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枣基因组SSR位点特征分析及引物开发

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
英文缩写表第8-11页
1 引言第11-19页
    1.1 SSR 序列分布特征第11-12页
    1.2 SSR 的进化机制第12-13页
    1.3 SSR 位点的生物学功能第13-14页
    1.4 常见的分子标记比较第14-15页
    1.5 SSR 标记在果树遗传育种上的应用第15-18页
        1.5.1 遗传多样性分析第15-16页
        1.5.2 遗传图谱的构建第16-17页
        1.5.3 分子标记辅助育种第17页
        1.5.4 SSR 引物的通用性第17-18页
    1.6 本试验研究目的意义第18-19页
2 材料与方法第19-26页
    2.1 试验材料第19-20页
        2.1.1 高效率 SSR 引物筛选第19页
        2.1.2 高效率 SSR 引物的多态性验证第19-20页
        2.1.3 高效率 SSR 引物的通用性验证第20页
    2.2 枣 SSR 引物的设计第20-21页
        2.2.1 基于枣基因组数据的 SSR 位点搜索第20-21页
        2.2.2 SSR 引物设计第21页
    2.3 主要仪器及试剂第21页
    2.4 试验方法第21-24页
        2.4.1 组织 DNA 提取(改良 CTAB 法)第21-22页
        2.4.2 PCR 反应体系及程序第22页
        2.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳与银染显色技术第22-23页
        2.4.4 差异片段的回收及纯化测序第23-24页
    2.5 数据分析第24-26页
3 结果与分析第26-47页
    3.1 枣基因组的 SSR 位点分析第26-31页
        3.1.1 枣基因组 SSR 位点出现频率和密度第26-27页
        3.1.2 枣基因组中 SSR 位点的优势重复基元类型分析第27-29页
        3.1.3 枣的 SSR 位点长度多态性预测第29-31页
    3.2 枣与其他植物基因组中 SSR 位点的比较分析第31-35页
        3.2.1 不同植物基因组中 SSR 位点分布频率和密度比较第31-32页
        3.2.2 枣和其他近缘物种基因组中 SSR 位点优势基元的比较第32-35页
    3.3 枣基因组 SSR 引物设计及筛选第35-36页
        3.3.1 批量 SSR 引物的设计第35页
        3.3.2 SSR 引物的分布信息统计第35-36页
    3.4 多态性 SSR 引物的筛选第36-37页
    3.5 20 个枣品种的 SSR 分析第37-40页
        3.5.1 20 个枣品种基因组 DNA 的质量检测第37-38页
        3.5.2 20 个枣品种的 SSR 分析第38-40页
        3.5.3 20 个枣品种的聚类分析第40页
    3.6 枣 SSR 引物在不同科属植物间的通用性第40-47页
        3.6.1 不同植物基因组 DNA 的质量检测第40-41页
        3.6.2 15 种植物的 SSR 分析第41-46页
        3.6.3 15 种植物的聚类分析第46-47页
4 讨论第47-50页
    4.1 枣基因组 SSR 位点的进化分析第47页
    4.2 枣基因组 SSR 位点的特征第47-48页
    4.3 SSR 位点多态性预测研究第48页
    4.4 SSR 引物扩增效率的比较第48-49页
    4.5 枣 SSR 引物在不同品种间的多态性第49页
    4.6 枣 SSR 引物在不同植物间的通用性研究第49-50页
5 结论第50-51页
参考文献第51-58页
在读期间发表论文第58-59页
作者简历及在学成果第59-60页
致谢第60-61页

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