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甘薯冷诱导转录组测序及转录因子SwDREB1B在抗冷调节中的作用

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
1 文献综述第9-19页
   ·甘薯在贮藏期间的冷害研究第9-10页
     ·甘薯冷害生理代谢变化研究第9-10页
     ·甘薯冷害防治的研究第10页
   ·转录组测序技术(RNA-seq)及其在动植物转录组测序中的应用第10-14页
     ·RNA-seq技术的分析平台和技术原理第10-12页
     ·RNA-seq技术的优点第12页
     ·RNA-seq技术在基因差异表达中的应用第12-14页
   ·DREB/CBF转录因子研究进展第14-18页
     ·DREB转录因子家族第15页
     ·DREB1/CBF转录因子结构特点第15-16页
     ·DREB1/CBF转录因子的表达调控第16-17页
     ·DREB/CBF转录因子在植物抗逆基因工程中的应用第17-18页
   ·本研究目的与意义第18-19页
2 转录组测序及生物信息学分析第19-32页
   ·试验材料与处理第19页
   ·试剂与仪器设备第19页
     ·RNA-seq测序试剂(盒)第19页
     ·仪器设备第19页
   ·试验方法第19-23页
     ·甘薯总RNA的提取及检测第19-20页
     ·RNA文库构建及转录组测序第20-21页
     ·测序结果生物信息学整理分析第21-23页
   ·结果与分析第23-29页
     ·RNA提取质量分析第23页
     ·转录组测序整体质量评估第23-24页
     ·组装结果统计第24-25页
     ·差异表达基因筛选第25-26页
     ·基因功能注释第26-29页
   ·甘薯低温胁迫下糖代谢途径相关基因第29-30页
   ·讨论第30-32页
3 甘薯转录因子SwDREB克隆及结构分析第32-48页
   ·试验材料与处理第32-33页
     ·植物材料第32页
     ·试剂与试剂盒第32页
     ·载体和菌株第32页
     ·缓冲液第32-33页
     ·培养基第33页
     ·主要仪器设备第33页
   ·试验方法第33-37页
     ·甘薯DNA提取(改良CTAB法)第33页
     ·甘薯RNA提取第33页
     ·cDNA第一链合成第33-34页
     ·引物设计与合成第34页
     ·PCR扩增第34-35页
     ·PCR产物回收第35-36页
     ·DNA片段的连接转化和培养第36页
     ·菌液PCR鉴定第36页
     ·甘薯DREB基因生物信息学分析第36-37页
   ·结果与分析第37-46页
     ·甘薯中SwDREB基因克隆和序列分析第37-41页
     ·SwDREB1B和SwDREB2蛋白一级结构分析第41-44页
     ·SwDREB1B和SwDREB2蛋白二级结构预测第44-46页
   ·讨论第46-48页
4 甘薯转录因子SwDREB1B的表达分析及抗冷特性研究第48-65页
   ·材料第48页
     ·材料处理第48页
   ·试验方法第48-55页
     ·甘薯不同组织RNA提取及反转第48页
     ·甘薯不同基因的相对荧光定量表达分析第48-49页
     ·丙二醛(MDA)测定第49-50页
     ·抗氧化酶活性测定第50-52页
     ·β-淀粉酶活性测定第52-55页
     ·数据分析第55页
   ·结果与分析第55-62页
   ·讨论第62-65页
5 结论第65-66页
参考文献第66-75页
在读期间的学术研究第75-76页
致谢第76页

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