| 本研究的创新点 | 第5-9页 |
| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-28页 |
| 1.1 小麦白粉病的危害 | 第16页 |
| 1.2 小麦白粉菌的主要特征及生活史 | 第16-18页 |
| 1.3 小麦白粉菌的小种分化 | 第18-20页 |
| 1.4 禾谷类白粉菌无毒基因研究进展 | 第20-23页 |
| 1.4.1 无毒基因与寄主R基因的识别模型 | 第20-21页 |
| 1.4.2 无毒基因与寄主R基因的互作类型 | 第21-22页 |
| 1.4.3 无毒基因的变异机制 | 第22页 |
| 1.4.4 禾谷类白粉菌无毒基因 | 第22-23页 |
| 1.5 禾谷类白粉菌产孢相关基因研究进展 | 第23-26页 |
| 1.5.1 BrlA调控途径 | 第23-24页 |
| 1.5.2 G蛋白介导的信号转导途径 | 第24页 |
| 1.5.3 钙离子(Ca~(2+)),MAPK( mitogen-activated protein kinase)和活性氧(reactive oxygenspecies,ROS)介导的信号通路 | 第24-25页 |
| 1.5.4 不同真菌产孢过程涉及的其他调控因子 | 第25页 |
| 1.5.5 白粉菌产孢相关基因研究进展 | 第25-26页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第26-28页 |
| 第二章 我国小麦白粉菌致病型多样性分析 | 第28-44页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 2.1.1 鉴别寄主 | 第28页 |
| 2.1.2 白粉菌标样的采集 | 第28-29页 |
| 2.1.3 单孢子菌株的分离、扩繁及保存 | 第29页 |
| 2.1.4 苗期致病性测定 | 第29-30页 |
| 2.1.5 侵染型的调查和致病型的表示 | 第30页 |
| 2.1.6 毒性复杂度及毒性频率的计算 | 第30页 |
| 2.1.7 Pm基因有效性分析 | 第30页 |
| 2.1.8 菌株群体内及群体间多样性指数的计算 | 第30-31页 |
| 2.1.9 成对无毒基因位点之间的关联分析 | 第31页 |
| 2.2 结果与分析 | 第31-40页 |
| 2.2.1 毒性频率 | 第31-34页 |
| 2.2.2 致病型和毒性复杂度 | 第34-36页 |
| 2.2.3 群体多样性和遗传距离 | 第36-38页 |
| 2.2.4 无毒基因位点之间的关联分析 | 第38-40页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第40-44页 |
| 第三章 小麦白粉菌AvrPm2候选基因的克隆 | 第44-78页 |
| 3.1 材料与方法 | 第44-51页 |
| 3.1.1 菌株的来源及致病型 | 第44页 |
| 3.1.2 基因组DNA样品的制备和提取 | 第44-45页 |
| 3.1.3 RNA样品的制备和提取 | 第45-46页 |
| 3.1.4 基因组文库的构建和测序 | 第46页 |
| 3.1.5 转录组文库的构建及测序 | 第46-47页 |
| 3.1.6 基因组大小的估算和组装 | 第47页 |
| 3.1.7 基因预测 | 第47-48页 |
| 3.1.8 基因功能注释 | 第48页 |
| 3.1.9 SNP、InDel及PAV的鉴定 | 第48-49页 |
| 3.1.10 Effector基因的预测 | 第49-50页 |
| 3.1.11 Effector基因的变异及表达特征分析 | 第50页 |
| 3.1.12 表型与基因型数据的关联分析 | 第50页 |
| 3.1.13 候选无毒基因的PCR确认 | 第50-51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-74页 |
| 3.2.1 100个菌株的地理来源和致病型多样性 | 第51页 |
| 3.2.2 基因组序列的组装和质量评估 | 第51-59页 |
| 3.2.3 重复序列和非编码RNA的预测 | 第59-61页 |
| 3.2.4 基因预测 | 第61页 |
| 3.2.5 基因注释 | 第61-64页 |
| 3.2.6 Effector基因的预测及表达谱分析 | 第64-65页 |
| 3.2.7 99个菌株在基因组水平上的变异 | 第65页 |
| 3.2.8 AvrPm2候选基因的鉴定 | 第65-72页 |
| 3.2.9 AvrPm2候选基因的PCR验证 | 第72页 |
| 3.2.10 AvrPm2候选基因的序列,注释及表达特征分析 | 第72-74页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第74-78页 |
| 第四章 小麦白粉菌产孢相关差异表达基因分析 | 第78-123页 |
| 4.1 材料与方法 | 第78-83页 |
| 4.1.1 菌株的培养和接种 | 第78页 |
| 4.1.2 转录组测序组织样的准备和RNA的提取 | 第78页 |
| 4.1.3 总RNA的检测和文库的构建及测序 | 第78-79页 |
| 4.1.4 序列质量的评估 | 第79页 |
| 4.1.5 基因差异表达分析 | 第79页 |
| 4.1.6 差异表达基因的注释 | 第79-80页 |
| 4.1.7 定量反转录PCR分析(quantitative reverse-transcriptase PCR, qRT-PCR) | 第80-81页 |
| 4.1.8 参与基础代谢的基因的鉴定 | 第81页 |
| 4.1.9 参与信号通路和转录调控基因的鉴定 | 第81页 |
| 4.1.10 B.graminis特有基因的鉴定 | 第81-82页 |
| 4.1.11 EGTA和TFP的处理 | 第82页 |
| 4.1.12 染色和组织学观察 | 第82-83页 |
| 4.1.13 统计分析 | 第83页 |
| 4.2 结果与分析 | 第83-114页 |
| 4.2.1 小麦白粉菌的无性发育过程 | 第83-84页 |
| 4.2.2 高质量RNA-seq数据的获得 | 第84-85页 |
| 4.2.3 产孢阶段的基因差异表达分析 | 第85-93页 |
| 4.2.4 参与碳水化合物代谢,能量代谢和不饱和脂肪酸代谢的差异表达基因分析 | 第93-99页 |
| 4.2.5 抗氧化系统的激活及H_2O_2在分生孢子梗中的积累 | 第99-100页 |
| 4.2.6 白粉菌产孢过程中参与主要信号通路和转录调控的差异表达基因分析 | 第100-110页 |
| 4.2.7 Ca~(2+)螯合剂EGTA和钙调蛋白抑制剂TFP对白粉菌产孢和H_2O_2产生的影响 | 第110-112页 |
| 4.2.8 B.graminis特有基因 | 第112-114页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第114-123页 |
| 第五章 一个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因STPK2的功能分析 | 第123-141页 |
| 5.1 材料与方法 | 第123-128页 |
| 5.1.1 供试菌株、品种和载体 | 第123页 |
| 5.1.2 菌株的接种、培养和品种的种植 | 第123-124页 |
| 5.1.3 目标基因的选择及其序列分析 | 第124页 |
| 5.1.4 VIGS载体的构建 | 第124-127页 |
| 5.1.5 质粒载体导入农杆菌 | 第127页 |
| 5.1.6 农杆菌渗入烟草和病毒的接种 | 第127页 |
| 5.1.7 RNA的提取和qRT-PCR分析 | 第127-128页 |
| 5.1.8 组织学染色及显微调查 | 第128页 |
| 5.1.9 统计分析 | 第128页 |
| 5.2 结果与分析 | 第128-138页 |
| 5.2.1 目标基因的选择及序列分析 | 第128-131页 |
| 5.2.2 目标基因靶向区域的预测及脱靶分析 | 第131-132页 |
| 5.2.3 VIGS载体构建 | 第132-134页 |
| 5.2.4 病毒接种体的获得和病毒的接种 | 第134页 |
| 5.2.5 目标基因在小麦中的沉默 | 第134-136页 |
| 5.2.6 目标基因沉默对小麦白粉菌发育的影响 | 第136-138页 |
| 5.3 结论与讨论 | 第138-141页 |
| 参考文献 | 第141-155页 |
| 攻博期间取得的科研成果 | 第155-156页 |
| 致谢 | 第156-157页 |
