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基于RNA-Seq技术的竹红菌甲素和20-羟基蜕皮甾酮的生物合成研究

中文摘要第4-7页
abstract第7-10页
第一章 引言第15-28页
    1.1 竹黄菌及竹红菌素研究进展第15-19页
        1.1.1 竹黄和竹黄菌简介第15页
        1.1.2 竹红菌素简介第15-16页
        1.1.3 竹红菌素生物合成调控第16-19页
    1.2 露水草及 20-羟基蜕皮甾酮研究进展第19-23页
        1.2.1 露水草简介第19页
        1.2.2 20-羟基蜕皮甾酮简介第19-21页
        1.2.3 植物甾酮的生物合成途径第21-23页
    1.3 药用植物和药用真菌转录组研究进展第23-26页
        1.3.1 转录组学方法第23-24页
        1.3.2 药用植物转录组分析研究进展第24-26页
        1.3.3 药用真菌转录组分析研究进展第26页
    1.4 本课题研究的主要内容第26-28页
第二章 表面活性剂对竹黄菌生长和竹红菌甲素合成的影响第28-37页
    2.1 引言第28页
    2.2 实验材料第28-29页
        2.2.1 菌株第28页
        2.2.2 培养基第28-29页
        2.2.3 实验试剂第29页
        2.2.4 实验仪器第29页
    2.3 实验方法第29-31页
        2.3.1 竹黄菌培养第29-30页
        2.3.2 表面活性剂处理方法第30页
        2.3.3 Triton X-100 最佳诱导条件筛选第30页
        2.3.4 竹黄菌形态观察和生物量测定第30页
        2.3.5 HA提取和含量测定第30-31页
    2.4 实验结果第31-35页
        2.4.1 Triton X-100 促进竹红菌素的生成第31页
        2.4.2 Triton X-100 对竹黄菌表观形态的影响第31-32页
        2.4.3 Triton X-100 最佳诱导条件的筛选第32-35页
    2.5 讨论与小结第35-37页
第三章 Triton X-100 对竹黄菌转录组的影响第37-45页
    3.1 引言第37页
    3.2 实验材料第37-38页
        3.2.1 菌株第37页
        3.2.2 培养基第37页
        3.2.3 实验试剂第37页
        3.2.4 实验仪器第37-38页
    3.3 实验方法第38-39页
        3.3.1 竹黄菌培养第38页
        3.3.2 RNA提取和cDNA文库的构建第38页
        3.3.3 cDNA文库测序、拼接和注释第38-39页
        3.3.4 差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)的筛选第39页
        3.3.5 DEGs的GO聚类分析第39页
    3.4 实验结果第39-44页
        3.4.1 竹黄菌cDNA文库的构建、测序和序列拼接第39-40页
        3.4.2 竹黄菌转录组unigene的注释第40-41页
        3.4.3 Triton X-100 影响竹黄菌基因的转录表达水平第41-44页
    3.5 讨论与小结第44-45页
第四章 Triton X-100 作用机制研究第45-61页
    4.1 引言第45页
    4.2 实验材料第45-46页
        4.2.1 菌株第45页
        4.2.2 培养基第45页
        4.2.3 实验试剂第45-46页
        4.2.4 实验仪器第46页
    4.3 实验方法第46-49页
        4.3.1 竹黄菌培养第46页
        4.3.2 活性氧(Reactive oxygen species,ROS)的染色观察第46-47页
        4.3.3 ROS的含量测定第47页
        4.3.4 膜通透性分析第47页
        4.3.5 脂肪酸的提取和测定第47-48页
        4.3.6 实时定量PCR(qRT-PCR)第48-49页
    4.4 实验结果第49-58页
        4.4.1 Triton X-100 提高竹黄菌细胞膜通透性第49-51页
        4.4.2 Triton X-100 对竹黄菌中跨膜转运的影响第51-53页
        4.4.3 Triton X-100 诱导竹黄菌中活性氧迸发第53-56页
        4.4.4 Triton X-100 对竹红菌素生物合成相关基因表达的影响第56-58页
    4.5 讨论与小结第58-61页
第五章 露水草叶和根转录组比较分析第61-80页
    5.1 引言第61页
    5.2 实验材料第61-62页
        5.2.1 实验试剂第61-62页
        5.2.2 实验仪器第62页
    5.3 实验方法第62-65页
        5.3.1 露水草的培养第62页
        5.3.2 20E的提取和含量测定测定第62页
        5.3.3 cDNA文库的构建、测序、拼接和注释第62页
        5.3.4 DEGs的筛选第62-63页
        5.3.5 差异表达基因的GO聚类分析第63页
        5.3.6 实时定量PCR(qRT-PCR)第63-65页
        5.3.7 露水草中简单重复序列(Simple sequence repeats,SSRs)分析第65页
    5.4 实验结果第65-78页
        5.4.1 露水草叶片和根中 20E的含量测定第65-66页
        5.4.2 露水草cDNA文库的测序、拼接和注释第66-67页
        5.4.3 露水草叶片和根转录组中DEGs的筛选第67-68页
        5.4.4 露水草中次级代谢相关unigene的筛选第68-70页
        5.4.5 20E生物合成相关基因的筛选第70-75页
        5.4.6 露水草叶片和根中差异表达CYP450s的筛选和验证第75-77页
        5.4.7 露水草中转录因子(Transcription factors,TFs)分析第77页
        5.4.8 露水草中SSRs分析第77-78页
    5.5 讨论与小结第78-80页
论文总结与展望第80-82页
    一、主要结论第80-81页
    二、展望第81-82页
参考文献第82-90页
攻读学位期间发表的论文及成果第90-91页
致谢第91-92页

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