| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| §1.1 研究背景介绍 | 第9-11页 |
| §1.2 本文的研究内容及意义 | 第11-13页 |
| 第二章 DNA计算理论基础 | 第13-25页 |
| §2.1 形式语言与自动机理论介绍 | 第13-18页 |
| §2.1.1 字符集和语言 | 第13-14页 |
| §2.1.2 乔姆斯基(Chomsky)文法系统 | 第14-15页 |
| §2.1.3 自动机和转换器 | 第15-18页 |
| §2.2 DNA计算的生物学基础 | 第18-23页 |
| §2.2.1 DNA分子的结构 | 第18-19页 |
| §2.2.2 工具酶与载体 | 第19-20页 |
| §2.2.3 DNA分子的操作 | 第20-23页 |
| §2.2.4 DNA计算的生化操作 | 第23页 |
| §2.3 本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 DNA计算系统的理论模型 | 第25-40页 |
| §3.1 NP问题概述 | 第25-26页 |
| §3.2 Adleman-Lipton实验介绍 | 第26-29页 |
| §3.2.1 Adleman实验 | 第26-28页 |
| §3.2.2 Lipton实验 | 第28-29页 |
| §3.3 理论DNA计算模型 | 第29-33页 |
| §3.3.1 Adleman-Lipton实验的形式化 | 第29-31页 |
| §3.3.2 DNA分子碱基序列的抽象表达及其结构分析 | 第31-33页 |
| §3.4 基于酶催化的DNA计算模型 | 第33-39页 |
| §3.4.1 剪接系统模型 | 第33-35页 |
| §3.4.2 带剪接规则的插入-切割DNA计算系统(OIC) | 第35-36页 |
| §3.4.3 带剪接规则的插入-切割DNA计算系统的图灵机表达能力 | 第36-39页 |
| §3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 基于碱基匹配的DNA计算模型 | 第40-53页 |
| §4.1 碱基互补配对原则的数学表示 | 第40-41页 |
| §4.2 基于互补配对原则的字符操作 | 第41-44页 |
| §4.3 粘贴系统及其扩展 | 第44-52页 |
| §4.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 第五章 碱基匹配计算系统的编码理论 | 第53-68页 |
| §5.1 DNA碱基编码问题的产生 | 第53-54页 |
| §5.2 匹配计算的编码问题分析 | 第54-62页 |
| §5.3 基于DNA单链的编码构造 | 第62-66页 |
| §5.4 基于分子生物操作的DNA语言的f特性 | 第66-67页 |
| §5.5 本章小结 | 第67-68页 |
| 第六章 结论与展望 | 第68-71页 |
| §6.1 本文的结论 | 第68-69页 |
| §6.1.1 主要结论 | 第68页 |
| §6.1.2 存在的问题 | 第68-69页 |
| §6.2 研究展望 | 第69-71页 |
| 附录 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-79页 |
| 在读期间公开发表的论文和承担科研项目及取得成果 | 第79-80页 |
| 一、论文 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
