| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-29页 |
| 1.1 微生物分子生态学概述 | 第13-21页 |
| 1.1.1 微生物分子生态学研究策略 | 第13-14页 |
| 1.1.2 微生物生态学主要研究技术 | 第14-21页 |
| 1.1.2.1 克隆文库技术 | 第14-17页 |
| 1.1.2.2 遗传指纹图谱 | 第17-19页 |
| 1.1.2.3 分子杂交技术 | 第19-20页 |
| 1.1.2.4 实时定量PCR | 第20-21页 |
| 1.2 杂环芳香化合物降解菌群研究概况 | 第21-28页 |
| 1.2.1 工业废水中的主要杂环芳香化合物 | 第21-22页 |
| 1.2.2 杂环芳香化合物生物降解 | 第22-24页 |
| 1.2.2.1 芳香族化合物生物降解 | 第22-23页 |
| 1.2.2.2 含氮杂环化合物生物降解机理 | 第23-24页 |
| 1.2.3 杂环芳香族化合物降解菌群研究 | 第24-28页 |
| 1.2.3.1 微生物群落结构的研究 | 第24-25页 |
| 1.2.3.2 杂环芳香化合物降解主要功能菌群的研究 | 第25-26页 |
| 1.2.3.3 杂环芳香化合物降解相关基因的研究 | 第26-28页 |
| 1.3 研究目的 | 第28-29页 |
| 第二章 吲哚驯化的反硝化及厌氧反应器的微生物群落 | 第29-49页 |
| 2.1 引言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 反应装置及样品采集 | 第30页 |
| 2.2.2 样品预处理和DNA 提取 | 第30-31页 |
| 2.2.2.1 样品预处理 | 第30-31页 |
| 2.2.2.2 DNA 的提取 | 第31页 |
| 2.2.3 16S rDNA 全长扩增和克隆文库构建 | 第31-32页 |
| 2.2.4 测序及序列分析 | 第32页 |
| 2.2.5 核酸序列登录号（Accession number） | 第32-33页 |
| 2.2.6 16S rRNA 基因 V3 区PCR 扩增及变性梯度凝胶电泳（DGGE）分析 | 第33页 |
| 2.2.7 文库中的克隆回对DGGE 条带 | 第33-34页 |
| 2.3 实验结果 | 第34-44页 |
| 2.3.1 反应器运行状况 | 第34页 |
| 2.3.2 16S rDNA 基因文库的有效性 | 第34-35页 |
| 2.3.3 三个克隆文库的差异度 | 第35-36页 |
| 2.3.4 克隆文库的序列分析 | 第36-40页 |
| 2.3.4.1 三个文库的在纲水平的系统发育学分析 | 第36-37页 |
| 2.3.4.2 反硝化反应器16S rDNA 基因克隆文库的组成分析 | 第37-39页 |
| 2.3.4.3 厌氧反应器16S rDNA 基因克隆文库的组成分析 | 第39-40页 |
| 2.3.5 PCR-DGGE 指纹图谱分析 | 第40-42页 |
| 2.3.6 喹啉与吲哚驯化的反硝化反应器文库的比较 | 第42-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-49页 |
| 第三章 启动子捕获质粒系统的构建 | 第49-66页 |
| 3.1 引言 | 第49页 |
| 3.2 实验原理 | 第49-51页 |
| 3.3 实验材料 | 第51-52页 |
| 3.4 实验思路 | 第52-53页 |
| 3.5 实验方法及结果 | 第53-65页 |
| 3.5.1 基本实验操作 | 第53-55页 |
| 3.5.1.1 DNA 提取 | 第53页 |
| 3.5.1.2 PCR | 第53-54页 |
| 3.5.1.3 限制性内切酶酶切 | 第54页 |
| 3.5.1.4 连接 | 第54页 |
| 3.5.1.5 去磷酸化 | 第54-55页 |
| 3.5.2 实验流程及结果 | 第55-65页 |
| 3.5.2.1 替换质粒pZ524-LG 的复制起始区及去除自带启动子 | 第55-59页 |
| 3.5.2.2 p15A-LG 质粒加上BamHI 酶切识别位点 | 第59-62页 |
| 3.5.2.3 致死率测定 | 第62-63页 |
| 3.5.2.4 插入环境微生物DNA 片段 | 第63-65页 |
| 3.5.2.5 筛选含可诱导启动子的克隆 | 第65页 |
| 3.6 小结 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-89页 |
| 附录1 溶液试剂及培养基的配制 | 第89-94页 |
| 附录2 实验中所用的仪器设备 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 研究生阶段发表的论文 | 第96页 |
