杨盘二孢菌诱导的杨树差异表达基因的功能分析和染色体定位
| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-33页 |
| 1 植物抗病分子生物学研究进展 | 第9-18页 |
| ·植物抗病分子机制 | 第9-14页 |
| ·宿主特异性抗性 | 第10-12页 |
| ·非宿主性抗性 | 第12-13页 |
| ·宿主性抗性与非宿主性抗性的关系 | 第13-14页 |
| ·植物抗病过程中的信号传导 | 第14-16页 |
| ·激发子诱导的早期反应 | 第14页 |
| ·植物防御过程中基本的信号通路 | 第14-16页 |
| ·林木抗病分子生物学研究进展 | 第16-18页 |
| 2 功能基因组学及其研究方法 | 第18-20页 |
| ·基本概念 | 第18-19页 |
| ·功能基因组学研究方法 | 第19-20页 |
| ·表达序列标签 | 第19页 |
| ·抑制性消减杂交 | 第19页 |
| ·基因表达的系列分析 | 第19-20页 |
| ·差异显示反转录聚合酶链式反应 | 第20页 |
| ·生物芯片技术 | 第20页 |
| 3 生物芯片技术 | 第20-29页 |
| ·生物芯片产生的背景、定义及特点 | 第20-21页 |
| ·生物芯片的种类 | 第21-23页 |
| ·基因芯片 | 第21-22页 |
| ·蛋白质芯片 | 第22页 |
| ·组织芯片 | 第22页 |
| ·细胞芯片 | 第22-23页 |
| ·糖芯片 | 第23页 |
| ·芯片实验室 | 第23页 |
| ·其它类型的生物芯片 | 第23页 |
| ·生物芯片制作流程与数据分析 | 第23-24页 |
| ·生物芯片技术在植物功能基因组学研究中的应用 | 第24-27页 |
| ·生物信息学在生物芯片中的应用 | 第27-29页 |
| ·生物信息学 | 第27页 |
| ·生物信息学在生物芯片中的应用 | 第27-29页 |
| 4 实时定量PCR原理及其应用 | 第29-30页 |
| ·实时定量PCR原理 | 第29-30页 |
| ·实时定量PCR技术的应用 | 第30页 |
| 5 杨树黑斑病研究现状 | 第30-31页 |
| 6 立题依据,研究目的及意义 | 第31页 |
| 7 研究内容及技术路线 | 第31-33页 |
| 第二章 杨树cDNA芯片的制备与分析 | 第33-47页 |
| 1 实验材料 | 第33页 |
| 2 实验方法 | 第33-41页 |
| ·cDNA芯片的制备 | 第33-34页 |
| ·cDNA克隆的制备、检测及纯化 | 第33-34页 |
| ·芯片的制备 | 第34页 |
| ·实验样本的制备 | 第34-39页 |
| ·实验材料的准备 | 第34-35页 |
| ·RNA样品的提取 | 第35-36页 |
| ·RNA样本的标记 | 第36-39页 |
| ·标记后的RNA样本的纯化与定量 | 第39页 |
| ·芯片杂交 | 第39-40页 |
| ·芯片数据的获得与分析处理 | 第40-41页 |
| ·芯片图象分析及数据的获得 | 第40页 |
| ·数据分析及差异基因的筛选 | 第40-41页 |
| 3 结果与分析 | 第41-44页 |
| ·cDNA克隆的PCR扩增 | 第41页 |
| ·RNA样本的提取 | 第41-42页 |
| ·芯片杂交实验 | 第42-44页 |
| 4 讨论 | 第44-47页 |
| 第三章 美洲黑杨病原胁迫下基因表达调控分析 | 第47-69页 |
| 1 实验材料 | 第47页 |
| 2 实验方法 | 第47-52页 |
| ·实验样本的制备 | 第47-48页 |
| ·实验材料的准备 | 第47页 |
| ·RNA样品的提取 | 第47-48页 |
| ·RNA样本的标记 | 第48页 |
| ·标记后的RNA样本的纯化与定量 | 第48页 |
| ·芯片杂交以及数据的获得与分析 | 第48页 |
| ·实时定量RT-PCR分析部分差异表达基因 | 第48-51页 |
| ·样本的准备 | 第48页 |
| ·RNA的提取 | 第48页 |
| ·第一链cDNA的合成 | 第48-49页 |
| ·实时定量RT-PCR分析 | 第49-51页 |
| ·差异基因的功能注释与表达谱分析 | 第51-52页 |
| 3 结果与分析 | 第52-64页 |
| ·RNA样本的提取 | 第52页 |
| ·芯片杂交实验 | 第52-56页 |
| ·差异基因表达及其聚类分析 | 第56-62页 |
| ·差异基因的验证 | 第62-64页 |
| ·内对照基因的筛选 | 第62-64页 |
| ·差异基因的实时定量RT-PCR分析 | 第64页 |
| 4 讨论 | 第64-69页 |
| ·差异基因的表达分析 | 第64-67页 |
| ·差异基因验证 | 第67-69页 |
| 第四章 病原诱导的差异基因的功能分析和染色体定位 | 第69-84页 |
| 1 实验材料 | 第69页 |
| 2 实验方法 | 第69页 |
| 3 结果与分析 | 第69-81页 |
| ·差异基因的功能分析 | 第69-78页 |
| ·差异基因的染色体定位 | 第78-81页 |
| 4 讨论 | 第81-84页 |
| ·植物防御过程中的新陈代谢 | 第81页 |
| ·病原诱导的活性氧反应 | 第81-82页 |
| ·植物防御过程中的信号传导及转录调控 | 第82-83页 |
| ·染色体定位 | 第83-84页 |
| 第五章 杨树两个病原诱导蛋白的克隆及表达分析 | 第84-101页 |
| 前言 | 第84-86页 |
| 1 实验材料 | 第86页 |
| 2 实验方法 | 第86-93页 |
| ·植物材料及病原菌处理 | 第86页 |
| ·水杨酸和茉莉酸处理 | 第86页 |
| ·RNA样品的提取 | 第86页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第86页 |
| ·实时定量RT-PCR分析 | 第86-87页 |
| ·WRKY转录因子全长cDNA序列的克隆 | 第87-93页 |
| ·5’和3’RACE扩增 | 第87-90页 |
| ·扩增片段的分离纯化及克隆测序 | 第90-93页 |
| 3 结果与分析 | 第93-98页 |
| ·RNA样品的提取 | 第93页 |
| ·实时定量RT-PCR分析 | 第93-95页 |
| ·WRKY转录因子全长cDNA序列的克隆 | 第95-98页 |
| ·5’和3’RACE扩增 | 第95-96页 |
| ·扩增片段的分离纯化及克隆测序 | 第96-97页 |
| ·序列分析 | 第97-98页 |
| 4 讨论 | 第98-101页 |
| ·WREY转录因子受病原菌诱导表达 | 第98-99页 |
| ·WKKY转录因子参与多个防御相关的信号传导 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-116页 |
| 详细摘要 | 第116-121页 |
