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鸡3号染色体上影响羽形性状候选基因的多态性和表达分析

目录第1-7页
缩略语表(Abbreviations)第7-8页
摘要第8-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第11-34页
   ·脊椎动物皮肤衍生物发生比较第11-13页
     ·鸟纲之外的脊椎动物皮肤衍生物的发生第11-12页
     ·羽毛的发生及与其他脊椎动物衍生物发生的比较第12-13页
   ·胚胎早期形态发生第13-16页
     ·细胞与细胞外基质的相互作用第14页
     ·芽的形态发生模式第14-15页
       ·芽的形成模式第14-15页
       ·肺芽发生和其基因调控第15页
     ·程序性细胞死亡在形态发育中的作用第15-16页
   ·羽毛概述第16-22页
     ·羽毛的功能第16页
     ·羽毛的类型和结构第16-18页
     ·羽毛的形成第18-19页
     ·羽毛发育的分子机制第19-22页
       ·Shh-BMP2信号通路第19-20页
       ·WNT信号通路第20-22页
   ·遗传标记的研究进展第22-25页
     ·RFLP标记第22-23页
     ·RAPD标记第23页
     ·微卫星标记第23-24页
     ·AFLP标记第24页
     ·SNP标记第24-25页
   ·基因克隆技术第25-27页
     ·功能克隆第26页
     ·候选克隆第26页
     ·位置克隆第26页
     ·位置候选克隆第26-27页
   ·羽形基因的定位现状第27-28页
   ·候选基因的研究概况第28-33页
     ·候选基因在3号染色体上位置第28页
     ·BMPs的研究进展第28-31页
       ·BMPs的作用机制第28-30页
       ·BMPs在发育中的作用第30页
       ·BMP5的研究进展第30-31页
     ·Tbx18基因的研究概况第31-32页
     ·cEphA7基因的研究概况第32-33页
   ·研究意义第33-34页
第二章 实验材料和方法第34-50页
   ·实验材料第34-36页
     ·实验动物第34页
     ·主要药品和酶第34页
     ·主要仪器设备第34-35页
     ·常规溶液及试剂配制第35页
     ·禽血DNA的提取试剂第35-36页
     ·RNA提取所用试剂和实验准备第36页
     ·SSCP所用试剂第36页
   ·实验方法第36-50页
     ·禽血DNA的提取第36-37页
     ·候选基因编码区PCR扩增第37-39页
     ·PCR-SSCP第39-41页
       ·引物设计第39-41页
       ·10%变性聚丙烯酰胺凝胶(30ml,0.1胶条)制作及电泳第41页
       ·硝酸银染色第41页
     ·总RNA提取第41-42页
     ·表达分析中的RT-PCR反应第42-44页
       ·引物设计第42-43页
       ·RNA的一链合成第43-44页
       ·PCR反应第44页
     ·连接反应第44页
     ·感受态细胞的制备、效价的测定及质粒DNA的转化第44-46页
       ·感受态细胞的制备:CaCl_2法第44-45页
       ·感受态细胞效价的测定第45页
       ·质粒DNA的转化第45页
       ·质粒DNA的快转法第45-46页
       ·重组质粒的快速鉴定Cracking法第46页
     ·质粒的提取第46-47页
     ·DNA片段的回收第47-48页
     ·DNA序列的测定第48-49页
       ·测序反应体系的组成第48页
       ·PCR反应条件第48页
       ·纯化第48页
       ·测序电泳第48-49页
     ·统计和分析第49-50页
第三章 实验结果与分析第50-68页
   ·羽形候选基因多态检测结果第50-55页
     ·羽形候选基因编码区多态检测结果第50-51页
       ·Tbx18基因外显子5中SNP的SSCP分析第50-51页
       ·Tbx18基因外显子5中SNP的群体基因频率分析第51页
     ·羽形候选基因BMP5基因内含子中多态检测结果第51-53页
       ·SSCP检测结果第51-53页
       ·BMP5基因内含子1和内含子2中多态位点的群体基因频率分析第53页
     ·候选基因多态标记和羽形性状遗传连锁分析结果第53-54页
     ·多态位点的转录因子结合位点预测第54-55页
   ·BMP5基因单倍体型分析结果第55-57页
     ·单倍型构建结果第55-56页
     ·单倍体型和鸡屠体性状的相关性分析第56-57页
     ·羽形候选基因在丝羽鸡和片羽鸡中的表达分析第57-62页
     ·BMP5基因不同时期多种组织的表达分析第62-68页
第四章 讨论与结论第68-73页
   ·讨论第68-71页
     ·候选基因的选择第68页
     ·BMP5、Tbx18、cEphA7基因编码区中的SNP第68-69页
     ·候选基因在丝羽鸡和片羽鸡皮肤和毛囊中的表达第69页
     ·BMP5基因在鸡发育中的作用第69-70页
     ·BMP5基因多态位点转录因子结合位点的预测第70-71页
     ·BMP5、Tbx18基因多态标记和羽形基因第71页
     ·候选基因和羽毛发育第71页
   ·结论第71-73页
参考文献第73-79页
附录 Tbx18基因和BMP5基因多态位点的不同基因型个体测序结果第79-88页
致谢第88页

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