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南方水稻黑条矮缩病毒湖南分离物全基因组及分子检测

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
第一章 前言第10-22页
   ·水稻南方黑条矮缩病研究进展第10-12页
     ·水稻南方黑条矮缩病的发病情况第10-11页
     ·水稻南方黑条矮缩病的症状第11页
     ·水稻南方黑条矮缩病的病原第11-12页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒研究进展第12-18页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的自然寄主第12-13页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的传毒介体第13-14页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的粒子形态及细胞病理学第14页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的基因组序列第14-18页
       ·南方水稻黑条矮缩病毒的基因组序列整体分析第14-17页
       ·南方水稻黑条矮缩病毒的基因组序列特殊结构分析第17-18页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒的检测技术第18-21页
     ·血清学检测方法第18-19页
     ·分子生物学检测方法第19-21页
   ·研究的目的与意义第21-22页
第二章 南方水稻黑条矮缩病毒湖南株系基因组序列分析第22-40页
   ·材料、试剂及仪器第22页
     ·样品及供试植物第22页
     ·试剂第22页
     ·仪器第22页
   ·实验方法第22-31页
     ·溶液及培养基的配制第22-23页
     ·引物的设计与合成第23-25页
     ·病毒基因组dsRNA的提取第25-26页
     ·病毒基因组dsRNA的电泳图谱第26页
     ·病毒基因组全序列测定第26-31页
       ·在序列的3’端加上接头第26-27页
       ·加接头的模板末端补平第27页
       ·反转录和cDNA的合成第27页
       ·PCR扩增第27-28页
       ·RT-PCR扩增产物琼脂糖电泳检测第28页
       ·RT-PCR扩增产物回收及纯化第28页
       ·纯化产物的克隆第28-30页
       ·重组质粒PCR验证第30页
       ·序列测定第30页
       ·序列分析第30-31页
   ·结果与分析第31-40页
     ·病毒基因组的电泳图谱第31-32页
     ·核甘酸、氨基酸序列分析第32-34页
     ·核苷酸、氨基酸同一率分析第34页
     ·系统进化树分析第34-37页
     ·HuNyy SRBSDV基因组S6序列分析第37页
     ·HuNyy SRBSDV基因组S10序列分析第37-40页
       ·S10编码蛋白的motif分析第37-38页
       ·S10序列糖基化位点、磷酸化位点及B细胞抗原表位及N端豆蔻酰基化位点的预测第38-40页
第三章 南方水稻黑条矮缩病毒的检测技术第40-46页
   ·材料、试剂及仪器第40页
     ·样品及供试植物第40页
     ·试剂第40页
     ·仪器第40页
   ·实验方法第40-44页
     ·培养基及溶液的配置第40页
     ·引物的设计与合成第40页
     ·植株总RNA提取第40-41页
     ·SRBSDV的巢式RT-PCR检测第41-42页
       ·SRBSDV的巢式RT-PCR反应第41-42页
       ·SRBSDV的巢式RT-PCR扩增产物琼脂糖电泳检测第42页
     ·SRBSDV的RT-PCR检测第42-43页
       ·cDNA的合成第42页
       ·PCR扩增第42-43页
       ·RT-PCR扩增产物琼脂糖电泳检测第43页
     ·RT-PCR扩增产物回收及纯化第43页
     ·纯化产物的克隆第43页
     ·重组质粒PCR验证第43页
     ·序列测定第43页
     ·序列比对和系统进化树的构建第43-44页
   ·结果与分析第44-46页
     ·SRBSDV的巢式RT-PCR检测第44页
     ·SRBSDV的RT-PCR检测第44-45页
     ·序列比对和系统进化树的构建第45-46页
第四章 南方水稻黑条矮缩病毒的检测技术的应用第46-57页
   ·材料、试剂及仪器第46-47页
     ·样品及供试植物第46-47页
     ·试剂第47页
     ·仪器第47页
   ·实验方法第47-50页
     ·培养基及溶液的配置第47-48页
     ·引物的设计与合成第48页
     ·水稻南方黑条矮缩病的症状研究第48-49页
       ·初步诊断第48页
       ·SRBSDV、RBSDV、RRSV的RT-PCR检测第48页
       ·霜霉病的检测第48-49页
       ·其他畸形症状的诊断第49页
       ·症状类型第49页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的自然寄主研究第49-50页
       ·玉米、高梁以及杂草的SRBSDV的RT-PCR检测第49页
       ·序列比对和系统进化树的构建第49页
       ·SRBSDV自然寄主种类确定第49-50页
   ·结果与分析第50-57页
     ·水稻南方黑条矮缩病的症状研究第50-55页
       ·SRBSDV、RBSDV、RRSV的RT-PCR检测第50-51页
       ·霜霉病检测第51-52页
       ·症状类型第52-55页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的自然寄主研究第55-57页
       ·玉米、高梁以及杂草的SRBSDV的RT-PCR检测第55-56页
       ·序列比对和系统进化树的构建第56页
       ·SRBSDV的自然寄主种类确定第56-57页
第五章 讨论第57-59页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒湖南株系基因组序列分析第57页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒的检测技术第57页
   ·南方水稻黑条矮缩病毒的检测技术的应用第57-59页
     ·水稻南方黑条矮缩病的症状研究第57-58页
     ·南方水稻黑条矮缩病毒的自然寄主研究第58-59页
主要符号表第59-60页
参考文献第60-67页
致谢第67-68页
个人简介第68页

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