| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-17页 |
| ·肠癌和肝癌简介 | 第10-11页 |
| ·基于“系统论”的代谢组学技术简介 | 第11-15页 |
| ·立题依据 | 第15-17页 |
| 第二章 临床样本采集和GC/TOF-MS 仪器分析 | 第17-25页 |
| ·肠癌、肝癌和正常样本采集 | 第18-20页 |
| ·肠癌样本的采集 | 第18-19页 |
| ·肝癌样本的采集 | 第19-20页 |
| ·正常样本的采集 | 第20页 |
| ·GC/TOF-MS 仪器分析 | 第20-23页 |
| ·三甲基硅烷（TMS）衍生方法 | 第20-21页 |
| ·GC/TOF-MS 仪器分析血清样本实验条件 | 第21页 |
| ·GC/TOF-MS 血清分析结果 | 第21-23页 |
| ·GC/TOF-MS 仪器分析信息提取 | 第23页 |
| ·本章 小结 | 第23-25页 |
| 第三章 代谢组学数据处理方法的比较与选择 | 第25-47页 |
| ·数据预处理 | 第25-34页 |
| ·归一化方法（Normalization） | 第25-26页 |
| ·数据转换（Data transformation） | 第26-32页 |
| ·正态分布（高斯分布）及其评价方法 | 第26-27页 |
| ·次方转换（Power transformation） | 第27-28页 |
| ·Power transformation 在肠/肝癌血清数据分析中的应用 | 第28-32页 |
| ·数据标准化（中心化centering /标度化Scaling） | 第32-34页 |
| ·多维/单维统计方法比较分析 | 第34-45页 |
| ·实验用数据信息 | 第34-35页 |
| ·多维统计方法简介 | 第35-37页 |
| ·主成分分析 | 第35-36页 |
| ·(O)PLS-DA 分析 | 第36-37页 |
| ·模型质量评价 | 第37-40页 |
| ·主成分个数的确定 | 第37-38页 |
| ·七次循环交互验证（7-fold cross validation） | 第38-39页 |
| ·响应排序检验（response permutation testing, RPT） | 第39页 |
| ·CV-ANOVA | 第39-40页 |
| ·费歇尔线性（FLDA ）判别分析 | 第40页 |
| ·“多标准”筛选差异性变量 | 第40-42页 |
| ·单维分析 | 第42-45页 |
| ·单维/多维分析结果 | 第42-43页 |
| ·单维/多维方法比较 | 第43页 |
| ·动物实验和临床试验的代谢组学数据比较 | 第43-45页 |
| ·本章 小结 | 第45-47页 |
| 第四章 肝癌和肠癌血清代谢模式分析 | 第47-65页 |
| ·肝癌和肠癌两种疾病独立分析 | 第48-57页 |
| ·独立建模分析 | 第48-50页 |
| ·模型质量评价和验证 | 第50-54页 |
| ·OPLS-DA 模型预测 | 第51-52页 |
| ·FLDA 分析 | 第52-54页 |
| ·差异性变量单维统计验证 | 第54页 |
| ·相关性研究 | 第54-57页 |
| ·“一对多”多维分析 | 第57-64页 |
| ·肠癌V.S. Rest, 肝癌V.S. Rest, 正常V.S. Rest 建模 | 第58-59页 |
| ·差异性变量考察 | 第59-64页 |
| ·单维统计验证 | 第60页 |
| ·差异性变量考察 | 第60-64页 |
| ·本章 小结 | 第64-65页 |
| 第五章 研究工作总结与展望 | 第65-67页 |
| ·研究工作总结 | 第65-66页 |
| ·论文创新点 | 第66页 |
| ·展望 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-72页 |
