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实时定量PCR检测血中金黄色葡萄球菌DNA及快速药敏试验的方法学研究

中文摘要第1-8页
英文摘要第8-10页
中英文名词及缩写第10-12页
前言第12-15页
第一部分 实时定量PCR检测血中金黄色葡萄球菌DNA的方法学及临床标本验证第15-62页
 一、实验材料第16-19页
  (一) 主要仪器第16页
  (二) 试剂及耗材第16-17页
  (三) 菌种来源第17-18页
  (四) 标本采集第18-19页
 二、实验方法第19-40页
  (一) 特异性引物及TaqMan探针设计第19页
  (二) LB(Luria-Bertain)培养基的制备第19-20页
  (三) 基因组DNA提取第20-22页
  (四) 引物有效性及特异性验证第22-23页
  (五) 探针有效性及特异性验证第23-24页
  (六) 标准品质粒的制备第24-30页
  (七) 实时定量PCR引物和探针浓度优化第30-34页
  (八) 实时定量PCR反应体系建立及实验流程第34-37页
  (九) 检测限、灵敏度和特异度测试第37页
  (十) 标准曲线建立第37-38页
  (十一) 仪器准确性及重复性测试第38页
  (十二) 模拟血标本中细菌DNA提取效率测定第38页
  (十三) 模拟标本存放稳定性监测第38页
  (十四) RQ-PCR对临床标本金黄色葡萄球菌的检测第38页
  (十五) 统计学处理第38-40页
 三、实验结果第40-56页
  (一) 特异性引物及TaqMan探针序列第40页
  (二) 引物和探针特异性验证第40-41页
  (三) 菌落PCR第41-42页
  (四) 测序第42-45页
  (五) 比对第45-46页
  (六) 质粒电泳第46页
  (七) 质粒PCR第46-47页
  (八) 质粒DNA拷贝数的换算第47-48页
  (九) 实时定量PCR引物和探针浓度优化第48-50页
  (十) 检测限、灵敏度和特异度测定第50-51页
  (十一) 标准曲线线性范围第51-52页
  (十二) 仪器的准确性及重复性第52-53页
  (十三) 血标本中细菌DNA提取效率第53-54页
  (十四) 储存标本的稳定性第54页
  (十五) 临床标本检测结果第54-56页
 四、讨论第56-62页
第二部分 实时定量PCR检测外科发热患者静脉血中金黄色葡萄球菌并与细菌培养结果的对照研究第62-71页
 一、实验材料第62-64页
  (一) 主要仪器第62-63页
  (二) 试剂及耗材第63页
  (三) 标本采集第63-64页
 二、实验方法第64-65页
  (一) 患者血标本培养第64页
  (二) 临床血标本细菌基因组DNA提取第64页
  (三) 检测限和灵敏度、特异度的确定第64页
  (四) 健康成年人全血基因组的检测第64页
  (五) 临床标本检测第64页
  (六) 统计学处理第64-65页
 三、实验结果第65-68页
  (一) 健康成年人血标本检测结果第65页
  (二) 发热外科患者血标本实时定量PCR检测结果第65-67页
  (三) 外科发热患者血培养结果第67-68页
 四、讨论第68-71页
第三部分 实时定量PCR检测金黄色葡萄球菌在LB培养基和血中对抗生素的敏感性第71-83页
 一、实验材料第72-73页
  (一) 主要仪器第72页
  (二) 试剂及耗材第72-73页
  (三) 菌种来源第73页
 二、实验方法第73-76页
  (一) LB液体培养基配制第73页
  (二) 抗生素的稀释第73页
  (三) LB液体培养基中药物敏感性试验第73-74页
  (四) 健康人全血中药物敏感性试验第74页
  (五) 基因组DNA的提取第74页
  (六) 引物和探针、标准品第74-75页
  (七) 实时定量PCR反应体系第75-76页
 三、实验结果第76-80页
  (一) LB液体培养基中金黄色葡萄球菌抗生素药物敏感性试验第76-78页
  (二) 健康人全血中金黄色葡萄球菌抗生素药物敏感性试验第78-80页
 四、讨论第80-83页
文献综述第83-89页
参考文献第89-93页
致谢第93-94页
个人简历第94页

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