| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 文献综述：生物高通量检测数据的解析 | 第11-25页 |
| 1 用基因表达谱数据挖掘关键基因的方法 | 第11-21页 |
| ·基因表达变化的检测 | 第11-12页 |
| ·基因表达变化数据的分析 | 第12-20页 |
| ·基因表达变化数据的应用 | 第20-21页 |
| 2 用蛋白表达谱数据挖掘关键蛋白的方法 | 第21-24页 |
| ·蛋白表达变化的检测 | 第21-22页 |
| ·蛋白表达变化数据的分析 | 第22-23页 |
| ·蛋白表达变化数据的应用 | 第23-24页 |
| 3 用生物高通量检测数据挖掘关键基因/蛋白的困难和问题 | 第24页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第24页 |
| 5 研究方案和目标 | 第24-25页 |
| 第二章 用整合统计学方法挖掘大鼠肝再生关键基因 | 第25-33页 |
| 1 引言 | 第25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-27页 |
| ·大鼠肝再生模型的建立 | 第25-26页 |
| ·大鼠再生肝的肝细胞分离 | 第26页 |
| ·肝细胞基因表达变化的芯片检测和数据获得 | 第26页 |
| ·大鼠肝细胞中肝再生共有基因和特有基因的确认 | 第26页 |
| ·过滤法的 12 种算法 | 第26-27页 |
| ·整合统计学方法 | 第27页 |
| ·大鼠肝再生中肝细胞特征基因的确认 | 第27页 |
| ·大鼠肝再生中肝细胞特征基因参与的生理活动确认 | 第27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-31页 |
| ·用滤波法的 12 种算法计算的大鼠肝细胞的肝再生差异基因 | 第27-28页 |
| ·用整合统计学方法筛选和提炼的大鼠肝细胞的肝再生特征基因 | 第28-29页 |
| ·大鼠肝细胞的肝再生特征基因的可靠性 | 第29-31页 |
| 4 讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 用包装法挖掘大鼠肝再生关键基因 | 第33-41页 |
| 1 引言 | 第33-34页 |
| 2 材料与方法 | 第34-35页 |
| ·上文述及的方法 | 第34页 |
| ·特征基因的预选 | 第34页 |
| ·序列向前算法(SFS) | 第34页 |
| ·遗传算法(GA) | 第34-35页 |
| ·分类器的选择和应用 | 第35页 |
| ·基因的生物学意义确认 | 第35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-39页 |
| ·序列向前算法(SFS)分析结果 | 第35-36页 |
| ·遗传算法(GA)分析结果 | 第36-38页 |
| ·关键基因的可靠性 | 第38-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 用贝叶斯网络的原理和方法构建大鼠肝再生关键基因的调控网络 | 第41-51页 |
| 1 引言 | 第41-42页 |
| 2 材料和方法 | 第42-44页 |
| ·上文述及的方法 | 第42页 |
| ·用贝叶斯网络理论和方法构建基因调控网络 | 第42-43页 |
| ·已知基因的互作网络查找 | 第43页 |
| ·贝叶斯网络与已知基因互作网络的比较 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-49页 |
| ·用静态贝叶斯网络分析大鼠肝再生中肝再生相关基因的关联和作用 | 第44页 |
| ·用动态贝叶斯网络分析大鼠肝再生中肝再生相关基因的关联和作用 | 第44-45页 |
| ·贝叶斯网络与已知基因互作网络的相关性 | 第45-47页 |
| ·关键基因在网络中的作用 | 第47页 |
| ·关键基因在肝再生启动和终止阶段的作用 | 第47-49页 |
| 4 讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 总结与结论 | 第57-61页 |
| 1 总结 | 第57-59页 |
| 2 结论 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61-63页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目和发表论文 | 第63-64页 |
