| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 前言 | 第10-26页 |
| 1.1 乳酸概述 | 第10-12页 |
| 1.1.1 乳酸的性质和生产 | 第10页 |
| 1.1.2 乳酸及其衍生物的应用 | 第10-12页 |
| 1.2 凝结芽孢杆菌概述 | 第12-14页 |
| 1.2.1 凝结芽孢杆菌特点及应用 | 第12-13页 |
| 1.2.2 凝结芽孢杆菌研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3 全基因组代谢网络模型 | 第14-24页 |
| 1.3.1 全基因组代谢网络模型概述 | 第14-15页 |
| 1.3.2 全基因组代谢网络模型应用 | 第15-17页 |
| 1.3.3 全基因代谢网络模型构建流程 | 第17-20页 |
| 1.3.4 全基因组代谢模型构建工具介绍 | 第20-21页 |
| 1.3.5 中等规模代谢网络模型概述 | 第21-22页 |
| 1.3.6 通量平衡分析 | 第22-24页 |
| 1.4 课题内容及意义 | 第24-26页 |
| 第2章 材料和方法 | 第26-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-29页 |
| 2.1.1 菌种 | 第26页 |
| 2.1.2 实验仪器及设备 | 第26-27页 |
| 2.1.3 实验试剂及材料 | 第27-28页 |
| 2.1.4 培养基 | 第28-29页 |
| 2.2 培养和测定方法 | 第29-30页 |
| 2.2.1 菌体培养条件 | 第29-30页 |
| 2.2.2 葡萄糖和乳酸浓度测定 | 第30页 |
| 2.2.3 菌体干重测定 | 第30页 |
| 2.2.4 氨基酸含量测定 | 第30页 |
| 2.3 生物量组成测定 | 第30-32页 |
| 2.3.1 菌体蛋白质及氨基酸测定 | 第30页 |
| 2.3.2 菌体总RNA含量测定 | 第30-31页 |
| 2.3.3 菌体中DNA含量测定 | 第31页 |
| 2.3.4 菌体总脂质测定 | 第31-32页 |
| 2.3.5 菌体总糖含量测定 | 第32页 |
| 2.4 全基因代谢网络模型构建流程 | 第32-39页 |
| 2.4.1 中等规模代谢网络模型构建 | 第32-33页 |
| 2.4.2 全基因组代谢网络草图构建 | 第33页 |
| 2.4.3 全基因组代谢网络草图的修正 | 第33-37页 |
| 2.4.4 全基因组代谢网络模型的验证 | 第37页 |
| 2.4.5 全基因组代谢网络模型转化为数学模型 | 第37-38页 |
| 2.4.6 全基因组代谢网络模型模拟预测 | 第38-39页 |
| 第3章 凝结芽孢杆菌生物量组分测定 | 第39-51页 |
| 3.1 引言 | 第39页 |
| 3.2 菌体蛋白质及氨基酸测定 | 第39-41页 |
| 3.2.1 菌体蛋白质测定 | 第39-40页 |
| 3.2.2 菌体蛋白中氨基酸测定 | 第40-41页 |
| 3.3 菌体多糖及单糖测定 | 第41-43页 |
| 3.3.1 菌体多糖测定 | 第41-42页 |
| 3.3.2 菌体多糖中单糖测定 | 第42-43页 |
| 3.4 菌体脂质及硬脂酸测定 | 第43-44页 |
| 3.4.1 菌体脂质测定 | 第44页 |
| 3.4.2 菌体脂质中成分测定 | 第44页 |
| 3.5 菌体DNA及dNTP测定 | 第44-46页 |
| 3.5.1 菌体总DNA测定 | 第44-45页 |
| 3.5.2 菌体中脱氧核糖核苷酸含量计算 | 第45-46页 |
| 3.6 菌体RNA及NTP测定 | 第46页 |
| 3.6.1 菌体总RNA测定结果 | 第46页 |
| 3.6.2 菌体中核糖核苷酸含量计算 | 第46页 |
| 3.7 Biomass合成方程式 | 第46-50页 |
| 3.8 本章小结 | 第50-51页 |
| 第4章 全基因组代谢网络模型构建 | 第51-59页 |
| 4.1 引言 | 第51-52页 |
| 4.2 中等规模代谢网络模型 | 第52页 |
| 4.3 全基因组代谢网络模型构建 | 第52-54页 |
| 4.3.1 B.coagulans 36D1全基因组序列信息 | 第53页 |
| 4.3.2 代谢网络草图信息 | 第53-54页 |
| 4.4 代谢网络模型修正 | 第54-56页 |
| 4.4.1 代谢物信息修正 | 第54页 |
| 4.4.2 代谢反应修正 | 第54-56页 |
| 4.4.3 基因信息修正 | 第56页 |
| 4.5 代谢网络模型转化 | 第56-57页 |
| 4.6 本章小结 | 第57-59页 |
| 第5章 代谢网络模型验证及模拟 | 第59-79页 |
| 5.1 引言 | 第59-60页 |
| 5.2 中等规模代谢网络模型指导合成培养基优化 | 第60-63页 |
| 5.2.1 缺失预测和湿实验验证 | 第61-62页 |
| 5.2.2 添加预测和湿实验验证 | 第62-63页 |
| 5.2.3 36D1和P4-102B菌株验证 | 第63页 |
| 5.3 凝结芽孢杆菌代谢通路考察 | 第63-70页 |
| 5.3.1 氨基酸代谢通路考察结果 | 第64-67页 |
| 5.3.2 糖类代谢通路考察结果 | 第67-68页 |
| 5.3.3 模型预测氨基酸和葡萄糖代谢通路 | 第68-70页 |
| 5.4 合成培养基批发酵 | 第70-72页 |
| 5.5 不同稀释速率下恒化培养及模拟 | 第72-76页 |
| 5.5.1 不同稀释速率下恒化培养 | 第72-75页 |
| 5.5.2 全基因组代谢网络模型预测比生长速率 | 第75-76页 |
| 5.6 不同pH条件下恒化培养 | 第76-78页 |
| 5.7 本章小结 | 第78-79页 |
| 第6章 结论和展望 | 第79-81页 |
| 6.1 结论 | 第79-80页 |
| 6.2 展望 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 附录一 | 第87-89页 |