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长链双链RNA调控内源性免疫和慢性炎症的分子机制研究

缩略语表第6-9页
中文摘要第9-12页
ABSTRACT第12-15页
前言第16-18页
文献回顾第18-30页
第一部分 靶向外源性dsRNA激活抗病毒固有免疫的分子机制研究第30-62页
    1. 实验材料与仪器第31-35页
        1.1. 菌种、质粒、病毒株和细胞系第31页
        1.2. 主要仪器第31-32页
        1.3. 主要试剂及配制方法第32-35页
            1.3.1. 试剂与材料第32-34页
            1.3.2. 试剂配制方法第34-35页
    2. 实验方法第35-43页
        2.1. 重组RLR受体dsCARE的原核表达与纯化第35-36页
        2.2. 病毒培养及其悬液制备第36-37页
            2.2.1. ADV-GFP的病毒悬液制备第36页
            2.2.2. RSV病毒悬液制备第36-37页
        2.3. TCID_(50)法测定病毒滴度第37-38页
            2.3.1. 带GFP标签的ADV病毒滴度测定第37页
            2.3.2. 野生型呼吸道合胞病毒(RSV)病毒滴度测定第37-38页
        2.4. 细胞活力测定第38页
            2.4.1. MTS比色法测定细胞活力第38页
            2.4.2. 台盼蓝染色法测定细胞活力第38页
        2.5. 细胞总RNA提取第38-39页
        2.6. 将mRNA反转录成cDNA第39页
        2.7. 实时定量PCR(qPCR)检测IFN-β、IL-1β 和IL-18第39-40页
        2.8. ELISA检测IFN-β、IL-1β 和IL-18第40-41页
        2.9. 细胞转染第41页
        2.10. 流式细胞术检测细胞凋亡第41页
        2.11. 透射电镜观察第41-42页
        2.12. 蛋白质免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)第42页
        2.13. 蛋白质免疫印迹(Western blotting)第42-43页
            2.13.1. SDS-PAGE第42-43页
            2.13.2. 免疫印迹第43页
        2.14. 统计学方法第43页
    3. 结果第43-58页
        3.1. 重组RLR受体dsCARE的抗病毒作用第43-47页
            3.1.1. dsCARE对重组腺病毒感染的保护作用第44-45页
            3.1.2. dsCARE对野生型呼吸道合胞病毒(RSV)感染的保护作用第45-46页
            3.1.3. 穿膜肽不是重组RLR受体dsCARE起抗病毒作用的功能结构域第46-47页
        3.2. dsCARE的抗病毒作用机制第47-53页
            3.2.1. dsCARE负调控IFN-β 的表达及其上游分子IRF-3 的活化第47-48页
            3.2.2. dsCARE促进炎性因子IL-1β 的表达但不影响IL-18第48-49页
            3.2.3. dsCARE通过诱导细胞死亡的方式清除病毒感染细胞第49-51页
            3.2.4. dsCARE不诱导细胞凋亡第51-53页
        3.3. dsCARE通过诱导程序性坏死发挥其抗病毒活性第53-58页
            3.3.1. dsCARE诱导坏死样形态学特征的细胞死亡第53-55页
            3.3.2. dsCARE诱导程序性坏死小体(necrosome)复合物形成第55-57页
            3.3.3. dsCARE诱导的Necroptosis需要RIP1、RIP3和Cathepsin D的参与第57-58页
    4. 讨论第58-62页
第二部分 内源性dsRNA调控血管内皮功能紊乱的分子机制研究第62-92页
    1. 实验材料与仪器第63-65页
        1.1. 菌种、质粒、细胞和动物第63页
        1.2. 主要仪器第63-64页
        1.3. 主要试剂及配制方法第64-65页
    2. 实验方法第65-75页
        2.1. 小鼠血糖测定第65-66页
        2.2. 小鼠胸主动脉分离及石蜡包埋第66页
        2.3. 血管组织的免疫组织化学染色第66-67页
        2.4. 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的分离和培养第67-68页
        2.5. RNA免疫共沉淀(RNA-IP)第68页
        2.6. cDNA文库构建第68-70页
        2.7. 重组质粒的构建第70-73页
            2.7.1. pcDNA3.1(+)-Alu第70页
            2.7.2. pcDNA3.1(+)-Alu-LA与pcDNA3.1(+)-Alu-M的构建第70-71页
            2.7.3. 质粒提取第71-72页
            2.7.4. DNA凝胶电泳中目的片段的回收与纯化第72页
            2.7.5. 转化感受态细胞第72-73页
        2.8. 免疫荧光观察HUVEC中的dsRNA第73页
        2.9. 斑点印记(Dot blotting)定量HUVEC中的dsRNA第73页
        2.10. 实时定量PCR分析基因表达水平第73-74页
        2.11. 细胞内ROS测定第74-75页
        2.12. 蛋白质免疫印迹检(Western blotting)测蛋白表达水平第75页
    3. 结果第75-89页
        3.1. 体外和体内高血糖模型的建立第75-76页
        3.2. 高血糖诱导小鼠动脉内皮产生dsRNA第76-77页
        3.3. 体外高糖诱导人脐静脉内皮细胞(HUVEC)产生dsRNA第77-78页
        3.4. 通过RNA-IP鉴定HUVEC中产生的dsRNA是Alu RNA Sc亚家族第78-80页
        3.5. Alu RNA 促进活性氧簇(ROS)的产生第80-82页
        3.6. Alu RNA促进炎性因子IL-1β 的表达第82-83页
        3.7. Alu RNA负调控eNOS的表达第83页
        3.8. Alu RNA负调控SOD2的表达第83-84页
        3.9. Alu RNA激活NFκB信号通路第84-85页
        3.10. Alu RNA通过NFκB通路影响eNOS、SOD2和炎性因子IL-1β 的表达第85-87页
        3.11. Alu RNA功能缺失突变体的构建第87-88页
        3.12. Alu RNA在转录水平和翻译水平对目标基因的负调控作用第88-89页
    4. 讨论第89-92页
小结第92-93页
参考文献第93-100页
附录第100-103页
个人简历和研究成果第103-104页
致谢第104页

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