| 摘要 | 第1-16页 |
| Abstract | 第16-19页 |
| 符号说明及縮写词 | 第19-21页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-41页 |
| ·粘细菌社会学行为介绍 | 第21-25页 |
| ·粘细菌的发育及粘孢子的形成 | 第21-23页 |
| ·粘细菌的大分子摄食及捕食行为 | 第23-25页 |
| ·粘细菌的运动 | 第25页 |
| ·分子伴侣的认识 | 第25-27页 |
| ·分子伴侣的定义及其功能 | 第25-27页 |
| ·分子伴侣与热激蛋白的区别 | 第27页 |
| ·GroEL和GroES的组成结构及作用机制 | 第27-32页 |
| ·GroEL和GroES的组成结构特征 | 第27-29页 |
| ·GroEL作用机制 | 第29-32页 |
| ·GroEL帮助底物折叠过程 | 第29-30页 |
| ·ATP的作用 | 第30-31页 |
| ·GroEL折叠的底物蛋白特征 | 第31-32页 |
| ·粘球菌中groELs的组成特点及功能分化初步研究 | 第32-36页 |
| ·粘球菌groELs基因组成及结构特点 | 第32-34页 |
| ·GroELs在M.xanthus DK1622社会学行为中的功能探究 | 第34-36页 |
| ·groELs在热激条件下的表达情况 | 第36页 |
| ·groELs调控机制 | 第36-39页 |
| ·groELs的正调控机制 | 第37页 |
| ·groELs的负调控机制 | 第37-39页 |
| ·本论文工作开展思路和研究内容 | 第39-41页 |
| 第二章 免疫共沉淀鉴定GroEL1/2相互作用蛋白 | 第41-75页 |
| ·实验材料 | 第42-43页 |
| ·菌株与质粒 | 第42页 |
| ·培养基 | 第42页 |
| ·试剂 | 第42-43页 |
| ·仪器设备与耗材 | 第43页 |
| ·实验方法 | 第43-45页 |
| ·粘球菌发育、大分子摄食阶段免疫共沉淀 | 第43-45页 |
| ·均质器破碎孢子(发育阶段使用) | 第43-44页 |
| ·高压破碎(大分子摄食阶段使用) | 第44-45页 |
| ·实验结果与分析 | 第45-74页 |
| ·免疫共沉淀方法的应用 | 第45-46页 |
| ·免疫共沉淀实验条件优化结果 | 第46-47页 |
| ·均质器破碎孢子条件摸索结果 | 第46-47页 |
| ·大分子捕食阶段的实验条件选取 | 第47页 |
| ·不同阶段免疫共沉淀pull down结果 | 第47-49页 |
| ·发育阶段GroEL相互作用底物pull down结果 | 第47-48页 |
| ·大分子降解阶段GroEL相互作用底物pull down结果 | 第48-49页 |
| ·不同阶段免疫共沉淀质谱鉴定结果 | 第49-74页 |
| ·发育阶段质谱数据 | 第49-66页 |
| ·大分子摄食阶段质谱数据 | 第66-70页 |
| ·蛋白质的基本分类 | 第70-72页 |
| ·蛋白数据分析 | 第72-74页 |
| ·本章小结 | 第74-75页 |
| 第三章 免疫共沉淀质谱鉴定蛋白相关基因敲除 | 第75-105页 |
| ·实验材料 | 第76-79页 |
| ·菌株和质粒 | 第76-77页 |
| ·培养基 | 第77页 |
| ·试剂 | 第77-78页 |
| ·仪器设备与耗材 | 第78-79页 |
| ·实验方法 | 第79-90页 |
| ·生物信息学分析及相关软件 | 第79页 |
| ·基因敲除载体的构建流程 | 第79-80页 |
| ·目的片段的扩增及处理 | 第80-85页 |
| ·引物设计和合成 | 第80-83页 |
| ·PCR扩增目的片段及后处理 | 第83页 |
| ·片段/载体酶切,连接及转化 | 第83-85页 |
| ·构建好的质粒载体提取及测序验证 | 第85页 |
| ·粘球菌DK1622电转化流程及突变子筛选处理 | 第85-87页 |
| ·粘球菌DK1622电转化 | 第85-86页 |
| ·敲除突变子的筛选及纯化 | 第86-87页 |
| ·突变株的保存与活化 | 第87页 |
| ·突变株的社会学行为分析 | 第87-90页 |
| ·突变株的生长能力分析 | 第87-88页 |
| ·突变株发育及生孢能力的分析 | 第88页 |
| ·突变株的捕食能力分析 | 第88-89页 |
| ·突变株的运动能力的分析 | 第89页 |
| ·突变株中Myxovirescin(TA)检测 | 第89-90页 |
| ·实验结果 | 第90-103页 |
| ·生物信息学分析敲除基因的结果 | 第90-92页 |
| ·相关基因敲除实验结果 | 第92-95页 |
| ·敲除载体构建结果 | 第93-94页 |
| ·基因敲除结果验证 | 第94-95页 |
| ·敲除突变株性质分析 | 第95-103页 |
| ·突变株生长能力分析 | 第96-97页 |
| ·敲除突变株捕食表型 | 第97-99页 |
| ·敲除突变株发育表型及生孢率的比较 | 第99-101页 |
| ·敲除突变株的运动能力分析 | 第101-102页 |
| ·敲除突变株产生TA能力分析 | 第102-103页 |
| ·本章小结 | 第103-105页 |
| 第四章 Myxococcus xanthus DK1622中groELs相关调控机制研究 | 第105-123页 |
| ·实验材料 | 第106-108页 |
| ·菌株和质粒 | 第106页 |
| ·培养基 | 第106页 |
| ·试剂 | 第106-108页 |
| ·仪器设备与耗材 | 第108页 |
| ·实验方法 | 第108-114页 |
| ·生物信息学分析及相关软件 | 第108页 |
| ·引物延伸确定groELs启动子位置相关实验方法 | 第108-111页 |
| ·引物设计 | 第108-109页 |
| ·RNA提取 | 第109页 |
| ·RNA中残余DNA的去除 | 第109-110页 |
| ·反转录PCR(RT-PCR) | 第110-111页 |
| ·cDNA纯化 | 第111页 |
| ·荧光标记的cDNA分离检测 | 第111页 |
| ·groELs前端调控序列与HrcA蛋白的相互作用 | 第111-114页 |
| ·引物设计 | 第111-112页 |
| ·载体构建流程 | 第112-113页 |
| ·PCR扩增目的片段及后处理 | 第113页 |
| ·片段/载体酶切,连接及转化 | 第113页 |
| ·均建好的质粒载体提取及测序验证 | 第113页 |
| ·HrcA蛋白的表达 | 第113页 |
| ·HrcA蛋白的纯化 | 第113-114页 |
| ·实验结果 | 第114-121页 |
| ·引物延伸结果分析 | 第114-116页 |
| ·软件预测分析 | 第114-115页 |
| ·引物延伸结果分析 | 第115-116页 |
| ·Band-Shift检测HrcA与CRICE元件的结合 | 第116-121页 |
| ·groEL(?)2启动子区域的CIRCE元件及其基因片段的扩增 | 第116-117页 |
| ·CRICE元件的保守性分析 | 第117-118页 |
| ·HrcA蛋白表达结果与分析 | 第118-120页 |
| ·Band-Shift实验验证HrcA与CIRCE元件结合 | 第120-121页 |
| ·本章小结 | 第121-123页 |
| 总结与展望 | 第123-125页 |
| 附录 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-134页 |
| 致谢 | 第134-136页 |
| 攻读硕士期间主要研究成果 | 第136-137页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第137页 |
