| 中文摘要 | 第11-13页 |
| 英文摘要 | 第13页 |
| 第1章 遗传标记的发展与遗传连锁图谱的构建 | 第16-38页 |
| 1．1 遗传标记的发展 | 第16-21页 |
| 1．1．1 形态学标记 | 第16页 |
| 1．1．2 细胞学标记 | 第16-17页 |
| 1．1．3 生化标记 | 第17页 |
| 1．1．4 DNA标记 | 第17-21页 |
| 1．2 遗传连锁图谱的构建 | 第21-26页 |
| 1．2．1 经典遗传连锁图谱 | 第21-23页 |
| 1．2．2 分子遗传连锁图谱 | 第23-26页 |
| 1．2．2．1 作图标记的选择 | 第24页 |
| 1．2．2．2 分离群体的选择 | 第24-26页 |
| 1．2．2．3 数据的处理和分析 | 第26页 |
| 1．2．3 经典遗传图谱与分子连锁图谱的整合 | 第26页 |
| 1．3 分子标记基因定位分析方法 | 第26-30页 |
| 1．3．1 分离群体分组分析（等基因池分析方法） | 第27-28页 |
| 1．3．2 极端个体分组和隐性基因组分析 | 第28页 |
| 1．3．3 近等基因系分析 | 第28-29页 |
| 1．3．4 基因型差异分析法（GDA） | 第29-30页 |
| 参考文献 | 第30-38页 |
| 第2章 水稻微卫星标记及其应用 | 第38-52页 |
| 2．1 水稻基因组中SSR的类型及频率 | 第38-39页 |
| 2．2 水稻SSR标记的发展 | 第39-40页 |
| 2．3 SSR标记相关技术 | 第40-41页 |
| 2．3．1 分子杂交技术 | 第40页 |
| 2．3．2 特异引物扩增技术 | 第40-41页 |
| 2．3．3 SSR的检测技术 | 第41页 |
| 2．4 SSR作图 | 第41-42页 |
| 2．5 SSLP标记在水稻遗传育种中的应用 | 第42-45页 |
| 2．5．1 DNA指纹和品种鉴定 | 第42-43页 |
| 2．5．2 基因和QTLs分析 | 第43-44页 |
| 2．5．3 研究稻属的系统发育与进化 | 第44-45页 |
| 2．5．4 种质资源保存和利用 | 第45页 |
| 2．5．5 系谱分析和标记辅助育种 | 第45页 |
| 2．6 SSR标记的优缺点 | 第45-46页 |
| 2．6．1 等位基因多样性 | 第45-46页 |
| 2．6．2 SSR的使用效率 | 第46页 |
| 2．7 小结与展望 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 第3章 外源基因在转基因植物中的遗传与表达 | 第52-63页 |
| 3．1 外源基因在转基因植物中的遗传 | 第52-55页 |
| 3．1．1 外源基因在组织培养过程中的稳定性 | 第52-53页 |
| 3．1．2 外源基因在有性世代传递过程中的遗传稳定性 | 第53-54页 |
| 3．1．3 单位点整合的外源基因在转基因植物中的遗传规律 | 第54页 |
| 3．1．4 多位点整合的外源基因在转基因植物中的遗传规律 | 第54-55页 |
| 3．2 外源基因在转基因植物中的表达 | 第55-59页 |
| 3．2．1 外源基因本身特性 | 第55-56页 |
| 3．2．2 外源基因的插入位点（位置效应） | 第56-57页 |
| 3．2．3 外源基因的拷贝数与整合方式 | 第57页 |
| 3．2．4 受体细胞表达调控系统 | 第57-58页 |
| 3．2．5 环境因素 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 第4章 外源基因在转基因植物中的定位 | 第63-74页 |
| 4．1 外源基因定位的方法 | 第63-67页 |
| 4．1．1 原位杂交 | 第63-64页 |
| 4．1．2 形态学标记和同工酶标记 | 第64-66页 |
| 4．1．3 分子标记 | 第66-67页 |
| 4．1．3．1 RFLP标记 | 第66页 |
| 4．1．3．2 RAPD标记 | 第66-67页 |
| 4．2 外源基因定位研究的意义 | 第67-70页 |
| 4．2．1 研究外源基因的整合位点及方式 | 第67-68页 |
| 4．2．2 外源基因在受体中遗传行为分析 | 第68-69页 |
| 4．2．3 转座子行为研究 | 第69页 |
| 4．2．4 标记辅助选择和遗传育种 | 第69页 |
| 4．2．5 转基因植物安全性研究 | 第69-70页 |
| 4．3 展望 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-74页 |
| 第5章 S-3307对水稻花药培养愈伤组织诱导、分化、壮苗的效应 | 第74-82页 |
| 5．1 材料与方法 | 第75-76页 |
| 5．1．1 供试材料 | 第75页 |
| 5．1．2 花药培养 | 第75-76页 |
| 5．1．2．1 花药的采集和接种 | 第75页 |
| 5．1．2．2 培养基 | 第75-76页 |
| 5．1．2．3 培养条件 | 第76页 |
| 5．1．2．4 数据统计 | 第76页 |
| 5．2 结果与分析 | 第76-79页 |
| 5．2．1 S-3307对水稻花药培养愈伤组织诱导的效应 | 第76页 |
| 5．2．2 S-3307对愈伤组织分化效应 | 第76-79页 |
| 5．2．2．1 不同浓度的S-3307和PP_（333）作用效应的比较 | 第76-78页 |
| 5．2．2．2 不同浓度S-3307对不同品种分化效应的比较 | 第78-79页 |
| 5．2．3 S-3307对试管苗壮苗的效应 | 第79页 |
| 5．3 讨论 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-82页 |
| 第6章 直接产生抗除草剂转基因水稻纯系的新方法 | 第82-92页 |
| 6．1 材料与方法 | 第83-85页 |
| 6．1．1 供试材料 | 第83页 |
| 6．1．2 花药培养 | 第83页 |
| 6．1．2．1 花药的采集和接种 | 第83页 |
| 6．1．2．2 培养基 | 第83页 |
| 6．1．2．3 培养条件和数据统计 | 第83页 |
| 6．1．3 PCR检测 | 第83-84页 |
| 6．1．3．1 DNA提取 | 第83-84页 |
| 6．1．3．2 PCR引物 | 第84页 |
| 6．1．3．3 PCR反应 | 第84页 |
| 6．1．4 田间抗性检测 | 第84-85页 |
| 6．1．5 后代农艺性状调查 | 第85页 |
| 6．2 结果与分析 | 第85-89页 |
| 6．2．1 PPT对花药培养愈伤组织诱导的效应 | 第85页 |
| 6．2．2 PPT对花药培养愈伤组织分化的作用效应 | 第85-86页 |
| 6．2．3 PCR检测和田间抗性检测 | 第86-88页 |
| 6．2．4 花培后代农艺性状比较 | 第88-89页 |
| 6．2．4．1 H_1表现 | 第88页 |
| 6．2．4．2 H_2、H_3表现 | 第88-89页 |
| 6．3 讨论 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-92页 |
| 第7章 bar基因和PinⅡ基因在DH群体中的抗性及其遗传 | 第92-105页 |
| 7．1 材料与方法 | 第93-95页 |
| 7．1．1 供试材料 | 第93页 |
| 7．1．2 抗除草剂鉴定 | 第93-94页 |
| 7．1．3 抗螟虫鉴定 | 第94页 |
| 7．1．3．1 田间自然诱发鉴定 | 第94页 |
| 7．1．3．2 网室人工接虫鉴定 | 第94页 |
| 7．1．4 DH系农艺性状的调查 | 第94页 |
| 7．1．5 PCR检测 | 第94页 |
| 7．1．6 数据的统计分析 | 第94-95页 |
| 7．2 结果与分析 | 第95-102页 |
| 7．2．1 bar基因和PinⅡ基因在DH群体的连锁遗传 | 第95页 |
| 7．2．2 bar基因对DH系除草剂Basta抗性的效应 | 第95-96页 |
| 7．2．3 PinⅡ基因对DH系白穗率的效应 | 第96-97页 |
| 7．2．4 PinⅡ基因对DH系为害率的效应 | 第97-99页 |
| 7．2．5 DH系农艺性状的变异 | 第99-102页 |
| 7．3 讨论 | 第102-103页 |
| 7．3．1 外源基因的表达 | 第102页 |
| 7．3．2 外源基因对DH群体农艺性状的影响 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-105页 |
| 第8章 微卫星标记在水稻不同作图群体中的分离 | 第105-120页 |
| 8．1 材料和方法 | 第106-110页 |
| 8．1．1 供试材料 | 第106页 |
| 8．1．2 SSRs标记的扩增及多态性分析 | 第106-109页 |
| 8．1．2．1 SSRs标记引物合成 | 第106-107页 |
| 8．1．2．2 水稻DNA提取 | 第107页 |
| 8．1．2．3 SSRs标记多态性扩增 | 第107-108页 |
| 8．1．2．4 SSRs标记扩增产物的检测 | 第108-109页 |
| 8．1．2．4．1 溶液的配制 | 第108页 |
| 8．1．2．4．2 琼脂糖凝胶电泳分析 | 第108页 |
| 8．1．2．4．3 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）结合溴化乙锭（EB）染色分析 | 第108页 |
| 8．1．2．4．4 变性聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）电泳结合银染分析 | 第108-109页 |
| 8．1．3 遗传数据分析 | 第109-110页 |
| 8．1．3．1 DH群体数据的处理 | 第109页 |
| 8．1．3．2 F_2群体数据的处理 | 第109-110页 |
| 8．1．4 连锁作图 | 第110页 |
| 8．2 结果与分析 | 第110-115页 |
| 8．2．1 不同作图群体SSRs标记多态性 | 第110-111页 |
| 8．2．2 SSRs标记在F_2群体中的分离 | 第111-113页 |
| 8．2．3 SSRs标记在DH群体中的分离 | 第113-114页 |
| 8．2．4 基于cw3与DH群体waxy基因附近SSR连锁群的比较 | 第114-115页 |
| 8．3 讨论 | 第115-118页 |
| 8．3．1 SSR—PCR反应条件的优化和产物检测方法的比较 | 第115-116页 |
| 8．3．2 SSRs标记的多态性和异常分离 | 第116页 |
| 8．3．3 基于不同群体构建的遗传图谱通用性 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-120页 |
| 附录A 表目录 | 第120-121页 |
| 附录B 图目录 | 第121-122页 |
| 附录C 凝胶电泳有关溶液的配制 | 第122-124页 |
| 附录D 145个SSRs标记的相关信息 | 第124-127页 |
