| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-28页 |
| 1.1 引言 | 第13-14页 |
| 1.2 系统药理学定义 | 第14页 |
| 1.3 系统药理学研究模型和方法 | 第14-25页 |
| 1.3.1 ADME | 第14-18页 |
| 1.3.2 靶标识别 | 第18页 |
| 1.3.3 网络药理学 | 第18-25页 |
| 1.4 系统药理学的应用 | 第25-27页 |
| 1.4.1 中药系统药理学 | 第25-26页 |
| 1.4.2 复杂疾病病理机制研究 | 第26页 |
| 1.4.3 药物组合开发 | 第26-27页 |
| 1.5 本论文研究内容 | 第27-28页 |
| 第二章 心血管疾病-基因-蛋白-药物互作系统药理学分析 | 第28-60页 |
| 2.1 引言 | 第28-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-33页 |
| 2.2.1 心血管药物和相关治疗靶标的整合 | 第30-31页 |
| 2.2.2 表型及表型相关基因的整合 | 第31页 |
| 2.2.3 蛋白质-蛋白质相互作用数据整理 | 第31页 |
| 2.2.4 疾病模块网络构建 | 第31-32页 |
| 2.2.5 不同疾病间分子相互作用的评估 | 第32页 |
| 2.2.6 网络拓扑学性质 | 第32页 |
| 2.2.7 心血管靶标和基因功能相似性计算 | 第32页 |
| 2.2.8 数据库构建 | 第32页 |
| 2.2.9 统计分析 | 第32-33页 |
| 2.3 结果 | 第33-57页 |
| 2.3.1 心血管药物和治疗靶标的分类 | 第33-34页 |
| 2.3.2 第一层药物-靶标网络 | 第34-35页 |
| 2.3.3 定量研究心血管药物和靶标的多向药理学 | 第35-38页 |
| 2.3.4 第二层药物-靶标网络 | 第38-40页 |
| 2.3.5 第三层药物-靶标网络 | 第40-42页 |
| 2.3.6 心血管药物-适应症关联分析 | 第42-44页 |
| 2.3.7 探索心血管靶标和心血管基因之间的相互作用 | 第44-50页 |
| 2.3.8 探索心血管疾病之间的关系 | 第50-55页 |
| 2.3.9 识别心血管疾病分子相互作用 | 第55-57页 |
| 2.4 讨论 | 第57-59页 |
| 2.5 结论 | 第59-60页 |
| 第三章 基于系统药理学的心血管疾病药物新组合研究 | 第60-78页 |
| 3.1 引言 | 第60-61页 |
| 3.2 设计思路和研究内容 | 第61-68页 |
| 3.2.1 计算 | 第61-66页 |
| 3.2.1.1 药物–药物相似性分析 | 第62-63页 |
| 3.2.1.2 药物对特征 | 第63-64页 |
| 3.2.1.3 集成特征的贝叶斯网络 | 第64-65页 |
| 3.2.1.4 原始值和P值 | 第65-66页 |
| 3.2.1.5 交叉验证 | 第66页 |
| 3.2.2 实验验证 | 第66-67页 |
| 3.2.3 材料 | 第67-68页 |
| 3.3 研究结果 | 第68-75页 |
| 3.3.1 数据集构建和评价 | 第68页 |
| 3.3.2 性能评价 | 第68-70页 |
| 3.3.3 综合分析药物组合的副作用和有效作用 | 第70-71页 |
| 3.3.4 疾病分布分析 | 第71页 |
| 3.3.5 文献数据验证 | 第71-73页 |
| 3.3.6 药物组合与疾病的关系 | 第73-74页 |
| 3.3.7 实验验证 | 第74-75页 |
| 3.4 讨论及结论 | 第75-78页 |
| 第四章 基于系统药理学的心血管疾病中药复方开发 | 第78-101页 |
| 4.1 引言 | 第78-79页 |
| 4.2 材料与方法 | 第79-83页 |
| 4.2.1 研究方案 | 第79-80页 |
| 4.2.2 构建心血管疾病相关的药物-靶标网络 | 第80-81页 |
| 4.2.3 中药数据库构建及成药性评估 | 第81页 |
| 4.2.3.1 数据库构建 | 第81页 |
| 4.2.3.2 口服利用度 | 第81页 |
| 4.2.3.3 谷本相似性 | 第81页 |
| 4.2.4 反向打靶 | 第81页 |
| 4.2.5 网络构建和新药筛选 | 第81页 |
| 4.2.6 实验验证 | 第81-83页 |
| 4.2.6.1 DSH提取液的制备 | 第82页 |
| 4.2.6.2 HPLC分析 | 第82页 |
| 4.2.6.3 动物模型 | 第82-83页 |
| 4.2.6.4 RT-PCR分析 | 第83页 |
| 4.2.6.5 统计分析 | 第83页 |
| 4.3 研究结果 | 第83-101页 |
| 4.3.1 心血管相关的药物靶标网络 | 第84-86页 |
| 4.3.2 中药中的药理学活性成分 | 第86页 |
| 4.3.3 反向打靶技术 | 第86-87页 |
| 4.3.4 物理化学性质分析 | 第87-89页 |
| 4.3.5 中药组合的优化 | 第89-90页 |
| 4.3.6 DSH组合 | 第90-93页 |
| 4.3.7 实验验证 | 第93-97页 |
| 4.3.8 讨论及结论 | 第97-101页 |
| 4.3.8.1 克服药物开发的困难 | 第97-98页 |
| 4.3.8.2 解决药物复杂性问题 | 第98-99页 |
| 4.3.8.3 发现药物组合的捷径 | 第99-101页 |
| 第五章 心血管疾病数据库构建与分析 | 第101-116页 |
| 5.1 心血管病系统药理学数据库 | 第101-109页 |
| 5.1.1 CVDSP数据库的构成 | 第101-109页 |
| 5.2 药物组合预测和分析数据库 | 第109-116页 |
| 5.2.1 数据库参数信息 | 第110-111页 |
| 5.2.2 检索指导 | 第111-116页 |
| 第六章 结论与展望 | 第116-118页 |
| 6.1 结论 | 第116-117页 |
| 6.2 展望 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-132页 |
| 附录 | 第132-140页 |
| 附录1 | 第132-135页 |
| 附录2 | 第135-136页 |
| 附录3 | 第136-137页 |
| 附录4 | 第137-139页 |
| 附录5 | 第139-140页 |
| 缩略词 | 第140-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
| 作者简介 | 第144页 |