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长角血蜱卵小RNA高通量测序及两个microRNA的表达分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
前言第12-22页
    1.1 MIRNA的概述第12-15页
        1.1.1 miRNA的概念及特征第12页
        1.1.2 miRNA的发现第12-13页
        1.1.3 miRNA的生物合成第13-14页
        1.1.4 miRNA的作用机制第14-15页
        1.1.5 miRNA的特异性第15页
    1.2 MIRNA的研究方法第15-20页
        1.2.1 正向遗传学法第15-16页
        1.2.2 直接克隆法第16-17页
        1.2.3 生物信息学法第17-19页
        1.2.4 Northern杂交第19页
        1.2.5 原位杂交第19页
        1.2.6 基因芯片第19-20页
        1.2.7 荧光定量PCR(real-time quantitation PCR,RT-qPCR)第20页
        1.2.8 高通量测序第20页
    1.3 结语第20-22页
第二章 SOLEXA高通量测序检测卵中MIRNA及其生物信息学分析第22-38页
    2.1 材料第22-23页
        2.1.1 实验动物第22页
        2.1.2 实验试剂第22页
        2.1.3 主要仪器设备第22-23页
    2.2 方法第23-29页
        2.2.1 长角血蜱卵中Total RNA的提取与鉴定第23-24页
        2.2.2 样品小RNA文库的建立第24-25页
        2.2.3 高通量测序流程第25-26页
        2.2.4 小RNA高通量测序后的生物信息学分析第26-27页
        2.2.5 荧光定量RT-qPCR验证第27-29页
    2.3 结果第29-35页
        2.3.1 miRNA的分离与鉴定第29页
        2.3.2 Solex测序结果生物信息学分析第29-32页
        2.3.3 保守miRNAs的碱基偏向性第32页
        2.3.4 新miRNAs的分析第32-34页
        2.3.5 实时荧光定量PCR对数据库的验证结果第34-35页
    2.4 讨论第35-38页
第三章 SYBR GREEN I实时荧光定量PCR检测方法的建立第38-47页
    3.1 材料第38-39页
        3.1.1 实验动物第38页
        3.1.2 实验试剂第38页
        3.1.3 实验仪器设备第38页
        3.1.4 miRNAs的引物序列第38-39页
    3.2 方法第39-40页
        3.2.1 样品的准备第39页
        3.2.2 Total RNA的提取第39页
        3.2.3 Total RNAs纯度及浓度的鉴定第39页
        3.2.4 变性胶电泳检测第39页
        3.2.5 miRNA的反转录第39页
        3.2.6 Stem-loop RT-qPCR实验第39-40页
        2.2.7 荧光定量PCR标准曲线的建立及可靠性检验第40页
    3.3 结果第40-45页
        3.3.1 miRNA的分离与鉴定第40-41页
        3.3.2 miR-184、miR-275、β-actin基因的普通PCR扩增第41-42页
        3.3.3 荧光定量PCR标准曲线及扩增曲线的建立第42-43页
        3.3.4 溶解曲线分析第43-44页
        3.3.5 重复性检验第44-45页
    3.4 讨论第45-47页
第四章 长角血蜱中MIR-184和MIR-275基因的表达分析第47-52页
    4.1 实验动物及样品收集第47页
    4.2 方法第47页
        4.2.1 Total RNAs的提取第47页
        4.2.2 miR-184和miR-275表达丰度的检测第47页
        4.2.3 数据的分析和处理第47页
    4.3 结果第47-50页
        4.3.1 miR-184的表达情况第47-49页
        4.3.2 miR-275的表达情况第49-50页
    4.4 讨论第50-52页
第五章 全文结论第52-53页
参考文献第53-60页
致谢第60-61页
作者简介第61页

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