草鱼呼肠孤病毒GZ1208株的分离、鉴定及全基因组序列分析
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 前言 | 第11-25页 |
| 1 草鱼出血病及其病原 | 第11页 |
| 2 病毒形态及生化特征 | 第11-12页 |
| 3 基因分型与流行病学 | 第12-14页 |
| 4 细胞培养特性 | 第14-15页 |
| 5 基因组序列 | 第15-18页 |
| 6 基因组特征及各基因节段编码的多肽 | 第18-20页 |
| 7 检测方法 | 第20-22页 |
| 8 草鱼出血病防控 | 第22-24页 |
| 9 本研究目的和意义 | 第24-25页 |
| 第二章 草鱼呼肠孤病毒GZ1208的分离与鉴定 | 第25-39页 |
| 1 材料和方法 | 第25-30页 |
| 1.1 实验鱼、样品、细胞和毒株 | 第25页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第25-26页 |
| 1.3 患病草鱼样品收集 | 第26页 |
| 1.4 组织匀浆液制备 | 第26页 |
| 1.5 病毒分离 | 第26-27页 |
| 1.6 电镜切片制作 | 第27页 |
| 1.7 三重RT-PCR检测 | 第27-28页 |
| 1.8 扩增产物测序与比对 | 第28页 |
| 1.9 病毒浓缩 | 第28-29页 |
| 1.10 病毒基因组提取 | 第29页 |
| 1.11 基因组带型分析 | 第29页 |
| 1.12 病毒滴度测定 | 第29-30页 |
| 1.13 回归感染试验 | 第30页 |
| 1.14 交叉免疫实验 | 第30页 |
| 2. 结果 | 第30-37页 |
| 2.1 发病草鱼症状 | 第30-31页 |
| 2.2 6天内PSF细胞感染病毒后的形态变化 | 第31-32页 |
| 2.3 电镜下的病毒粒子 | 第32页 |
| 2.4 三重PCR电泳带型 | 第32-33页 |
| 2.5 扩增片段与873序列比较 | 第33-34页 |
| 2.6 SDS-PAGE电泳带型 | 第34页 |
| 2.7 病毒滴度测定 | 第34-36页 |
| 2.8 回归感染实验 | 第36页 |
| 2.9 交叉免疫实验 | 第36-37页 |
| 3. 讨论 | 第37-39页 |
| 第三章 全基因组序列测定与特征分析 | 第39-64页 |
| 1. 材料与方法 | 第39-43页 |
| 1.1 实验细胞、毒株及所用软件 | 第39页 |
| 1.2 主要试剂和仪器 | 第39-40页 |
| 1.3 引物设计 | 第40-41页 |
| 1.4 序列扩增与测序 | 第41-42页 |
| 1.5 序列拼接 | 第42页 |
| 1.6 基因组特征 | 第42页 |
| 1.7 序列相似性分析 | 第42-43页 |
| 1.8 编码氨基酸分析 | 第43页 |
| 1.9 氨基酸相似性分析 | 第43页 |
| 1.10 系统进化树构建 | 第43页 |
| 2. 结果 | 第43-61页 |
| 2.1 全基因组序列 | 第43-44页 |
| 2.2 基因组特征 | 第44-46页 |
| 2.3 编码氨基酸 | 第46-47页 |
| 2.4 各节段的核酸序列相似性比较 | 第47-52页 |
| 2.5 各节段的氨基酸序列相似性比较 | 第52-57页 |
| 2.6 系统进化树 | 第57-61页 |
| 3. 讨论 | 第61-64页 |
| 全文总结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第71页 |
| 硕士期间参加会议 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
