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基于数字基因表达谱的甜菜夜蛾表皮蛋白基因CPR97和CPR63的研究

摘要第6-7页
Abstract第7页
1 前言第8-13页
    1.1 文献综述第8-11页
        1.1.1 昆虫表皮蛋白第8-9页
        1.1.2 昆虫的黑化现象第9-11页
        1.1.3 数字基因表达谱升级版测序第11页
        1.1.4 甜菜夜蛾的发生与危害第11页
    1.2 研究目的与意义第11-13页
2 材料与方法第13-28页
    2.1 供试虫源第13页
        2.1.1 正常品系第13页
        2.1.2 蛹黑突变品系第13页
    2.2 试验材料第13-14页
        2.2.1 试剂第13-14页
        2.2.3 试验仪器设备及耗材第14页
    2.3 试验方法第14-28页
        2.3.1 甜菜夜蛾试虫准备第14页
        2.3.2 甜菜夜蛾表皮解剖取样第14页
        2.3.3 RNA样品研磨第14页
        2.3.4 总RNA提取第14-15页
        2.3.5 RNA沉淀的清洗第15页
        2.3.6 RNA溶解第15页
        2.3.7 mRNA的纯化第15-16页
        2.3.8 数字基因表达谱测序测序实验流程第16-17页
        2.3.9 测序数据筛选第17页
        2.3.10 测序质量评估第17-18页
        2.3.11 测序饱和度分析第18页
        2.3.12 测序随机性分析第18页
        2.3.13 基因表达量统计第18-19页
        2.3.14 基因覆盖度第19页
        2.3.15 与参考序列比对第19页
        2.3.16 基因功能注释第19页
        2.3.17 差异表达基因筛选第19-20页
        2.3.18 Gene Ontology功能显著性富集分析第20-21页
        2.3.19 Gene Ontology功能分类第21页
        2.3.20 表皮蛋白基因的初步分析第21-28页
3 结果与分析第28-53页
    3.1 RNA质量检测第28-29页
    3.2 数字基因表达谱升级版测序第29-47页
        3.2.1 数据比对统计第29-30页
        3.2.2 测序质量评估第30-31页
        3.2.3 测序饱和度分析第31-32页
        3.2.4 测序随机性分析第32-33页
        3.2.5 基因测序覆盖度第33-34页
        3.2.6 差异表达基因筛选第34-43页
        3.2.7 Gene Ontology功能显著性富集分析第43-46页
        3.2.8 Gene Ontology功能分类第46-47页
    3.3 表皮蛋白基因的初步分析第47-53页
        3.3.1 Real time PCR第47-49页
        3.3.2 全长基因的克隆(SEW/SEM)第49-50页
        3.3.3 CPR97 序列同源性分析第50页
        3.3.4 CPR63 蛋白序列分析第50-53页
4 讨论第53-55页
参考文献第55-62页
致谢第62-63页
附录第63页

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