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2017年云南西双版纳地区登革热流行株的分子特征分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
前言第8-17页
    1.登革病毒简介第8-11页
    2. 登革疫苗的研究进展第11-13页
    3. 登革热的全球流行情况第13-16页
    4. 本研究的目的和意义第16-17页
一、实验材料与仪器第17-18页
    1. 细胞株、临床血液样品及培养基第17页
    2.主要试剂、仪器设备第17-18页
二、实验方法第18-25页
    (一) 云南省近年登革热流行病学调查第18页
    (二) 登革病毒1型Ⅰ-V基因亚型的基因组差异分析第18页
        1. DENV-1基因亚型之间的基因组序列和氨基酸序列的相似度分析第18页
        2. DENV-1不同亚型的3'UTR的二级结构预测第18页
    (三) 2017年云南省登革Ⅰ型病毒分离株NS1基因鉴定及分析第18-22页
        1. DENV的型别鉴定第18-20页
        2. DENV-1的NS1片段的特异性扩增第20页
        3. NS1的核苷酸及氨基酸BLAST比对第20-21页
        4. 基于NS1基因进化树的构建第21-22页
    (四) 2017年引起云南爆发登革热的病毒的全基因特征及起源分析第22-25页
        1. 登革临床样品的型别鉴定第22页
        2. DENV-1全基因的扩增、测序及拼接第22-24页
        3. 全基因进化发育分析第24页
        4. DENV-1全基因的特征分析第24-25页
三.实验结果及讨论第25-61页
    (一)云南2010年至2017年登革热流行病学调査第25-30页
    (二) 登革病毒1型Ⅰ-Ⅴ基因亚型的基因组差异分析第30-37页
        1. DENV-1基因亚型之间的基因组序列和氨基酸序列的相似度分析第30-35页
        2 DENV-1不同亚型的3'UTR的二级结构预测第35-36页
        3. 讨论第36-37页
    (三) 2017年云南省登革Ⅰ型病毒分离株NS1基因鉴定及分析第37-43页
        1. DENV的型别鉴定第37-38页
        2. DENV-1的NS1片段的特异性扩增第38-39页
        3. NS1的核苷酸及氨基酸BLAST比对第39-40页
        4. NS1基因进化树的构建第40-42页
        5. 讨论第42-43页
    (四) 2017年引起云南爆发登革热的病毒的全基因特征及起源分析第43-61页
        1. 登革临床样品的型别鉴定第43-44页
        2. DENV-1全基因的扩增及碱基序列分析第44-45页
        3. DENV-1全基因的进化树分析第45-48页
        4. DENV-1碱基及氨基酸突变情况第48-52页
        5. DENV-1非编码区的RNA二级结构预测第52-53页
        6. DENV-1 CDS区域的蛋白质二级结构分析第53-57页
        7. 讨论第57-61页
全文小结第61-64页
参考文献第64-68页
致谢第68-69页
个人简历第69-70页

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