基于OpenMP的启动子数据分析系统的设计与实现
| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 课题的研究背景、目的及意义 | 第10-11页 |
| 1.2 课题的研究现状及发展趋势 | 第11-13页 |
| 1.3 课题的应用前景及学术价值 | 第13-14页 |
| 1.4 相关技术 | 第14-19页 |
| 1.4.1 多核 | 第14-15页 |
| 1.4.2 OpenMP技术 | 第15-19页 |
| 1.5 本文研究内容 | 第19-20页 |
| 1.6 本章小结 | 第20-21页 |
| 第2章 系统的总体设计 | 第21-30页 |
| 2.1 系统的需求分析 | 第21-24页 |
| 2.2 系统的流程设计 | 第24-25页 |
| 2.3 系统的模块设计 | 第25-28页 |
| 2.3.1 定位模块的设计 | 第26-27页 |
| 2.3.2 过滤的模块设计 | 第27页 |
| 2.3.3 共享分析及基因本体论分析的模块设计 | 第27-28页 |
| 2.4 系统开发的硬件配置信息 | 第28-29页 |
| 2.5 本章小节 | 第29-30页 |
| 第3章 Motif定位 | 第30-44页 |
| 3.1 Motif定位算法的设计 | 第30-35页 |
| 3.2 Motif定位算法的实现 | 第35-38页 |
| 3.3 Motif定位的并行算法设计 | 第38-39页 |
| 3.4 Motif定位的并行算法实现 | 第39-41页 |
| 3.5 串/并行算法的时间对比 | 第41-43页 |
| 3.6 本章小节 | 第43-44页 |
| 第4章 频繁调控元件过滤 | 第44-62页 |
| 4.1 对Motif的百分比值进行求解 | 第44-47页 |
| 4.1.1 打乱算法的设计 | 第44-45页 |
| 4.1.2 打乱算法的实现 | 第45-47页 |
| 4.1.3 串/并行算法的执行时间对比 | 第47页 |
| 4.2 过滤频繁控制元件 | 第47-55页 |
| 4.2.1 并行算法描述 | 第52-54页 |
| 4.2.2 串/并行算法的实验结果对比 | 第54-55页 |
| 4.3 计算过程中的优化 | 第55-58页 |
| 4.3.1 素数拆分算法的原理 | 第55-57页 |
| 4.3.2 拆分算法在本章中的应用 | 第57-58页 |
| 4.3.3 优化后的结果分析 | 第58页 |
| 4.4 共享处理 | 第58-61页 |
| 4.5 本章小结 | 第61-62页 |
| 第5章 系统实现及应用 | 第62-68页 |
| 5.1 启动子数据分析系统的实现 | 第62-64页 |
| 5.2 系统应用 | 第64-67页 |
| 5.2.1 基因本体论 | 第65页 |
| 5.2.2 基因功能注释 | 第65-67页 |
| 5.3 本章小结 | 第67-68页 |
| 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-73页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文及参加的科研项目 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74页 |
