| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-34页 |
| 1. 引言 | 第9页 |
| 2. 生物钟调控网络的分子机制 | 第9-12页 |
| 2.1 哺乳动物中的生物钟分子机制 | 第9-10页 |
| 2.2 斑马鱼中的生物钟分子机制 | 第10-12页 |
| 3. 自噬的分子机制 | 第12-16页 |
| 3.1 小自噬 | 第13页 |
| 3.2 分子伴侣介导的自噬 | 第13-14页 |
| 3.3 大自噬 | 第14-16页 |
| 4. 自噬的生物钟调节 | 第16-20页 |
| 4.1 自噬基因的转录水平调节 | 第16-17页 |
| 4.2 生物钟和代谢共同输出自噬的节律信号 | 第17-20页 |
| 4.2.1 营养和能量平衡 | 第18页 |
| 4.2.2 蛋白质组学和细胞器修饰 | 第18-19页 |
| 4.2.3 组织代谢的时间划分 | 第19页 |
| 4.2.4 自噬节律有关的代谢疾病 | 第19-20页 |
| 5. 代谢与生物钟的关系 | 第20-22页 |
| 6. REV-ERBA在生物钟调控网络和代谢环路中的作用 | 第22-26页 |
| 6.1 Rev-erbα在生物钟调控网络中的作用 | 第24页 |
| 6.2 Rev-erbα在肝脏中的功能 | 第24-25页 |
| 6.3 Rev-erbα在脂肪组织中的作用 | 第25页 |
| 6.4 Rev-erbα在骨骼肌中的作用 | 第25-26页 |
| 6.5 Rev-erbα在胰腺和炎症中的作用 | 第26页 |
| 7. TALEN和CRISPR/CAS9技术简介 | 第26-32页 |
| 7.1 TALEN技术的来源及原理 | 第26-28页 |
| 7.2 CRISPR/Cas9技术的来源及原理 | 第28-29页 |
| 7.3 TALEN及CRISPR/Cas9技术的检测方法 | 第29-30页 |
| 7.4 TALEN和CRISPR/Cas9技术在生物钟研究上的应用 | 第30-32页 |
| 8. 主要研究内容和立题新意 | 第32-33页 |
| 9. 实验流程 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-53页 |
| 2.1 实验动物 | 第34页 |
| 2.2 所用实验试剂及来源 | 第34页 |
| 2.3 实验仪器及生产公司 | 第34-36页 |
| 2.4 常用溶液与试剂的配制方法 | 第36-37页 |
| 2.4.1 细菌培养基 | 第36页 |
| 2.4.2 原位杂交相关溶液 | 第36-37页 |
| 2.4.3 核酸电泳相关溶液 | 第37页 |
| 2.4.4 其他相关溶液 | 第37页 |
| 2.5 实验方法 | 第37-53页 |
| 2.5.1 斑马鱼交配与胚胎收集 | 第37页 |
| 2.5.2 斑马鱼基因组DNA提取 | 第37-38页 |
| 2.5.3 斑马鱼胚胎Total RNA提取 | 第38页 |
| 2.5.4 RNA反转录制备cDNA模板 | 第38-39页 |
| 2.5.5 引物设计与合成 | 第39-40页 |
| 2.5.6 原位杂交 | 第40-42页 |
| 2.5.7 荧光定量PCR | 第42-43页 |
| 2.5.8 PCR鉴定反应体系 | 第43页 |
| 2.5.9 酶切反应体系 | 第43-44页 |
| 2.5.10 DNA的回收处理 | 第44-45页 |
| 2.5.11 连接反应体系 | 第45页 |
| 2.5.12 连接产物或质粒转化感受态细胞 | 第45页 |
| 2.5.13 重组质粒的鉴定 | 第45页 |
| 2.5.14 重组质粒的提取 | 第45-46页 |
| 2.5.15 重组质粒双酶切鉴定 | 第46页 |
| 2.6.16 TALEN元件的组装及表达载体构建 | 第46-47页 |
| 2.5.17 体外合成Cap mRNA | 第47页 |
| 2.5.18 mRNA的回收 | 第47-48页 |
| 2.5.19 细胞培养 | 第48-49页 |
| 2.5.20 显微注射 | 第49页 |
| 2.5.21 Chip | 第49-51页 |
| 2.5.22 Western blot | 第51-53页 |
| 第三章 结果 | 第53-68页 |
| 3.1 用TALEN技术构建斑马鱼REV-ERBA突变体 | 第53-55页 |
| 3.2 斑马鱼自噬的研究 | 第55-57页 |
| 3.3 成年斑马鱼肝脏的自噬基因的节律性研究 | 第57-58页 |
| 3.4 斑马鱼REV-ERBA突变体中自噬节律性分析 | 第58-60页 |
| 3.5 斑马鱼PER1B突变体中自噬节律性分析 | 第60-61页 |
| 3.6 斑马鱼REV-ERBA突变体的行为分析 | 第61-62页 |
| 3.7 Rev-erbα对ulk1a的功能性研究 | 第62-64页 |
| 3.8 GSK4112对自噬的功能性研究 | 第64-65页 |
| 3.9 rev-erbα突变体异常行为的分析 | 第65-66页 |
| 3.10 Rev-erbα对自噬的调控模式图 | 第66-68页 |
| 第四章 博士期间参与的其他研究 | 第68-76页 |
| 1、用TALEN技术构建斑马鱼CRY2突变体 | 第68-69页 |
| 2、斑马鱼一号染色体敲除计划 | 第69-72页 |
| 3、CARS2对斑马鱼GNRH信号迁移的影响 | 第72-76页 |
| 第五章 讨论 | 第76-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 缩略词 | 第91-92页 |
| 博士期间已发表及待发表的文章 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
