含假结RNA二级结构图的语法及拓扑分类
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 绪论 | 第10-17页 |
| ·RNA的功能和结构 | 第10-12页 |
| ·含假结RNA二级结构的研究现状 | 第12-15页 |
| ·本文主要工作 | 第15-17页 |
| 2 RNA二级结构弧图语法 | 第17-45页 |
| ·RNA二级结构及其表示法 | 第17-27页 |
| ·弧图表示法 | 第19-21页 |
| ·模式表示法 | 第21-22页 |
| ·闭区域及假结 | 第22-25页 |
| ·弧图的粒度和纯度 | 第25-27页 |
| ·弧图语法的双要素 | 第27-32页 |
| ·初始弧图 | 第28-29页 |
| ·重写规则 | 第29-32页 |
| ·典型二级结构类的弧图语法 | 第32-38页 |
| ·PKF类的弧图语法 | 第32-33页 |
| ·L&P类的弧图语法 | 第33-34页 |
| ·D&P类的弧图语法 | 第34-35页 |
| ·A&U类的弧图语法 | 第35-36页 |
| ·R&E类的弧图语法 | 第36-37页 |
| ·从弧图语法看类间关系 | 第37-38页 |
| ·弧图语法的优点与前景 | 第38-40页 |
| ·生成子的最小功能集 | 第40-43页 |
| ·小结 | 第43-45页 |
| 3 R&E弧图的平面特性 | 第45-57页 |
| ·可平面的R&E弧图 | 第46-51页 |
| ·R&E弧图平面性的判定 | 第51-54页 |
| ·扩展及小结 | 第54-57页 |
| 4 R&E弧图的书嵌入 | 第57-69页 |
| ·R&E弧图的书嵌入数及交叉关系图 | 第57-62页 |
| ·极大团覆盖及着色 | 第62-66页 |
| ·算例及小结 | 第66-69页 |
| 5 R&E弧图的有向闭曲面分类 | 第69-84页 |
| ·二级结构图的有向闭曲面分类 | 第69-74页 |
| ·R&E弧图亏格的动态计算法 | 第74-77页 |
| ·小亏格R&E弧图的枚举 | 第77-80页 |
| ·相似R&E弧图的亏格计算 | 第80-82页 |
| ·小结 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-94页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
