| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-21页 |
| ·研究问题的由来 | 第11页 |
| ·文献综述 | 第11-21页 |
| ·猪肌肉生长相关研究 | 第11-16页 |
| ·猪肌肉生长发育基本规律 | 第11-14页 |
| ·猪肌肉生长相关候选基因研究进展 | 第14-16页 |
| ·生物信息学在猪基因组研究中的应用 | 第16-18页 |
| ·基因的电子克隆 | 第16-17页 |
| ·从基因组DNA序列中预测新基因 | 第17页 |
| ·发现单核苷酸多态性(SNP) | 第17-18页 |
| ·四个拟分离基因的研究进展 | 第18-21页 |
| ·SMPX(X染色体相关小肌肉蛋白) | 第18页 |
| ·STARS(横纹肌中Rho信号激活蛋白) | 第18-19页 |
| ·VGLL2和VGLL4(残迹相似基因2和4) | 第19-21页 |
| 2 研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 3 材料与方法 | 第22-40页 |
| ·材料 | 第22-27页 |
| ·组织样品 | 第22页 |
| ·DNA样品 | 第22-23页 |
| ·主要试剂 | 第23页 |
| ·主要试剂的配制 | 第23-25页 |
| ·载体和菌株 | 第25-26页 |
| ·酶和试剂盒 | 第26页 |
| ·主要仪器设备 | 第26页 |
| ·主要分子生物学软件、统计软件和相关网站 | 第26-27页 |
| ·方法 | 第27-40页 |
| ·候选基因的克隆方法 | 第27-29页 |
| ·EST-重叠群的构建 | 第27页 |
| ·引物设计 | 第27-28页 |
| ·PCR扩增条件 | 第28页 |
| ·PCR产物的纯化、克隆和测序 | 第28-29页 |
| ·用RACE方法获取SMPX和STARS基因的全长cDNA及序列分析 | 第29-31页 |
| ·用同源引物方法获取猪SMPX基因的部分启动子序列及序列分析 | 第31页 |
| ·基因染色体定位的SCHP和RH法 | 第31-32页 |
| ·引物设计 | 第31页 |
| ·PCR扩增分型方法 | 第31-32页 |
| ·数据分析方法 | 第32页 |
| ·基因组织表达谱与时期表达谱研究 | 第32-35页 |
| ·总RNA的提取及检测 | 第33-34页 |
| ·反转录反应(RT-PCR) | 第34页 |
| ·PCR扩增、检测及数据分析 | 第34-35页 |
| ·基因的多态性检测方法 | 第35-36页 |
| ·PCR反应 | 第35页 |
| ·RFLP和错配引入酶切位点方法 | 第35-36页 |
| ·基因多态性与性状的关联分析方法 | 第36页 |
| ·猪SMPX基因的原核表达 | 第36-40页 |
| ·pET28a-SMPX重组原核表达载体的构建 | 第36-39页 |
| ·SMPX蛋白的诱导表达 | 第39-40页 |
| 4 结果 | 第40-61页 |
| ·基因的克隆与cDNA全长获取 | 第40-44页 |
| ·RT-PCR扩增的结果 | 第40页 |
| ·猪SMPX基因cDNA与氨基酸序列分析结果 | 第40-42页 |
| ·猪STARS基因cDNA与氨基酸序列分析结果 | 第42-44页 |
| ·猪VGLL2和VGLL4基因片段的分离克隆 | 第44页 |
| ·猪SMPX基因部分启动子序列获取及分析 | 第44-45页 |
| ·基因的染色体定位结果 | 第45-50页 |
| ·染色体区域定位结果 | 第45-48页 |
| ·SMPX基因染色体区域定位结果 | 第45-47页 |
| ·其它基因染色体区域定位结果 | 第47-48页 |
| ·精细定位结果 | 第48-50页 |
| ·基因的组织表达谱与时期表达谱结果 | 第50-51页 |
| ·SMPX基因的组织表达谱与时期表达谱结果 | 第50-51页 |
| ·STARS基因的组织表达谱与时期表达谱结果 | 第51页 |
| ·猪SMPX和STARS基因遗传多态性检测分析结果 | 第51-56页 |
| ·SMPX和STARS两基因的多态性检测 | 第52-53页 |
| ·遗传变异检测结果 | 第53-54页 |
| ·基因在不同猪群中的多态性分析结果 | 第54-56页 |
| ·猪SMPX和STARS的遗传变异与部分经济性状的关联分析结果 | 第56-58页 |
| ·猪SMPX基因的原核表达结果 | 第58-61页 |
| ·RT-PCR扩增结果 | 第58页 |
| ·猪SMPX基因的原核表达载体的构建 | 第58-59页 |
| ·原核表达载体pET28a-SMPX的鉴定 | 第59-60页 |
| ·重组子的菌液PCR鉴定结果 | 第59页 |
| ·重组子的酶切鉴定结果 | 第59页 |
| ·重组子中的插入基因片段的测序鉴定结果 | 第59-60页 |
| ·IPTG诱导重组原核表达载体表达SMPX蛋白 | 第60-61页 |
| 5 讨论 | 第61-66页 |
| ·关于基因的全长获取及分析 | 第61页 |
| ·关于新基因的鉴定问题 | 第61-62页 |
| ·关于基因的定位 | 第62-63页 |
| ·关于定位引物的设计 | 第62页 |
| ·关于四个基因的物理定位结果 | 第62-63页 |
| ·关于基因的组织及时期表达谱 | 第63-64页 |
| ·关于基因的多态检测及性状关联分析 | 第64-66页 |
| ·关于SMPX基因的多态检测及性状关联分析 | 第64页 |
| ·关于STARS基因的多态检测及性状关联分析 | 第64-66页 |
| 6 小结 | 第66-68页 |
| ·本研究获得的结果 | 第66页 |
| ·本研究的创新点 | 第66-67页 |
| ·本研究不足之处及下一步值得研究的工作 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-73页 |
| 附录1 缩略词表 | 第73-74页 |
| 附录2 主要性状的中英文对照和缩写 | 第74-75页 |
| 附录3 VGLL2基因的部分DNA序列(DQ241740) | 第75-76页 |
| 附录4 VGLL4基因的部分CDNA序列(DQ241739) | 第76-77页 |
| 在读期间发表(待发表)论文题录 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
