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阴沟肠杆菌嗜盐α-淀粉酶的基因克隆、表达及嗜盐特性研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
目录第8-13页
第一章 前言第13-26页
    1.1 淀粉酶概述第13-14页
        1.1.1 淀粉酶的来源第13页
        1.1.2 淀粉酶的分类第13-14页
            1.1.2.1 按产物的异头碳原子的构型分类第13-14页
            1.1.2.2 按生物学来源分类第14页
            1.1.2.3 按作用方式分类第14页
            1.1.2.4 按底物体系粘度进行分类第14页
            1.1.2.5 按产物专一性分类第14页
    1.2 嗜盐微生物概述第14-18页
        1.2.1 嗜盐微生物的生态环境和生理机能第16页
        1.2.2 嗜盐微生物的嗜盐适应机理第16-18页
            1.2.2.1 Na~+依存性第16-17页
            1.2.2.2 酶的盐适应性第17页
            1.2.2.3 嗜盐微生物的质膜、色素和H+泵的作用第17页
            1.2.2.4 排盐作用第17页
            1.2.2.5 细胞内溶质浓度的调节第17-18页
            1.2.2.6 耐盐基因片段第18页
    1.3 嗜盐酶简述第18-22页
        1.3.1 产嗜盐酶的微生物第18-20页
            1.3.1.1 产嗜盐淀粉酶的微生物第19页
            1.3.1.2 嗜盐蛋白酶的微生物第19页
            1.3.1.3 嗜盐木聚糖酶微生物第19页
            1.3.1.4 嗜盐纤维素酶和支链淀粉酶第19页
            1.3.1.5 嗜盐脂肪酶第19-20页
            1.3.1.6 嗜盐几丁质酶,DNA酶,支链淀粉酶,菊粉酶第20页
        1.3.2 嗜盐酶的发展研究第20页
        1.3.3 嗜盐酶的应用第20-21页
        1.3.4 嗜盐酶有关嗜盐特性的研究第21-22页
    1.4 酶分子改造第22-24页
        1.4.1 定点突变第22页
        1.4.2 定向进化第22-23页
        1.4.3 截断表达第23页
        1.4.4 融合表达第23页
        1.4.5 密码子优化第23页
        1.4.6 mRNA结构改造第23-24页
        1.4.7 GC含量调整第24页
    1.5 立题依据及意义第24-25页
    1.6 实验技术路线第25-26页
第二章 材料和方法第26-36页
    2.1 材料第26-27页
        2.1.1 土样的采集第26页
        2.1.2 菌株和质粒第26页
        2.1.3 主要试剂和酶第26-27页
            2.1.3.1 主要试剂第26-27页
            2.1.3.2 酶制剂第27页
        2.1.4 各种培养基的配方第27页
        2.1.5 主要的仪器以及设备第27页
    2.2 实验的具体方法及步骤第27-36页
        2.2.1 样品菌体的收集第27页
        2.2.2 菌株的鉴定第27-28页
            2.2.2.1 细菌16SrDNA扩增第27-28页
            2.2.2.2 菌株的鉴定第28页
        2.2.3 细菌总DNA的提取第28页
        2.2.4 质粒提取方法第28页
        2.2.5 感受态的制备以及转化第28页
        2.2.6 重组质粒的构建第28-31页
            2.2.6.1 引物设计第28-29页
            2.2.6.2 目的片段PCR扩增第29页
            2.2.6.3 目的片段的双酶切第29-30页
            2.2.6.4 重组质粒的构建第30页
            2.2.6.5 重组质粒转JM1 09第30-31页
        2.2.7 重组质粒的验证第31页
            2.2.7.1 双酶切验证第31页
            2.2.7.2 测序验证第31页
        2.2.8 目的基因的诱导表达第31页
        2.2.9 镍柱亲合层析法纯化目的蛋白第31-32页
        2.2.10 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第32页
        2.2.11 测定标准曲线第32-33页
            2.2.11.1 蛋白质标准曲线的测定第32页
            2.2.11.2 葡萄糖标准曲线的测定第32-33页
        2.2.12 淀粉酶酶活力的测定第33页
        2.2.13 酶学性质相关研究第33-34页
        2.2.14 HPLC对嗜盐淀粉酶水解淀粉产物的分析第34页
        2.2.15 同源建模及突变位点的选择第34页
        2.2.16 反向PCR介导的定点饱和突变第34-36页
第三章 结果与分析第36-60页
    3.1 培养菌的淀粉酶活力检测第36页
    3.2 菌株总DNA提取第36页
    3.3 16Sr DNA鉴定第36-37页
    3.4 16Sr DNA PCR产物的连接转化第37-38页
    3.5 阴沟肠杆菌的信号肽预测第38-39页
    3.6 阴沟肠杆菌目的基因的克隆第39-40页
    3.7 重组质粒验证第40页
        3.7.1 双酶切验证第40页
        3.7.2 测序验证第40页
    3.8 目的基因的诱导及表达第40-41页
    3.9 重组酶的酶学性质第41-50页
        3.9.1 嗜盐酶与EDTA螯合后的酶活情况第41-42页
        3.9.2 嗜盐酶在不同缓冲液下的酶活情况第42页
        3.9.3 嗜盐酶在不同溶液中的酶活情况第42-43页
        3.9.4 嗜盐α-淀粉酶的最适温度第43页
        3.9.5 嗜盐α-淀粉酶的最适pH第43-44页
        3.9.6 嗜盐α-淀粉酶的最适NaCl浓度第44页
        3.9.7 嗜盐α-淀粉酶的热稳定性第44-45页
        3.9.8 嗜盐α-淀粉酶的pH稳定性第45-46页
        3.9.9 EDTA对嗜盐α-淀粉酶酶活性的影响第46-47页
        3.9.10 Ca~(2+)对嗜盐α-淀粉酶稳定性的影响第47页
        3.9.11 金属离子对嗜盐α-淀粉酶酶活性的影响第47-48页
        3.9.12 嗜盐α-淀粉酶的底物特异性第48页
        3.9.13 HPLC对嗜盐α-淀粉酶水解的淀粉产物分析第48-49页
        3.9.14 嗜盐α-淀粉酶的比活力测定第49-50页
        3.9.15 嗜盐α-淀粉酶的Vmax和Km值第50页
    3.10 嗜盐α-淀粉酶嗜盐机理的研究第50-52页
        3.10.1 突变位点的选择第50-51页
        3.10.2 突变位点418饱和突变第51-52页
        3.10.3 突变氨基酸研究第52页
    3.11 突变酶的酶学性质第52-60页
        3.11.1 突变酶的反向PCR扩增及诱导表达第53-54页
        3.11.2 突变酶最适温度第54-55页
            3.11.2.1 有NaCl情况下的最适温度第54页
            3.11.2.2 无NaCl情况下的最适温度第54-55页
        3.11.3 突变酶最适pH第55-56页
            3.11.3.1 在有NaCl情况下的最适pH第55-56页
            3.11.3.2 在无NaCl情况下的最适pH第56页
        3.11.4 突变酶最适NaCl浓度第56-57页
        3.11.5 突变酶的Vmax和Km值第57-60页
            3.11.5.1 有NaCl情况下的Vmax和Km值第57-58页
            3.11.5.2 无NaCl情况下的Vmax和Km值第58-60页
第四章 讨论第60-64页
    4.1 嗜盐淀粉酶第60页
    4.2 嗜盐机理的研究第60-64页
第五章 结论与展望第64-66页
    5.1 结论第64页
    5.2 问题和展望第64-66页
参考文献第66-73页
附录1第73-76页
附录2第76-79页
附录3第79-81页
附录4第81-85页
致谢第85-86页
攻读硕士学位期间发表的学术论文目录第86页

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