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中国柑橘疮痂病菌的种类和变异研究

致谢第6-10页
摘要第10-11页
Abstract第11-12页
第一章 文献综述和研究背景第13-38页
    1. 柑橘疮痂病的研究背景第13-23页
        1.1 柑橘疮痂病的发生历史、国内外分布和危害性第13-15页
            1.1.1 病害的国内外发生历史第13-14页
            1.1.2 病害的分布第14页
            1.1.3 病害的危害性及病害在我国的研究进展第14-15页
                1.1.3.1 病害的危害性第14-15页
                1.1.3.2 病害在我国的研究进展第15页
        1.2 柑橘疮痂病的症状特点第15-17页
        1.3 柑橘疮痂病的病原种类和变异第17-21页
        1.4 病害的发生规律第21-22页
            1.4.1 病害的循环第21页
            1.4.2 病害的侵染寄主第21-22页
            1.4.3 气候条件对病害流行的作用第22页
        1.5 病害的诊断与检测第22-23页
        1.6 病害的防治第23页
    2. 痂囊腔菌属(Elsinoe)真菌的研究进展第23-26页
        2.1 痂囊腔属的建立和演变第24-25页
        2.2 痂囊腔菌属的种类第25-26页
    3. 植物病原菌分类技术研究进展第26-32页
        3.1 植物病原菌的形态学分类研究第27-28页
        3.2 植物病原菌的致病性分类研究第28-30页
            3.2.1 植物病原菌的致病性分类依据第28页
            3.2.2 植物病原菌的致病性研究方法第28-30页
                3.2.2.1 种子传播病害的接种第28-29页
                3.2.2.2 土壤传播病害的接种第29页
                3.2.2.3 气流和雨水传播病害的接种第29-30页
            3.2.3 柑橘疮痂病菌在致病性上的研究进展第30页
        3.3 植物病原菌的分子生物学分类方法的研究第30-32页
            3.3.1 核糖体基因转录间隔区第30-31页
            3.3.2 基因组DNA碱基组成第31页
            3.3.3 核酸杂交技术第31-32页
            3.3.4 DNA指纹技术第32页
    4. 植物病原菌的分子快速诊断技术的研究进展第32-34页
        4.1 核糖体DNA的转录间隔区序列的应用第33-34页
        4.2 特定基因检测技术和Real-time PCR技术第34页
    5. 植物病原菌的种群遗传多样性及其研究技术第34-36页
        5.1 遗传多样性形成的原因及研究的意义第34-35页
            5.1.1 遗传多样性形成的原因第34-35页
            5.1.2 研究遗传多样性的意义第35页
        5.2 研究遗传多样性的方法第35-36页
    6. 本研究的背景、意义和研究内容第36-38页
第二章 中国柑橘疮痂病菌的种类第38-57页
    1. 前言第38-39页
    2. 材料与方法第39-42页
        2.1 标本的采集第39页
        2.2. 菌株分离、纯化和保存第39-40页
        2.3 病原菌形态与培养性状第40页
        2.4 基因组DNA的提取第40-41页
        2.5 PCR扩增、克隆和测序第41-42页
        2.6 菌株ITS序列分析与系统进化树的构建第42页
    3 结果与分析第42-54页
        3.1 分离样品的症状描述第42-46页
        3.2 分离结果第46页
        3.3 培养性状和形态学第46-52页
        3.4 菌株的ITS序列测定及基于ITS序列构建的系统进化树第52-54页
    4. 结论与讨论第54-57页
第三章 中国柑橘疮痂病菌的致病性分化研究第57-65页
    1. 前言第57-58页
    2. 材料与方法第58-59页
        2.1 试验材料第58页
            2.1.1 供试植株第58页
            2.1.2 供试菌株及其培养第58页
        2.2 试验方法第58-59页
    3 结果与分析第59-63页
        3.1 接种后发病症状第59-61页
        3.2 病菌的致病性分化第61-63页
    4 结论和讨论第63-65页
第四章 中国柑橘疮痂病菌的遗传多样性研究第65-85页
    1 前言第65-66页
    2 材料和方法第66-67页
        2.1 菌株来源第66页
        2.2 菌丝基因组DNA的提取第66页
        2.3 ISSR反应体系的优化第66-67页
            2.3.1 ISSR反应体系各成分用量研究第66-67页
            2.3.2 ISSR反应程序第67页
            2.3.3 引物筛选及遗传多样性分析第67页
    3 结果与分析第67-82页
        3.1 柑橘疮痂病菌菌丝基因组总DNA的质量第67页
        3.2 反应体系优化结果第67-73页
            3.2.1 Mg~(2+)对ISSR-PCR扩增结果的影响第67-68页
            3.2.2 dNTPs浓度对ISSR-PCR反应的影响第68-69页
            3.2.3 引物浓度对ISSR-PCR反应的影响第69-70页
            3.2.4 TaqDNA聚合酶用量对ISSR-PCR反应的影响第70-71页
            3.2.5 模板DNA用量对ISSR-PCR反应的影响第71-72页
            3.2.6 最佳柑橘疮痂病菌ISSR-PCR体系的建立第72-73页
        3.3 ISSR-PCR引物的筛选第73-74页
        3.4 ISSR图谱分析第74-80页
        3.5 ISSR聚类分析第80-82页
    4 结论与讨论第82-85页
第五章 快速检测柑橘疮痂病菌的实时定量PCR体系的建立第85-92页
    1. 前言第85-86页
    2. 材料与方法第86-87页
        2.1 供试菌株及其培养第86页
        2.2 基因组DNA的提取第86页
            2.2.1 真菌基因组DNA的提取第86页
            2.2.2 柑橘叶片基因组DNA的提取第86页
        2.3 PCR扩增、克隆和测序第86页
        2.4 E.fawcettii特异性引物的设计第86-87页
        2.5 引物的特异性第87页
        2.6 引物的灵敏度第87页
        2.7 E. fawcettii在柑橘叶片中的检测第87页
    3 结果与分析第87-90页
        3.1 特异性引物第87-88页
        3.2 引物特异性检测结果第88-89页
        3.3 引物灵敏度检测结果第89-90页
        3.4 采集病样含菌量的测定第90页
    4 结论和讨论第90-92页
第六章 全文总结和有待研究问题第92-94页
参考文献第94-101页
附录第101-112页
    参考文献第111-112页

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