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固氮施氏假单胞菌双组分系统CbrAB碳氮代谢调控功能研究

摘要第1-7页
Abstract第7-16页
第一章 文献综述第16-26页
   ·前言第16页
   ·CbrA-CbrB 双组分系统的发现第16-17页
   ·CbrA 接受的环境信号第17页
   ·CbrA-CbrB 调节多种氨基酸降解代谢的调控第17-19页
     ·铜绿假单胞菌 CbrA-CbrB 在氨基酸降解代谢中的研究第18页
     ·荧光假单胞菌 CbrA-CbrB 在组氨酸降解代谢中的研究第18-19页
   ·CbrA-CbrB 与 NtrB-NtrC 的关系第19页
     ·CbrA-CbrB 与 NtrB-NtrC 存在着调控上的偶联第19页
     ·CbrB 和 NtrC 存在部分的功能重叠或冗余第19页
   ·CbrB 是σ~(54)-依赖型的全局调节因子第19-20页
   ·CbrA 调控菌体对抗生素的抗性第20页
   ·CbrA-CbrB 参与胁迫应答、细菌群体运动、生物薄膜的形成等过程的调控第20-21页
   ·CbrA-CbrB 双组分系统的作用机制第21-23页
   ·Biolog 分析系统第23页
   ·实时定量 PCR第23-24页
   ·立题依据和技术路线第24-26页
     ·立题依据第24-25页
     ·技术路线第25-26页
第二章 突变株构建和功能互补第26-41页
   ·材料第26-29页
     ·菌株和质粒第26-27页
     ·培养基及培养温度第27-28页
     ·抗生素配制及工作浓度第28页
     ·酶、试剂盒和化学试剂第28页
     ·主要仪器第28-29页
     ·常用缓冲液第29页
   ·方法第29-34页
     ·细菌基因组 DNA 的提取第29页
     ·大肠杆菌质粒 DNA 的碱裂解法提取第29-30页
     ·基因的 PCR 扩增第30-31页
     ·DNA 片段的回收与纯化第31-32页
     ·DNA 片段酶切及连接反应第32-33页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备与转化第33页
     ·三亲结合实验第33-34页
   ·结果分析第34-40页
     ·突变株的构建原理第34页
     ·重组质粒载体的构建第34-38页
     ·cbrA 突变株的筛选与验证第38-39页
     ·cbrA 基因功能互补菌株的构建第39-40页
   ·讨论第40-41页
第三章 cbrA 突变株表型鉴定第41-57页
   ·材料第41-42页
     ·菌株第41页
     ·培养基第41-42页
     ·化学试剂和试剂盒第42页
     ·主要仪器第42页
     ·常用溶液第42页
   ·方法第42-48页
     ·P.stutzeri A1501 中 CbrA、CbrB 的进化与结构分析第42页
     ·菌株验证第42-43页
     ·生长曲线测定第43页
     ·Biolog 分析野生型与突变株对碳源的利用情况第43-44页
     ·趋化实验第44页
     ·RNA 提取第44-45页
     ·DNA 消化第45页
     ·RNA 反转为 cDNA第45-46页
     ·实时荧光定量 PCR第46-48页
   ·结果分析第48-55页
     ·P.stutzeri A1501 与已报道的含 CbrA、CbrB 蛋白的细菌进行进化树分析第48-49页
     ·P.stutzeri A1501 中 CbrA、CbrB 的结构分析第49-50页
     ·cbrA 突变株和野生型 A1501 生长曲线的测定第50页
     ·Biolog 分析 cbrA 突变对碳代谢的影响第50-51页
     ·cbrA 突变对氨基酸代谢的影响第51-52页
     ·RNA 的提取第52-53页
     ·正常条件下 cbrA 突变株中 crcZ 和 crc 的表达第53-54页
     ·碳代谢相关基因表达差异第54页
     ·cbrA 基因突变对趋化运动能力的影响第54-55页
   ·讨论第55-57页
第四章 cbrA 突变对氮代谢的影响第57-65页
   ·材料第57-58页
     ·菌株第57页
     ·培养基、化学试剂、仪器第57-58页
   ·方法第58-60页
     ·菌株验证第58页
     ·固氮酶活测定第58-59页
     ·RNA 提取、DNA 消化及 RNA 反转录第59页
     ·实时定量第59页
     ·细菌反硝化能力的测定第59-60页
   ·结果分析第60-63页
     ·cbrA 突变对固氮酶活性的影响第60页
     ·固氮条件下 RNA 的提取第60-61页
     ·固氮相关基因表达差异分析第61-62页
     ·cbrA 突变对细菌反硝化能力的影响第62-63页
   ·讨论第63-65页
第五章 全文结论第65-66页
参考文献第66-72页
致谢第72-73页
作者简历第73页

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