| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-11页 |
| 第二章 背景概述 | 第11-18页 |
| ·蛋白质组和蛋白质组学 | 第11-13页 |
| ·蛋白质组学的产生背景 | 第11页 |
| ·蛋白质组和蛋白质组学的概念 | 第11-12页 |
| ·蛋白质组学的研究内容 | 第12页 |
| ·蛋白质组学的研究意义和应用 | 第12-13页 |
| ·质谱和串联质谱 | 第13页 |
| ·串联质谱中的离子类型 | 第13-15页 |
| ·序列离子 | 第13-14页 |
| ·中间碎片离子 | 第14-15页 |
| ·卫星离子 | 第15页 |
| ·基于串联质谱的蛋白质鉴定算法 | 第15-18页 |
| ·蛋白质鉴定算法的分类 | 第15-16页 |
| ·主要的蛋白质鉴定算法 | 第16页 |
| ·能够处理突变和翻译后修饰的蛋白质鉴定算法 | 第16-18页 |
| 第三章 Modified Spectral Alignment 算法 | 第18-33页 |
| ·Shared Peaks Count 算法 | 第18-20页 |
| ·Spectral Alignment 算法 | 第20-23页 |
| ·术语和定义 | 第20-23页 |
| ·SA 算法 | 第23页 |
| ·对SA 算法的评价 | 第23页 |
| ·Modified Spectral Alignment 算法 | 第23-32页 |
| ·改进D(k)和k-最佳Spectral Alignment 的求解方式 | 第24-27页 |
| ·引入相对熵 | 第27-29页 |
| ·引入“双端考虑” | 第29-31页 |
| ·建立翻译后修饰的频率矩阵 | 第31-32页 |
| ·小结 | 第32-33页 |
| 第四章 Modified Spectral Alignment 算法的实现 | 第33-37页 |
| ·鉴定突变和翻译后修饰的流程图 | 第33-34页 |
| ·实验串联质谱预处理 | 第34-35页 |
| ·生成理想串联质谱 | 第35页 |
| ·实验串联质谱中的误差处理 | 第35-37页 |
| 第五章 实验结果 | 第37-42页 |
| ·MSA 算法和SA 算法 | 第37-40页 |
| ·进行“双端考虑” | 第40-42页 |
| 第六章 总结与展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 攻读硕士期间公开发表的论文 | 第48页 |
