摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
1 前言 | 第8-13页 |
1.1 文献综述 | 第8-11页 |
1.1.1 昆虫表皮蛋白 | 第8-9页 |
1.1.2 昆虫的黑化现象 | 第9-11页 |
1.1.3 数字基因表达谱升级版测序 | 第11页 |
1.1.4 甜菜夜蛾的发生与危害 | 第11页 |
1.2 研究目的与意义 | 第11-13页 |
2 材料与方法 | 第13-28页 |
2.1 供试虫源 | 第13页 |
2.1.1 正常品系 | 第13页 |
2.1.2 蛹黑突变品系 | 第13页 |
2.2 试验材料 | 第13-14页 |
2.2.1 试剂 | 第13-14页 |
2.2.3 试验仪器设备及耗材 | 第14页 |
2.3 试验方法 | 第14-28页 |
2.3.1 甜菜夜蛾试虫准备 | 第14页 |
2.3.2 甜菜夜蛾表皮解剖取样 | 第14页 |
2.3.3 RNA样品研磨 | 第14页 |
2.3.4 总RNA提取 | 第14-15页 |
2.3.5 RNA沉淀的清洗 | 第15页 |
2.3.6 RNA溶解 | 第15页 |
2.3.7 mRNA的纯化 | 第15-16页 |
2.3.8 数字基因表达谱测序测序实验流程 | 第16-17页 |
2.3.9 测序数据筛选 | 第17页 |
2.3.10 测序质量评估 | 第17-18页 |
2.3.11 测序饱和度分析 | 第18页 |
2.3.12 测序随机性分析 | 第18页 |
2.3.13 基因表达量统计 | 第18-19页 |
2.3.14 基因覆盖度 | 第19页 |
2.3.15 与参考序列比对 | 第19页 |
2.3.16 基因功能注释 | 第19页 |
2.3.17 差异表达基因筛选 | 第19-20页 |
2.3.18 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第20-21页 |
2.3.19 Gene Ontology功能分类 | 第21页 |
2.3.20 表皮蛋白基因的初步分析 | 第21-28页 |
3 结果与分析 | 第28-53页 |
3.1 RNA质量检测 | 第28-29页 |
3.2 数字基因表达谱升级版测序 | 第29-47页 |
3.2.1 数据比对统计 | 第29-30页 |
3.2.2 测序质量评估 | 第30-31页 |
3.2.3 测序饱和度分析 | 第31-32页 |
3.2.4 测序随机性分析 | 第32-33页 |
3.2.5 基因测序覆盖度 | 第33-34页 |
3.2.6 差异表达基因筛选 | 第34-43页 |
3.2.7 Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第43-46页 |
3.2.8 Gene Ontology功能分类 | 第46-47页 |
3.3 表皮蛋白基因的初步分析 | 第47-53页 |
3.3.1 Real time PCR | 第47-49页 |
3.3.2 全长基因的克隆(SEW/SEM) | 第49-50页 |
3.3.3 CPR97 序列同源性分析 | 第50页 |
3.3.4 CPR63 蛋白序列分析 | 第50-53页 |
4 讨论 | 第53-55页 |
参考文献 | 第55-62页 |
致谢 | 第62-63页 |
附录 | 第63页 |