| 扉页 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| 英文缩略 | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-27页 |
| 1．1 线粒体的生物学基础 | 第11-12页 |
| 1．1．1 线粒体的形态、功能和组成 | 第11-12页 |
| 1．2．2 线粒体的起源研究 | 第12页 |
| 1．2 线粒体基因组的研究进展 | 第12-23页 |
| 1．2．1 线粒体基因组多态性研究 | 第12-13页 |
| 1．2．1．1 线粒体基因组的形态多态性 | 第12-13页 |
| 1．2．1．2 线粒体基因组的大小多态性 | 第13页 |
| 1．2．1．3 线粒体基因组基因的存在方式 | 第13页 |
| 1．2．2 线粒体基因组的组成和结构研究 | 第13-15页 |
| 1．2．2．1 线粒体基因组成特点 | 第13-14页 |
| 1．2．2．2 线粒体基因结构特点 | 第14-15页 |
| 1．2．3 mtDNA的复制和表达调控研究 | 第15-16页 |
| 1．2．3．1 mtDNA的复制 | 第15页 |
| 1．2．3．2 mtDNA的转录与转录后加工 | 第15-16页 |
| 1．2．3．3 线粒体蛋白质基因的翻译 | 第16页 |
| 1．2．3．4 线粒体基因表达产物的定位和功能 | 第16页 |
| 1．2．4 线粒体基因组与核基因组的关系研究 | 第16-17页 |
| 1．2．4．1 核基因组对线粒体基因表达的调控 | 第16-17页 |
| 1．2．4．2 线粒体基因组对核基因的反馈调节 | 第17页 |
| 1．2．5 线粒体基因组的遗传研究 | 第17页 |
| 1．2．6 线粒体基因组的分子系统学研究 | 第17-23页 |
| 1．2．6．1 mtDNA的进化特点 | 第17-20页 |
| 1．2．6．2 mtDNA在分子系统学上的应用 | 第20页 |
| 1．2．6．3 mtDNA在系统学上的优缺点 | 第20-21页 |
| 1．2．6．4 mtDNA系统学常用的分析方法和分析软件 | 第21-23页 |
| 1．3 绢丝昆虫线粒体基因组的研究进展 | 第23-27页 |
| 1．3．1 主要绢丝昆虫线粒体及其特征 | 第23-25页 |
| 1．3．2 绢丝昆虫线粒体全基因组的研究概况 | 第25-26页 |
| 1．3．3 绢丝昆虫线粒体部分基因及其研究概况 | 第26-27页 |
| 2 引言 | 第27-29页 |
| 2．1 中国野桑蚕线粒体基因组研究意义 | 第27-28页 |
| 2．2 论文研究的主要目的 | 第28页 |
| 2．3 论文的思路和实验方案 | 第28-29页 |
| 3 中国野桑蚕线粒体基因组全序列测定和分析 | 第29-63页 |
| 3．1 材料与方法 | 第29-33页 |
| 3．1．1 材料、主要设备、生化试剂和分析软件 | 第29-30页 |
| 3．1．1．1 供试材料及其处理 | 第29页 |
| 3．1．1．2 主要仪器设备 | 第29页 |
| 3．1．1．3 主要生化试剂 | 第29-30页 |
| 3．1．1．4 主要分析软件 | 第30页 |
| 3．1．2 方法 | 第30-33页 |
| 3．1．2．1 mtDNA的提取方法 | 第30-32页 |
| 3．1．2．1．1 材料处理方法 | 第30页 |
| 3．1．2．1．2 提取方法 | 第30-31页 |
| 3．1．2．1．3 浓度和纯度的检测方法 | 第31-32页 |
| 3．1．2．2 各片段的扩增 | 第32页 |
| 3．1．2．3 克隆方法 | 第32页 |
| 3．1．2．4 测序方法 | 第32-33页 |
| 3．1．2．4．1 测序体系与反应条件 | 第32-33页 |
| 3．1．2．4．2 全序列的拼接 | 第33页 |
| 3．1．2．4．3 全序列的分析方法 | 第33页 |
| 3．2 结果与分析 | 第33-63页 |
| 3．2．1 提取中国野桑蚕线粒体DNA的方法探讨 | 第33-35页 |
| 3．2．1．1 从不同温度的下保存的野桑蚕蛹获得mtDNA的比较 | 第33-34页 |
| 3．2．1．2 用不同的破碎组织细胞方法破碎野桑蚕蛹获得的mtDNA比较 | 第34-35页 |
| 3．2．2 引物的筛选和分析 | 第35-38页 |
| 3．2．3 测序拼接及其全序列分析 | 第38-47页 |
| 3．2．3．1 中国野桑蚕线粒体基因组总体分析 | 第38-47页 |
| 3．2．3．1．1 基因组成和结构排列 | 第38-40页 |
| 3．2．3．1．2 酶切图谱分析 | 第40-42页 |
| 3．2．3．1．3 线粒体基因组全序列的分析 | 第42-47页 |
| （1） 基因组成和排列的整体比较 | 第42页 |
| （2） 全序列中突变的比较 | 第42-44页 |
| （3） 核苷酸的组成基建及使用偏好性比较 | 第44-45页 |
| （4） 与日野和夏芳线粒体基因组限制性酶切图谱比较 | 第45-47页 |
| 3．2．4 中国野桑蚕mtDNA中各类基因的分析 | 第47-57页 |
| 3．2．4．1 蛋白质编码基因 | 第47-50页 |
| 3．2．4．1．1 中国野桑蚕mtDNA密码子的利用情况 | 第47-48页 |
| 3．2．4．1．2 中国野桑蚕蛋白编码基因的密码子的位置碱基组成及含量 | 第48-49页 |
| 3．2．4．1．3 中国野桑蚕与其它物种蛋白编码基因密码子各位置碱基组成比较 | 第49-50页 |
| 3．2．4．2 tRNA的组成及二级结构分析 | 第50-55页 |
| 3．2．4．3 rRNA基因及其二级结构的预测 | 第55-57页 |
| 3．2．5 中国野桑蚕线粒体基因组的系统分析 | 第57-63页 |
| 3．2．5．1 基于COI部分基因序列的系统学分析 | 第57-59页 |
| 3．2．5．2 基于线粒体基因组和基因的基因树构建和分析 | 第59-63页 |
| 4 讨论 | 第63-68页 |
| 4．1 不同方法对线粒体DNA的提取影响 | 第63页 |
| 4．2 线粒体基因组tRNA的二级结构变化及特征 | 第63-64页 |
| 4．3 线粒体基因组的组成和结构排列比较分析 | 第64页 |
| 4．4 限制性内切酶酶切图谱分析 | 第64-65页 |
| 4．5 线粒体基因组各种系统树分析 | 第65页 |
| 4．6 中国野桑蚕、日本野桑蚕和家蚕的关系 | 第65-68页 |
| 5 小结 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 英文摘要 | 第77-81页 |
| 附录1： 中国野桑蚕线粒体基因组及基因标记 | 第81-94页 |
| 附录2： 与日本野桑蚕和加餐品种“夏芳”比较的 | 第94-110页 |
| 附录3： 研究生期间发表的论文 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
