| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-24页 |
| ·玉米基因组SNPs和InDels的研究进展 | 第11-15页 |
| ·SNP和InDels的定义 | 第11页 |
| ·玉米基因组的SNP和InDels出现频率 | 第11-12页 |
| ·玉米基因组的SNP和InDels的应用 | 第12-15页 |
| ·等位基因特异PCR检测技术的研究进展 | 第15-20页 |
| ·等位基因特异PCR技术的原理 | 第16-17页 |
| ·等位基因特异PCR技术目前存在的问题 | 第17-18页 |
| ·实时荧光定量PCR技术检测SNP的原理 | 第18-20页 |
| ·ZmZF与玉米根系在水胁迫条件下的表达调控 | 第20-21页 |
| ·玉米杂种优势与基因表达及调控 | 第21-23页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-32页 |
| ·材料 | 第24页 |
| ·ZmZF等位基因部分cDNA在两亲本间的多态性 | 第24-28页 |
| ·玉米材料的淹水处理 | 第24-25页 |
| ·玉米根系总RNA的提取和cDNA第一条单链的合成 | 第25-26页 |
| ·ZmZF基因cDNA的部分序列扩增 | 第26-27页 |
| ·PCR产物和T-载体连接 | 第27页 |
| ·电转化 | 第27-28页 |
| ·ZmZF基因cDNA部分序列的SNP和InDel的发掘 | 第28页 |
| ·分型引物的设计和检测 | 第28-31页 |
| ·分型引物的设计 | 第28-30页 |
| ·分型引物在不同Mg~(2+)浓度下的稳定性 | 第30页 |
| ·分型引物在不同dNTP浓度下的稳定性 | 第30页 |
| ·基于分型引物的实时荧光定量PCR检测方法的建立 | 第30-31页 |
| ·用分型引物对ZmZF等位基因表达的半定量RT-PCR检测 | 第31页 |
| ·ZmZF等位基因在杂交种根系中的表达 | 第31页 |
| ·ZmZF等位基因在杂交种叶片中的表达 | 第31页 |
| ·实时荧光定量PCR检测这两个等位基因的表达 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-46页 |
| ·ZmZFcDNA序列在两亲本间的多态性 | 第32-33页 |
| ·分型引物的筛选与特异位点的验证 | 第33-35页 |
| ·分型引物稳定性的检验 | 第35-37页 |
| ·分型引物在不同Mg~(2+)浓度下的稳定性 | 第35-36页 |
| ·分型引物在不同dNTP浓度下的稳定性 | 第36-37页 |
| ·实时荧光定量PCR方法鉴别这两个等位基因型的结果 | 第37-39页 |
| ·ZmZF等位基因表达的半定量RT-PCR检测 | 第39-40页 |
| ·ZmZF等位基因在根部的半定量RT-PCR检测 | 第39-40页 |
| ·ZmZF等位基因在叶片中的表达 | 第40页 |
| ·实时荧光定量PCR检测到的ZmZF等位基因在根系中的表达 | 第40-46页 |
| ·ZmZF等位基因在杂交种根系中的表达 | 第40-43页 |
| ·ZmZF等位基因在两亲本根系中的表达 | 第43-46页 |
| 4 讨论 | 第46-51页 |
| ·本AS-PCR检测体系的探讨 | 第46-48页 |
| ·本研究中特异引物的设计方法讨论 | 第46页 |
| ·本AS-PCR反应体系对碱基错配的影响 | 第46-47页 |
| ·PCR反应程序对本检测方法的影响 | 第47-48页 |
| ·ZmZF等位基因的多态性与表达量的差异 | 第48-51页 |
| ·开展玉米基因组转录因子多态性研究的意义 | 第48-49页 |
| ·ZmZF等位基因的Cis结构多态性与表达差异之间的关系 | 第49页 |
| ·ZmZF等位基因的表达差异与玉米的耐渍性 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录 | 第62-65页 |
| 附录1 总RNA的提取 | 第62页 |
| 附录2 CASpure Gel Extraction Kit纯化回收DNA | 第62-63页 |
| 附录3 电转化感受态的制备 | 第63页 |
| 附录4 扩增出的两条序列间的多态性 | 第63-64页 |
| 附录5 本研究中基因表达量的分析方法 | 第64-65页 |
| 附录6 在PCR反应结束后的相对定量分析程序 | 第65页 |
