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桃砧木根系与南方根结线虫早期互作的组织病理学与转录组学研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-21页
    1.1 根结线虫及其为害第14页
    1.2 根结线虫与寄主之间的分子互作第14-16页
        1.2.1 线虫分泌物第14-15页
        1.2.2 寄主反应第15-16页
    1.3 抗性基因第16-18页
    1.4 转录组学在研究根结线虫抗性上的应用第18页
    1.5 立题依据及技术路线第18-21页
        1.5.1 立题依据第18-19页
        1.5.2 研究目的和意义第19-20页
        1.5.3 技术路线第20-21页
第二章 材料与方法第21-25页
    2.1 材料第21页
    2.2 实验方法第21-25页
        2.2.1 根结线虫的收集第21页
        2.2.2 接种第21页
        2.2.3 根尖染色第21-22页
        2.2.4 石蜡切片第22页
        2.2.5 根长测量第22页
        2.2.6 统计方法第22-23页
        2.2.7 RNA提取第23页
        2.2.8 RNA纯化第23页
        2.2.9 RNA样品纯度、产量和完整性检测第23-24页
        2.2.10 转录组测序与分析第24-25页
第三章 结果与分析第25-43页
    3.1 南方根结线虫侵染对桃抗、感材料根系发育的影响第25-26页
        3.1.1 根长第25页
        3.1.2 根粗第25页
        3.1.3 侧根发育第25-26页
    3.2 南方根结线虫侵染在抗、感材料间的差异第26-28页
    3.3 抗、感材料根尖结构的变化第28-29页
    3.4 RNA样品的质量检测第29-30页
    3.5 转录组测序结果及初步分析第30-35页
        3.5.1 测序质量第30页
        3.5.2 序列比对结果第30-31页
        3.5.3 基因表达差异第31-32页
        3.5.4 差异基因功能分类分析第32-33页
        3.5.5 差异基因聚类分析第33-35页
    3.6 侵染过程相关基因的筛选第35-43页
        3.6.1 细胞形成相关基因第35-37页
        3.6.2 激素合成相关基因第37-39页
        3.6.3 防御相关基因第39-41页
        3.6.4 第二染色体近端区差异表达基因第41-43页
第四章 讨论第43-47页
    4.1 根结线虫侵染对桃组织结构的影响第43-44页
        4.1.1 表型变化差异分析第43页
        4.1.2 侵染规律变化差异分析第43页
        4.1.3 根尖组织结构变化差异分析第43-44页
    4.2 根结线虫侵染对桃基因表达水平的影响第44-47页
        4.2.1 根结线虫侵染对基因表达的影响第44页
        4.2.2 根结线虫侵染引起细胞水平的变化第44-45页
        4.2.3 根结线虫侵染引起激素水平的变化第45页
        4.2.4 根结线虫侵染诱导防御反应第45-47页
第五章 结论第47-48页
参考文献第48-56页
致谢第56-57页
作者简历第57页

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