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冬虫夏草菌子实体发育起始阶段cDNA文库的构建及ESTs分析

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
目录第8-11页
1. 绪论第11-29页
   ·冬虫夏草研究进展第11-19页
     ·冬虫夏草的分类地位第11-12页
     ·冬虫夏草资源分布第12页
     ·冬虫夏草的形态特征第12-13页
     ·冬虫夏草寄主特征与研究第13-15页
     ·冬虫夏草的化学成分及药用价值第15-17页
     ·冬虫夏草菌的研究概况第17-19页
   ·食用菌子实体发育的研究第19-24页
     ·环境因子对食用菌子实体分化发育的影响第19-21页
     ·有益微生物的影响第21页
     ·食用菌发育过程的酶学研究第21-22页
     ·子实体分化发育相关基因研究第22页
     ·冬虫夏草人工培育及冬虫夏草菌子实体人工培育研究概况第22-24页
   ·EST 技术及其应用第24-27页
     ·EST 技术的原理及方法第24-25页
     ·EST 数据库与生物信息学第25-26页
     ·EST 技术的应用第26-27页
   ·本研究的目的和意义第27-29页
2.材料与方法第29-45页
   ·材料第29-32页
     ·实验材料第29页
     ·实验仪器第29页
     ·实验药品第29-31页
     ·溶液的配制第31-32页
     ·培养基的配制第32页
     ·数据分析用到的数据库第32页
   ·实验方法第32-33页
     ·冬虫夏草菌的分离及培养第32-33页
     ·冬虫夏草菌子实体的培养第33页
   ·冬虫夏草菌子实体总 RNA 及 mRNA 的提取分离第33-36页
     ·总 RNA 的提取第33-34页
     ·总 RNA 的检测第34-35页
     ·mRNA 的分离第35-36页
   ·PUC19 载体的改造第36页
   ·cDNA 文库构建第36-41页
     ·cDNA 第一链合成第36页
     ·LD PCR第36-37页
     ·蛋白酶 K 消化第37-38页
     ·Sfi I 消化第38页
     ·酶切 cDNA 纯化第38页
     ·cDNA 与 PUC19 载体连接第38-39页
     ·质粒的转化第39页
     ·克隆鉴定第39-40页
     ·cDNA 文库的扩增第40页
     ·培养第40-41页
     ·模板制备第41页
     ·测序第41页
   ·EST 数据深度分析第41-42页
     ·EST 序列前处理与拼接第41页
     ·基因注释第41页
     ·ORF 与蛋白功能预测分析第41-42页
     ·Gene Ontology(GO) 分析第42页
     ·代谢通路(pathway) 分析第42页
   ·未知基因的分析第42-43页
   ·VeA 基因全长克隆及序列分析第43-45页
     ·RNA 提取第43页
     ·扩增 VeA 基因 cDNA 全长(RACE 法)第43页
     ·引物设计第43页
     ·扩增及检测第43-44页
     ·总基因组中 VeA 基因的克隆第44-45页
3. 结果与分析第45-70页
   ·菌种的分离纯化第45页
   ·子实体的人工培养第45-46页
   ·RNA 的检测第46-48页
     ·紫外分光光度法检测结果第46页
     ·电泳法检测 RNA第46-47页
     ·核酸分析仪分析结果第47-48页
   ·载体改造结果第48-49页
   ·cDNA 合成检测第49页
   ·计算菌落数及重组率第49-50页
   ·文库检测第50页
   ·EST 样本评价第50-51页
   ·EST 序列前处理与拼接第51-52页
   ·基因注释第52-55页
   ·开放阅读框(ORF)和蛋白质功能的预测第55-57页
   ·Gene Ontology(GO) 分析第57-60页
   ·代谢通路(pathway) 分析第60-64页
   ·子实体发育起始前后基因对比第64-66页
   ·未知基因的预测分析第66-68页
   ·VeA 基因扩增结果第68-70页
     ·VeA 基因 cDNA 末端的扩增第68-69页
     ·总基因组中 VeA 基因的克隆第69-70页
4. 讨论第70-72页
   ·子实体发育启动前后氧自由基清除酶类含量与药用价值的关系第70页
   ·二元组氨酸激酶 Le.Nikl第70页
   ·HSP70 基因与真菌子实体发育的关系第70页
   ·VeA 基因功能第70-71页
   ·生物信息学分析的局限性第71-72页
5.结论第72-73页
致谢第73-74页
攻读硕士期间取得的研究成果第74-75页
参考文献第75-82页
附录一: pUC 19 sfi sequence第82-83页
附录二:1 号文库 ORF第83-89页
附录三:2 号文库 ORF第89-93页
附录四 KGGE 分析部分结果第93-98页

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