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粗糙脉孢菌过氧化氢酶基因转录调控机制的研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
缩略词第8-9页
第一章 引言第9-27页
    1.1 细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)的产生及生理作用第9-12页
        1.1.1 细胞内活性氧的产生第9页
        1.1.2 细胞中ROS的生理作用第9-12页
    1.2 生物体内ROS的清除机制第12-13页
    1.3 过氧化氢酶是生物体内极其重要的ROS清除剂第13-14页
    1.4 动植物细胞中catalase基因的转录调控机制第14-16页
    1.5 粗糙脉孢菌中过氧化氢酶的生理功能及基因表达调控机制研究第16-19页
    1.6 染色质结构状态与基因转录密切相关第19-25页
        1.6.1 染色质的组成和结构第19-20页
        1.6.2 组蛋白修饰可调控染色质结构及基因表达第20-23页
        1.6.3 组蛋白修饰可被特定作用因子识别第23-25页
    1.7 异染色质调控基因表达第25-26页
    1.8 本论文的研究内容与意义第26-27页
第二章 材料与方法第27-41页
    2.1 培养基及抗体第27-28页
        2.1.1 50×Vogel's盐第27页
        2.1.2 Trace element第27页
        2.1.3 0.5M QA第27页
        2.1.4 10×Fig's溶液第27页
        2.1.5 Bottom and Top Agar第27页
        2.1.6 0.1%葡萄糖Glucose液体培养基第27页
        2.1.7 2%葡萄糖Glucose液体培养基第27-28页
        2.1.8 基本斜面培养基第28页
        2.1.9 Race tube(竞争性生长管)培养基第28页
        2.1.10 LB液体培养基第28页
        2.1.11 LB固体培养基第28页
        2.1.12 抗体第28页
    2.2 大肠杆菌菌株第28页
    2.3 载体构建第28-29页
    2.4 可融合蛋白的诱导表达和纯化第29-30页
    2.5 多克隆抗体的制备第30-31页
    2.6 菌株第31-32页
    2.7 突变载体构建第32页
    2.8 粗糙脉孢菌基因缺失突变株的构建第32-33页
    2.9 用race tube检测菌株菌丝的生长速率及H202抗性第33页
    2.10 粗糙脉孢菌可溶性蛋白的提取第33页
    2.11 Western blot第33-34页
    2.12 Northern blot第34-36页
    2.13 染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)第36-39页
    2.14 过氧化氢酶活性胶内分析法第39-41页
第三章 粗糙脉孢菌H3K9甲基化修饰调控cat-3基因表达的机制第41-58页
    3.1 背景第41-42页
    3.2 实验结果第42-54页
        3.2.1 dim-5~(KO)突变菌株对H_2O_2处理具有较强抗性第42-43页
        3.2.2 dim-5~(KO)突变菌株中过氧化氢酶的活性增加第43页
        3.2.3 dim-5~(KO)突变菌株中cat-1、cat-2和cat-3的表达水平升高第43-45页
        3.2.4 cat-3基因上游分布H3K9me3修饰第45-46页
        3.2.5 cat-3基因激活表达的分子机制第46-47页
        3.2.6 正确组装的异染色质可有效抑制cat-3基因的表达第47-49页
        3.2.7 cul4~(KO)、dcaf26~(KO)、dim-7~(KO)突变菌株中cat-3的表达升高第49-50页
        3.2.8 全局性异染色质形成缺陷可在转录及转录后水平调控catalase活性第50-53页
        3.2.9 异染色质缺陷突变体对于H_2O_2处理耐受性来源于高水平表达的Cat-3第53-54页
    3.3 小结与讨论第54-58页
        3.3.1 上游异染色质区域抑制cat-3基因转录第55-56页
        3.3.2 H3乙酰化修饰参与cat-3基因转录激活过程第56页
        3.3.3 在异染色质缺陷突变体中Cat-3蛋白修饰可能发生了变化第56-58页
第四章 上游基因间区调控cat-3基因转录的机制第58-67页
    4.1 实验结果第58-63页
        4.1.1 上游基因间区抑制cat-3基因表达第58-61页
        4.1.2 上游基因间区调控cat-3基因表达的机制探究第61-62页
        4.1.3 全局性异染色质修饰及cat-3上游基因间区协同调控Cat-3转录和蛋白翻译后修饰第62-63页
    4.2 小结与讨论第63-67页
        4.2.1 cat-3上游基因间区调控cat-3基因表达第64页
        4.2.2 全局性异染色质修饰及cat-3上游基因间区协同调控Cat-3转录和蛋白翻译后修饰第64-65页
        4.2.3 cat-3基因上游区域与组蛋白H3乙酰化修饰以相互平行的方式调控cat-3基因表达第65-67页
参考文献第67-76页
个人简历第76-77页
致谢第77页

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