2.3 普通野生稻根特异表达干旱相关基因不同胁迫时段的表达检测 | 第48-49页 |
| 3.3 根特异表达基因分析及鉴定 | 第49-52页 |
| 3.3.1 根特异表达基因验证 | 第49-50页 |
| 3.3.2 不同时期普通野生稻根特异基因的表达鉴定 | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-55页 |
| 4.1 普通野生稻RNA文库的构建及转录组数据分析 | 第52-53页 |
| 4.2 普通野生稻组织特异性干旱相关基因表达分析及鉴定 | 第53-54页 |
| 4.3 根特异表达基因分析及鉴定 | 第54-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 缩写语表 | 第63-64页 |
| 附录 | 第64-70页 |
| 作者简介 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
