| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 英文縮略词表 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1 前言 | 第13页 |
| 2. 猪骨骼肌生长发育 | 第13-15页 |
| ·猪肌肉纤维的类型 | 第14-15页 |
| 3. 影响猪肌肉品质的因素 | 第15-19页 |
| ·肌内脂肪生理学 | 第15页 |
| ·三酰甘油在肌肉纤维中的含量 | 第15-16页 |
| ·肌肉组织中的脂肪酸代谢 | 第16页 |
| ·肌内脂肪细胞分化 | 第16-17页 |
| ·肌纤维类型与猪肉品质 | 第17页 |
| ·肌内脂肪与猪肉品质 | 第17-18页 |
| ·肌纤维相关基因 | 第18-19页 |
| 4 研究中外猪种肌肉基因差异表达的意义 | 第19页 |
| 5 基因芯片技术简介 | 第19-23页 |
| ·基因芯片微阵列平台 | 第20页 |
| ·阵列设计 | 第20-21页 |
| ·目前的应用 | 第21-23页 |
| 第二章 研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 第三章 材料和方法 | 第24-32页 |
| 1 材料 | 第24-25页 |
| ·试验样品 | 第24页 |
| ·主要仪器与设备 | 第24页 |
| ·主要药品及试剂 | 第24-25页 |
| ·主要化学试剂的配制 | 第25页 |
| ·主要生物信息学软件以及数据库 | 第25页 |
| 2.试验方法 | 第25-32页 |
| ·背最长肌的组织RNA提取 | 第25-27页 |
| ·基因芯片杂交试验 | 第27页 |
| ·cDNA的合成制备与检测 | 第27-28页 |
| ·QPCR验证基因芯片 | 第28-30页 |
| ·定量PCR实验 | 第29-30页 |
| ·基因芯片结果与定量PCR结果的吻合度分析 | 第30页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第30-31页 |
| ·基因芯片结果表达模式分类 | 第31页 |
| ·MAS系统对分析筛选结果进行分子生物学注释 | 第31页 |
| ·梅山猪转录水平与蛋白水平差异表达基因的比较分析 | 第31-32页 |
| 第四章 结果与分析 | 第32-67页 |
| 1. 基因芯片实验结果分析 | 第32-33页 |
| 2 差异基因筛选结果 | 第33-34页 |
| 3 差异基因的表达模式 | 第34-41页 |
| 4. SOM分类分析 | 第41页 |
| 5 共峰比对 | 第41-50页 |
| 6 错峰比对 | 第50-59页 |
| 7 七个基因的定量PCR分析 | 第59页 |
| 8 分子生物学注释 | 第59-64页 |
| ·共峰比对的基因所涉及到的主要pathway | 第60-64页 |
| ·差异表达基因Gene ontology(GO)分析 | 第64页 |
| 9 梅山猪转录水平与蛋白水平差异表达基因的比较分析 | 第64-67页 |
| 第五章 讨论 | 第67-80页 |
| 1 关于数据分析方法 | 第67-68页 |
| 2 共峰比对 | 第68-73页 |
| ·第一波峰涉及的通路讨论 | 第68页 |
| ·第一波峰差异基因 | 第68-70页 |
| ·第二波峰涉及的通路讨论 | 第70页 |
| ·第二波峰差异基因 | 第70-72页 |
| ·第三波峰差异基因 | 第72-73页 |
| ·第四波峰差异基因 | 第73页 |
| 3 错峰比对 | 第73-76页 |
| ·梅山猪滞后波峰基因 | 第73-74页 |
| ·约克夏波峰滞后基因 | 第74-76页 |
| 4 差异基因调控网络分析 | 第76-80页 |
| ·细胞凋亡相关 | 第76页 |
| ·肌肉结构相关 | 第76-77页 |
| ·肌肉生成相关 | 第77页 |
| ·糖原代谢相关 | 第77-78页 |
| ·糖酵解相关 | 第78页 |
| ·脂肪代谢相关 | 第78-80页 |
| 第六章 总结 | 第80-83页 |
| 1 主要研究成果 | 第80-81页 |
| 2 主要创新点 | 第81页 |
| 3 本研究的不足之处 | 第81-82页 |
| 4 值得进一步研究的问题 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-95页 |
| 附录 | 第95-113页 |
| 在读期间发表文章 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114页 |