| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一部分 文献综述 | 第11-24页 |
| ·天然彩色棉的研究进展 | 第11-17页 |
| ·类黄酮类色素物质 | 第11-13页 |
| ·植物体色素的种类 | 第11页 |
| ·类黄酮类化合物的种类 | 第11-12页 |
| ·类黄酮化合物的生物合成 | 第12-13页 |
| ·彩色棉色素物质的研究 | 第13-14页 |
| ·彩色棉色素物质的形成和积累 | 第14-17页 |
| ·彩色棉纤维的发育特点 | 第14-15页 |
| ·彩色棉色素的形成和沉积部位 | 第15页 |
| ·彩色棉纤维颜色的遗传控制 | 第15-16页 |
| ·彩色棉纤维颜色形成的分子机理研究 | 第16-17页 |
| ·天然彩色棉研究存在的问题和解决办法 | 第17页 |
| ·基因芯片技术的应用 | 第17-20页 |
| ·cDNA芯片技术的原理 | 第18页 |
| ·cDNA芯片技术的制作 | 第18-19页 |
| ·cDNA芯片的应用 | 第19-20页 |
| ·在生物生长发育研究上的应用 | 第19页 |
| ·在生物进化和分类研究上的应用 | 第19页 |
| ·在基因表达调控研究上的应用 | 第19-20页 |
| ·在农业生产领域的应用 | 第20页 |
| ·实时荧光定量PCR技术 | 第20-22页 |
| ·实时荧光定量PCR技术的原理 | 第20-21页 |
| ·实时荧光定量PCR技术的分类 | 第21-22页 |
| ·实时荧光定量PCR在植物基因表达分析中的应用 | 第22页 |
| ·对植物基因表达细微变化的分析 | 第22页 |
| ·基因芯片和DD-PCR结果的验证 | 第22页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第22-24页 |
| 第二部分 利用cDNA芯片技术筛选彩色棉色素相关基因 | 第24-35页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·试验方法 | 第24-26页 |
| ·芯片制作 | 第24-25页 |
| ·芯片质量控制 | 第25页 |
| ·芯片数据的分析 | 第25-26页 |
| ·表达基因的筛选 | 第25-26页 |
| ·差异基因的筛选 | 第26页 |
| ·利用MAS系统对筛选出来的基因进行生物信息学分析 | 第26页 |
| ·结果与分析 | 第26-32页 |
| ·差异表达基因的获得 | 第26-27页 |
| ·差异表达基因分析 | 第27-31页 |
| ·色素相关基因的获取 | 第31-32页 |
| ·本章结论 | 第32页 |
| ·讨论 | 第32-35页 |
| ·芯片的设计 | 第32页 |
| ·cDNA芯片技术筛选差异基因 | 第32-33页 |
| ·差异基因与彩色棉色素的关系 | 第33-35页 |
| 第三部分 色素相关基因的表达差异分析 | 第35-49页 |
| ·实验材料 | 第35页 |
| ·植物材料 | 第35页 |
| ·实验主要仪器 | 第35页 |
| ·实验主要试剂 | 第35页 |
| ·试验方法 | 第35-40页 |
| ·棉花纤维总RNA的提取 | 第35-38页 |
| ·cDNA合成 | 第38页 |
| ·引物设计 | 第38页 |
| ·标准曲线的制备 | 第38-39页 |
| ·荧光定量PCR反应体系及程序 | 第39-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-46页 |
| ·RNA质量检测 | 第40页 |
| ·荧光定量PCR特异性和重复性 | 第40-41页 |
| ·标准曲线的制作 | 第41-42页 |
| ·差异基因的实时荧光定量PCR结果 | 第42-44页 |
| ·其他色素相关基因的实时荧光定量PCR结果 | 第44-46页 |
| ·本章小结 | 第46页 |
| ·讨论 | 第46-49页 |
| ·色素合成时期 | 第46-47页 |
| ·材料来源与色素基因表达的关系 | 第47页 |
| ·天然彩色棉色素物质的分析 | 第47-49页 |
| 第四部分 彩棉查尔酮异构酶(CHI)全长的克隆与分析 | 第49-68页 |
| ·实验材料 | 第49-50页 |
| ·植物材料 | 第49页 |
| ·实验菌株与质粒 | 第49页 |
| ·实验主要仪器 | 第49-50页 |
| ·实验主要试剂 | 第50页 |
| ·试验方法 | 第50-58页 |
| ·棉花基因组DNA的提取 | 第50-52页 |
| ·CHI基因片段的克隆 | 第52页 |
| ·特异引物的设计 | 第52页 |
| ·PCR反应体系 | 第52页 |
| ·PCR反应程序 | 第52页 |
| ·CHI侧翼序列的克隆 | 第52-55页 |
| ·特异引物的设计 | 第52-53页 |
| ·Genome Walker~(TM)文库的构建 | 第53-54页 |
| ·巢式PCR扩增 | 第54-55页 |
| ·PCR产物的回收与纯化 | 第55-56页 |
| ·PCR产物的连接和转化 | 第56-58页 |
| ·PCR产物连接 | 第56页 |
| ·大肠杆菌细胞的转化 | 第56-57页 |
| ·筛选阳性克隆 | 第57页 |
| ·测序 | 第57-58页 |
| ·结果与分析 | 第58-65页 |
| ·DNA的提取 | 第58页 |
| ·CHI基因片段序列获得 | 第58页 |
| ·CHI下游侧翼序列的获得 | 第58-59页 |
| ·CHI上游启动子序列的获得 | 第59页 |
| ·CHI基因DNA序列的生物信息学分析 | 第59-65页 |
| ·CHI基因全长序列的获得及分析 | 第59-60页 |
| ·CHI蛋白结构分析及进化研究 | 第60-64页 |
| ·CHI基因启动子分析 | 第64-65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| ·讨论 | 第66-68页 |
| ·CHI基因分子结构与功能 | 第66页 |
| ·CHI基因启动子结构预测 | 第66-68页 |
| 第五章 全文总结 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 在读期间发表论文 | 第75页 |
