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甘蓝型油菜AtPAP6同源基因的生物信息学分析及表达研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
常见英文缩写一览表第12-13页
1 前言第13-33页
    1.1 植物对磷元素的营养性第13-15页
        1.1.1 磷元素对植物生长发育的影响第13页
        1.1.2 当今磷资源的利用状况第13-15页
    1.2 植物对低磷胁迫的响应第15-18页
        1.2.1 植物对低磷环境的适应机制第15页
        1.2.2 低磷环境对植物根系形态的影响第15-17页
        1.2.3 低磷环境对植物根系分泌物的影响第17-18页
    1.3 植物紫色酸性磷酸酶研究进展第18-24页
        1.3.1 紫色酸性磷酸酶概述第18-20页
        1.3.2 紫色酸性磷酸酶分类第20-21页
        1.3.3 模式生物拟南芥中紫色酸性磷酸酶的研究第21-22页
        1.3.4 甘蓝型油菜中紫色酸性磷酸酶的研究第22-24页
    1.4 甘蓝型油菜基因组测序工作完成第24-25页
    1.5 生物信息学的发展第25-30页
        1.5.1 生物信息学概述第25-26页
        1.5.2 生物信息学的发展阶段及方向第26-27页
        1.5.3 生物信息学的应用第27-28页
        1.5.4 生物信息学数据库第28-30页
    1.6 实时荧光定量PCR分析基因表达的研究进展第30-31页
        1.6.1 实时荧光定量PCR概述第30页
        1.6.2 实时荧光定量PCR的定量方法第30-31页
    1.7 研究目的和意义第31-33页
2 油菜BnaA03g59200D、BnaC07g51090D与AtPAP6蛋白的生物信息学分析第33-50页
    2.1 蛋白质序列来源及生物信息学分析方法第33-34页
        2.1.1 蛋白质序列来源第33页
        2.1.2 生物信息学数据库及分析方法第33-34页
    2.2 结果与分析第34-48页
        2.2.1 BnaA03g59200D与BnaC07g51090D蛋白的BLASTP比对第34页
        2.2.2 构建系统发育进化树第34-35页
        2.2.3 BnaA03g59200D、BnaC07g51090D与AtPAP6蛋白的理化性质分析第35页
        2.2.4 亲水性/疏水性比较分析第35-37页
        2.2.5 信号肽及亚细胞定位预测第37-39页
        2.2.6 BnaA03g59200D、BnaC07g51090D与AtPAP6蛋白二级结构预测第39-40页
        2.2.7 蛋白质跨膜结构预测第40-42页
        2.2.8 蛋白质螺旋卷曲结构预测第42-43页
        2.2.9 蛋白质的潜在磷酸化位点及N-糖基化位点预测第43-45页
        2.2.10 保守结构域分析第45-46页
        2.2.11 BnaA03g59200D、BnaC07g51090D与AtPAP6蛋白三级结构预测第46-48页
        2.2.12 BnaA03g59200D、BnaC07g51090D与AtPAP6蛋白模体及功能位点预测第48页
    2.3 讨论第48-50页
3 实时荧光定量PCR技术探讨这两个基因响应磷饥饿诱导的表达分析第50-63页
    3.1 实验材料与方法第50-56页
        3.1.1 实验材料及培养条件第50页
        3.1.2 实验仪器和设备第50-51页
        3.1.3 实验器皿准备第51页
        3.1.4 试剂及试剂盒第51-52页
        3.1.5 实验材料磷饥饿诱导处理第52页
        3.1.6 磷饥饿诱导甘蓝型油菜幼苗嫩叶和根部总RNA的提取第52页
        3.1.7 提取总RNA的纯度检测第52-53页
        3.1.8 总RNA的琼脂糖凝胶电泳分析第53页
        3.1.9 总RNA反转录反应第53-54页
        3.1.10 内参基因的选取和引物设计第54-55页
        3.1.11 普通PCR扩增目的基因检测引物特异性第55页
        3.1.12 实时荧光定量PCR检测BnaA03g59200D与BnaC07g51090D在根部和嫩叶中的表达模式第55-56页
    3.2 结果与分析第56-61页
        3.2.1 总RNA的纯度检测第56页
        3.2.2 总RNA的琼脂糖凝胶电泳结果第56-57页
        3.2.3 目的基因特异性检测第57-58页
        3.2.4 BnaA03g59200D与BnaC07g51090D基因实时荧光定量PCR可靠性分析第58-59页
        3.2.5 实时荧光定量PCR检测BnaA03g59200D和BnaC07g51090D基因表达量第59-61页
    3.3 讨论第61-63页
        3.3.1 BnaA03g59200D和BnaC07g51090D基因响应磷饥饿诱导的表达分析第61页
        3.3.2 总RNA提取及实时荧光定量PCR技术检测基因表达量注意事项第61-63页
4 小结与展望第63-65页
参考文献第65-75页
附录第75-79页
致谢第79-80页
个人简历、在学期间发表的学术论文和研究成果第80页

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