基于HMM模型的启动子预测系统的设计与实现
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-24页 |
| ·启动子 | 第8-16页 |
| ·启动子预测的意义 | 第8-9页 |
| ·启动子的结构和功能 | 第9-16页 |
| ·启动子的结构 | 第9-13页 |
| ·启动子的功能 | 第13-14页 |
| ·启动子预测的现状 | 第14-16页 |
| ·HMM | 第16-22页 |
| ·马尔可夫模型介绍 | 第16页 |
| ·HMM介绍 | 第16-22页 |
| ·HMM的定义 | 第16-17页 |
| ·HMM的可解决的问题及算法 | 第17-21页 |
| ·HMM的类型 | 第21-22页 |
| ·HMM的应用 | 第22页 |
| ·HMM应用于启动子预测的可行性分析 | 第22-24页 |
| ·生物序列的数据化特性 | 第22页 |
| ·HMM在生物序列分析中的应用 | 第22-24页 |
| 第二章 系统的设计与实现 | 第24-41页 |
| ·系统的整体设计 | 第24-29页 |
| ·启动子的HMM数学模型的构建 | 第24-25页 |
| ·系统功能设计 | 第25页 |
| ·系统的架构 | 第25-27页 |
| ·系统模块设计 | 第27-29页 |
| ·系统的具体实现 | 第29-41页 |
| ·系统的开发环境 | 第29页 |
| ·系统类的设计与实现 | 第29-38页 |
| ·Promoter_Hmm类的设计与实现 | 第30-31页 |
| ·Forward_Backward类的设计与实现 | 第31-33页 |
| ·BaumWelch类的设计与实现 | 第33-35页 |
| ·Hmm DB.class的设计与实现 | 第35-38页 |
| ·数据库设计与实现 | 第38-40页 |
| ·数据库的设计 | 第38页 |
| ·数据库表设计 | 第38-40页 |
| ·系统实现中的问题与解决方案 | 第40-41页 |
| 第三章 实验验证 | 第41-45页 |
| ·数据集的选取 | 第41-42页 |
| ·结果与分析 | 第42-45页 |
| ·验证结果 | 第42-44页 |
| ·结果分析 | 第44-45页 |
| ·启动子预测软件的评估参数 | 第44页 |
| ·本系统的各项指标分析 | 第44-45页 |
| 第四章 结论与展望 | 第45-46页 |
| ·结论 | 第45页 |
| ·展望 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-49页 |
