摘要 | 第1-7页 |
Abstract | 第7-14页 |
第一章 引言 | 第14-31页 |
第一节 DNA的拓扑结构与功能 | 第14-20页 |
·DNA结构 | 第14-17页 |
·DNA拓扑结构的研究现状 | 第17-20页 |
第二节 DNA拓扑异构酶 | 第20-26页 |
·拓扑异构酶的分类 | 第20-22页 |
·大肠杆菌中的DNA拓扑异构酶 | 第22-26页 |
第三节 研究DNA拓扑结构的方法 | 第26-30页 |
·沉降系数的测定 | 第26页 |
·琼脂糖凝胶电泳 | 第26-27页 |
·原子力显微镜技术 | 第27-30页 |
第四节 研究DNA拓扑结构与拓扑异构酶的意义 | 第30-31页 |
第二章 材料和方法 | 第31-41页 |
第一节 实验材料 | 第31-33页 |
·实验所用的菌株和质粒 | 第31页 |
·实验试剂 | 第31-33页 |
·实验仪器及设备 | 第33页 |
第二节 实验方法 | 第33-41页 |
·感受态细胞的制备 | 第33-34页 |
·质粒DNA的转化 | 第34页 |
·质粒的小量制备 | 第34-35页 |
·质粒的大量制备 | 第35页 |
·质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳 | 第35-36页 |
·质粒DNA的氯喹-琼脂糖凝胶电泳 | 第36页 |
·原子力显微镜制样 | 第36页 |
·碱变性DNA的制备 | 第36-37页 |
·拓扑异构酶Ⅲ的表达纯化 | 第37-38页 |
·细胞抽提物的制备 | 第38页 |
·各种DNA拓扑异构酶酶反应系统 | 第38-39页 |
·地高辛标记的探针DNA的制备 | 第39页 |
·Southern blot | 第39-40页 |
·超螺旋DNA的切刻反应 | 第40-41页 |
第三章 超螺旋DNA碱变构的研究 | 第41-56页 |
第一节 超螺旋DNA碱变构 | 第42-47页 |
·碱变性超螺旋DNA的电泳行为 | 第42-43页 |
·碱变性超螺旋DNA的原子力显微镜(AFM)成像结果 | 第43-45页 |
·质粒DNA Ⅰ与DNA Ⅳ的结构参数比较 | 第45-47页 |
第二节 DNA碱变性的深入研究 | 第47-53页 |
·DNA Ⅳ的限制酶切割研究 | 第47-49页 |
·DNA Ⅳ的拓扑异构酶作用研究 | 第49-52页 |
·开环质粒DNA的碱变性结构的研究 | 第52-53页 |
第三节 本章小结 | 第53-56页 |
第四章 DNA螺线型超螺旋和分子内拓扑交联 | 第56-87页 |
第一节 分子内拓扑交联的结构特征 | 第58-71页 |
·分子内拓扑交联使质粒DNA分子分割成拓扑状态不同的结构域 | 第58-60页 |
·质粒DNA分子内交联与电泳行为的相关性 | 第60-65页 |
·DNA分子内拓扑交联度与分子直径的相关性 | 第65-67页 |
·细胞cccDNA被位点特异单链切割酶解除分子内拓扑交联是个耗时过程 | 第67-70页 |
·线性DNA分子自连成cccDNA后不产生分子内拓扑交联 | 第70-71页 |
第二节 DNA分子拓扑交联和DNA拓扑酶 | 第71-81页 |
·拓扑异构酶对超螺旋DNA的作用 | 第71-73页 |
·拓扑异构酶对松弛底物的作用 | 第73-74页 |
·Ⅱ型拓扑异构酶的作用 | 第74-76页 |
·大肠杆菌拓扑异构酶Ⅲ的作用 | 第76-81页 |
第三节 四种DNA拓扑异构酶在细胞内有不同的生物学功能 | 第81-85页 |
第四节 本章小结 | 第85-87页 |
第五章 原子力显微镜观测DNA样品的影响因子分析 | 第87-107页 |
第一节 观测结果的评价方法 | 第88-90页 |
·评价AFM下DNA分子展开程度的参数 | 第88-90页 |
·评价AFM下DNA分子分散程度的参数 | 第90页 |
第二节 样品溶液中Mg~(2+)对AFM观测DNA分子的影响 | 第90-94页 |
·样品溶液中Mg~(2+)浓度对AFM下DNA各项参数的影响 | 第91-92页 |
·样品溶液中Mg~(2+)浓度对AFM下DNA成像效果的综合评价 | 第92-94页 |
第三节 样品溶液中DNA浓度对AFM观测DNA分子的影响 | 第94-98页 |
·样品溶液中DNA分子浓度对AFM下DNA各项参数的影响 | 第94-96页 |
·样品溶液中DNA浓度对AFM下DNA成像效果的综合评价 | 第96-98页 |
第四节 环境中相对湿度对AFM观测DNA分子的影响 | 第98-102页 |
·环境中相对湿度对AFM下DNA各项参数的影响 | 第98-100页 |
·环境相对湿度对AFM下DNA成像效果的综合评价 | 第100-102页 |
第五节 AFM观测DNA分子最适条件下的各项参数及应用 | 第102-103页 |
·AFM观测DNA分子最适条件下的各项参数 | 第102页 |
·应用最适条件的实际测量结果 | 第102-103页 |
第六节 其他次要影响因素 | 第103-106页 |
·DNA样品干燥方式对质粒DNA AFM成像质量的影响 | 第103-105页 |
·其他因素 | 第105-106页 |
第七节 本章小结 | 第106-107页 |
第六章 结论 | 第107-109页 |
参考文献 | 第109-117页 |
致谢 | 第117-118页 |
个人简历 | 第118页 |
在学期间发表的学术论文 | 第118页 |