| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第11-26页 |
| 1.1 稻瘟菌简介 | 第11-12页 |
| 1.1.1 稻瘟菌概述 | 第11页 |
| 1.1.2 稻瘟菌研究进展 | 第11-12页 |
| 1.2 细胞色素P450简介 | 第12-15页 |
| 1.2.1 P450概述 | 第12页 |
| 1.2.2 原核生物的P450结构 | 第12-14页 |
| 1.2.3 真核细胞P450结构 | 第14-15页 |
| 1.3 CYP51的结构与功能 | 第15-20页 |
| 1.3.1 CYP51简介 | 第15-16页 |
| 1.3.2 真核生物CYP51高度相似的三维结构 | 第16-17页 |
| 1.3.3 CYP51家族高度保守的结构特征 | 第17-19页 |
| 1.3.4 CYP51结构的活性中心 | 第19-20页 |
| 1.4 分子模拟概述 | 第20-21页 |
| 1.4.1 同源模建 | 第20-21页 |
| 1.4.2 分子动力学 | 第21页 |
| 1.4.3 分子对接 | 第21页 |
| 1.5 生物信息学与基因组分析 | 第21-25页 |
| 1.5.1 生物信息学 | 第21-22页 |
| 1.5.2 概述 | 第22-24页 |
| 1.5.3 基于生物信息学的蛋白质分析 | 第24-25页 |
| 1.6 究内容和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 CYP51的同源模建及分子对接 | 第26-40页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-29页 |
| 2.1.1 目标蛋白,模板结构及相关数据 | 第26-27页 |
| 2.1.2 硬件计算平台 | 第27页 |
| 2.1.3 计算软件平台 | 第27-29页 |
| 2.2 实验方法和流程 | 第29-33页 |
| 2.2.1 模型的构建 | 第29-30页 |
| 2.2.2 模型优化 | 第30-31页 |
| 2.2.3 模型评价 | 第31页 |
| 2.2.4 准备配体分子 | 第31-32页 |
| 2.2.5 抑制剂的分子对接 | 第32-33页 |
| 2.3 结果与分析 | 第33-38页 |
| 2.3.1 MgCYP51模建结构优化及分子动力学模拟 | 第33-35页 |
| 2.3.2 MgCYP51模建结构分析 | 第35-36页 |
| 2.3.3 MgCYP51与抑制剂分子对接结果分析 | 第36-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38页 |
| 2.5 本章小结 | 第38-40页 |
| 第三章 稻瘟菌与其宿主水稻的全基因组比对分析 | 第40-64页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第40-41页 |
| 3.1.1 实验材料及数据来源 | 第40页 |
| 3.1.2 硬件计算平台 | 第40页 |
| 3.1.3 基于KEGG的代谢通路比对分析 | 第40页 |
| 3.1.4 同源性筛选 | 第40-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-63页 |
| 3.2.1 基于KEGG和BLAST的代谢通路比对筛选 | 第41-62页 |
| 3.2.2 稻瘟菌代谢通路分析 | 第62-63页 |
| 3.3 本章小结 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-71页 |
| 硕士期间发表论文 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
