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甜高粱茎秆糖积累期microRNA及基因表达谱分析

摘要第1-12页
Abstract第12-14页
第一章 文献综述第14-32页
   ·甜高粱的研究进展第14-16页
     ·甜高粱概述第14页
     ·甜高粱糖积累的生理机理第14-15页
     ·高粱糖含量的QTL研究第15-16页
   ·糖代谢研究进展第16-19页
     ·蔗糖的合成第16-17页
     ·蔗糖的转运第17-18页
     ·蔗糖的降解第18-19页
   ·淀粉的代谢第19-22页
   ·植物microRNA的研究进展第22-27页
     ·microRNA的概念及特征第22-23页
     ·miRNA的发现第23页
     ·植物miRNA的产生过程第23-24页
     ·miRNA的功能第24-26页
     ·miRNA的作用机制第26页
     ·植物miRNA的检测方法第26-27页
   ·数字化表达谱的研究进展第27-28页
     ·数字基因表达谱第27页
     ·数字基因表达谱的优越性第27-28页
     ·数字基因表达谱的应用第28页
   ·测序技术的研究进展第28-30页
     ·第一代测序技术第28页
     ·第二代测序技术第28-29页
     ·第三代测序技术第29-30页
     ·测序技术在高粱和甘蔗的应用第30页
   ·本研究的目的和意义第30-32页
第二章 甜高粱茎秆糖积累期基因表达谱分析第32-75页
   ·材料与方法第32-44页
     ·试验材料第32页
     ·主要试剂第32-33页
     ·其它试剂的配置第33页
     ·仪器设备第33页
     ·数据库及生物软件第33-34页
     ·基因表达谱测序和引物合成第34页
     ·试验方法第34-44页
   ·结果与分析第44-73页
     ·高粱糖分积累第44-45页
     ·高粱叶片和茎秆总RNA的提取第45-46页
     ·测序质量的评估第46-52页
     ·基因表达第52-54页
     ·差异表达基因的GO功能富集分析第54-57页
     ·差异表达基因代谢途径(Pathway)分析第57-62页
     ·高粱茎秆糖积累过程中与糖代谢及转运蛋白相关基因分析第62-67页
     ·高粱茎秆糖积累过程中与淀粉代谢及转运蛋白相关基因的表达情况第67-69页
     ·进一步分析36个差异表达基因第69-71页
     ·荧光定量PCR验证数字基因表达谱的准确性第71-73页
   ·结论与讨论第73-75页
第三章 甜高粱茎秆糖积累有关的microRNA第75-105页
   ·材料与方法第75-83页
     ·试验材料第75页
     ·主要试剂第75页
     ·其它试剂的配置第75页
     ·仪器设备第75页
     ·数据库及生物软件第75-76页
     ·引物合成和microRNA测序第76页
     ·试验方法第76-83页
   ·结果与分析第83-102页
     ·高粱小RNA序列的基本情况第83-86页
     ·鉴定known miRNA和novel miRNA第86-88页
     ·与糖积累有关的差异表达的miRNA第88-91页
     ·MiRNA靶基因预测第91-92页
     ·未知miRNA表达模式分析第92页
     ·靶基因的功能分析第92-100页
     ·利用stem-loop RT-qPCR验证高粱miRNA第100-102页
   ·结论与讨论第102-105页
参考文献第105-114页
附录第114-119页
攻读学位论文期间发表论文第119-120页
致谢第120-121页
论文图表统计第121页

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