| 内容提要 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-24页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·研究背景和现状 | 第15-21页 |
| ·生物信息学 | 第15页 |
| ·基因表达数据分析研究进展 | 第15-20页 |
| ·基因表达数据分析尚存问题 | 第20页 |
| ·蛋白质网络中的子网识别研究进展 | 第20-21页 |
| ·本文工作 | 第21-24页 |
| ·研究路线和方法 | 第21-22页 |
| ·主要研究内容和研究结果 | 第22-24页 |
| 第2章 基因表达数据分析方法及蛋白质复合物识别 | 第24-44页 |
| ·引言 | 第24页 |
| ·DNA 微阵列技术 | 第24-27页 |
| ·cDNA 微阵列 | 第24-26页 |
| ·寡核苷酸芯片 | 第26-27页 |
| ·基因表达数据分析方法 | 第27-35页 |
| ·数据预处理 | 第27-29页 |
| ·差异表达基因分析 | 第29-32页 |
| ·基因聚类分析 | 第32-33页 |
| ·基因功能富集分析 | 第33-35页 |
| ·蛋白质相互作用子网识别方法 | 第35-36页 |
| ·基因注释数据库 | 第36-41页 |
| ·基因本体数据库 | 第37-39页 |
| ·KEGG 代谢通路数据库 | 第39-41页 |
| ·基因表达数据分析软件及网络资源 | 第41-43页 |
| ·基因表达数据网络资源 | 第41-42页 |
| ·基因表达数据分析软件 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第3章 基因表达数据分析工作流 | 第44-54页 |
| ·引言 | 第44页 |
| ·方法设计 | 第44-47页 |
| ·数据预处理 | 第44-45页 |
| ·差异表达基因识别 | 第45-47页 |
| ·基因聚类 | 第47页 |
| ·基因功能富集分析 | 第47页 |
| ·实验与分析 | 第47-52页 |
| ·模拟数据实验与分析 | 第48-49页 |
| ·乳腺癌数据实验与分析 | 第49-51页 |
| ·拟南芥数据实验与分析 | 第51-52页 |
| ·本章小结 | 第52-54页 |
| 第4章 基因表达谱模拟数据生成算法 | 第54-60页 |
| ·引言 | 第54页 |
| ·基于 K-MEDOIDS 的基因表达谱模拟数据生成算法设计 | 第54-56页 |
| ·概念定义 | 第54-55页 |
| ·算法设计 | 第55-56页 |
| ·实验与分析 | 第56-59页 |
| ·原始数据与模拟数据对比分析 | 第56-58页 |
| ·差异表达基因算法检测分析 | 第58-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 第5章 一种简单高效的差异表达基因识别算法 MRP | 第60-68页 |
| ·引言 | 第60页 |
| ·MRP 算法设计 | 第60-62页 |
| ·实验与数据分析 | 第62-67页 |
| ·模拟数据实验分析 | 第62-63页 |
| ·小鼠数据实验分析 | 第63-64页 |
| ·拟南芥数据实验分析 | 第64-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第6章 基于元分析的差异表达基因算法 RSDM | 第68-82页 |
| ·引言 | 第68页 |
| ·RSDM 算法设计 | 第68-70页 |
| ·软件系统设计 | 第70-75页 |
| ·系统流程 | 第70-71页 |
| ·功能分析 | 第71-73页 |
| ·系统运行 | 第73-75页 |
| ·实验与数据分析 | 第75-80页 |
| ·模拟数据实验分析 | 第75-78页 |
| ·肺癌数据实验分析 | 第78-79页 |
| ·拟南芥数据实验分析 | 第79-80页 |
| ·本章小结 | 第80-82页 |
| 第7章 PPI 网络中基于基因表达谱的子网模块识别算法 | 第82-90页 |
| ·引言 | 第82页 |
| ·蛋白质网络中基于基因表达谱的子网模块识别算法设计 | 第82-85页 |
| ·实验与分析 | 第85-89页 |
| ·肺癌数据分析 | 第85-87页 |
| ·GO 富集分析 | 第87-88页 |
| ·KEGG Pathway 富集分析 | 第88-89页 |
| ·本章小结 | 第89-90页 |
| 第8章 总结与展望 | 第90-92页 |
| ·本文工作总结 | 第90-91页 |
| ·展望 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-108页 |
| 作者简介及科研成果 | 第108-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
