| 摘要 | 第7-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| CHAPTER I INTRODUCTION AND REVIEW OF LITRATURE | 第22-51页 |
| 1.1 Role of transcription factors in flower development | 第22-23页 |
| 1.2 Importance of flowering | 第23-24页 |
| 1.3 MADS box genes | 第24-25页 |
| 1.4 Types of MADS-box genes | 第25-27页 |
| 1.4.1 Type I MADS-box genes | 第25-26页 |
| 1.4.2 Type II MADS-box genes | 第26-27页 |
| 1.5 The structure of MADS-box proteins | 第27-29页 |
| 1.6 Clades of MIKCC–type MADS-box genes | 第29-35页 |
| 1.6.1 SQUAMOSA/APETALA1-like genes | 第29-30页 |
| 1.6.2 DEFICIENS + GLOBOSA-like genes | 第30页 |
| 1.6.3 AGAMOUS/SEEDSTICK-like genes | 第30页 |
| 1.6.4 GGM13 (Bsister)-like genes | 第30-31页 |
| 1.6.5 AGAMOUS-like 2 genes | 第31页 |
| 1.6.6 AGAMOUS-like 6 genes | 第31-32页 |
| 1.6.7 AGAMOUS-like 12 genes | 第32页 |
| 1.6.8 AGAMOUS-like 15 genes | 第32-33页 |
| 1.6.9 AGAMOUS-like 17 genes | 第33页 |
| 1.6.10 FLOWERING LOCUS C-like genes | 第33页 |
| 1.6.11 STMADS11-like genes (SHORT VEGETATIVE PHASE) | 第33-34页 |
| 1.6.12 TM3-like genes (SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CO1) | 第34页 |
| 1.6.13 OsMADS32-like genes | 第34-35页 |
| 1.7 MIKC~* clade | 第35页 |
| 1.8 Plants MADS-box genes functions | 第35-38页 |
| 1.8.1 Type I MADS box genes functions | 第36页 |
| 1.8.2 Type II MADS box genes functions | 第36-37页 |
| 1.8.3 MIKC~*-type MADS box genes functions | 第37-38页 |
| 1.9 The role of MADS-box genes in abiotic stress | 第38-39页 |
| 1.10 The ABCDE Model | 第39-40页 |
| 1.11 The quartet model of flower organ identity | 第40-41页 |
| 1.12 Evolution of hexaploid Wheat | 第41-42页 |
| 1.13 Evolutionary relationship between wheat, rice and Brachypodium | 第42-43页 |
| 1.14 Floral architecture of wheat | 第43-44页 |
| 1.4.1 Inflorescence development in wheat | 第44页 |
| 1.15 ABCDE model of floral organ formation in wheat | 第44-48页 |
| 1.15.1 Wheat class A genes | 第45页 |
| 1.15.2 Wheat class B genes | 第45页 |
| 1.15.3 Wheat class C genes | 第45-46页 |
| 1.15.4 Wheat class D genes | 第46页 |
| 1.15.5 Wheat DROOPING LEAF gene, TaDL | 第46页 |
| 1.15.6 Wheat class E genes | 第46-48页 |
| 1.16 Significance of this research | 第48-49页 |
| 1.17 Objectives of this study | 第49-51页 |
| CHAPTER II Identification, sequence analysis and phylogenetic analysis of hexaploid wheat (Chinese Spring) MADS-box genes | 第51-82页 |
| 2.1 Introduction | 第51-52页 |
| 2.2 Material and methods | 第52-54页 |
| 2.2.1 Sequence identification, analysis and multiple alignment | 第52-53页 |
| 2.2.2 Phylogenetic analysis | 第53-54页 |
| 2.3 Results | 第54-77页 |
| 2.3.1 dentification and analysis of MADS-box genes in wheat | 第54-55页 |
| 2.3.2 Phylogenetic analysis | 第55-77页 |
| 2.4 Discussion | 第77-82页 |
| 2.4.1 The evolution of the MADS proteins in wheat, rice, and Brachypodium | 第77-78页 |
| 2.4.2 Duplication seems to have played major role in the expansion of MADS-box genes in hexaploid wheat | 第78-79页 |
| 2.4.3 Wheat MIKCc genes | 第79-80页 |
| 2.4.4 Birth and-death rate of wheat type I MADS-box genes | 第80页 |
| 2.4.5 Number and type of hexaploid wheat MADS-box genes | 第80-82页 |
| CHAPTER III Gene structure analysis of wheat MADS-box genes | 第82-103页 |
| 3.1 Introduction | 第82-84页 |
| 3.2 Material and methods | 第84页 |
| 3.2.1 Gene structure analysis | 第84页 |
| 3.3 Results | 第84-98页 |
| 3.3.1 Gene structure (Intron-exon structure) analysis | 第84-98页 |
| 3.4 Discussion | 第98-103页 |
| 3.4.1 Gene duplication impact on gene structure | 第98-99页 |
| 3.4.2 Gene structure comparison between wheat and other species | 第99-101页 |
| 3.4.3 Role of exon and intron length and arrangement play role in gene expression | 第101页 |
| 3.4.4 Intronless MADS-box genes | 第101-103页 |
| CHAPTER IV Chromosomal distribution and location of wheat (Chinese spring) MADS-box genes | 第103-111页 |
| 4.1 Introduction | 第103-105页 |
| 4.2 Materials and methods | 第105-109页 |
| 4.2.1 Plant materials | 第105页 |
| 4.2.2 Seeds sterilization | 第105页 |
| 4.2.3 DNA extraction | 第105-106页 |
| 4.2.4 DNA quantification and gel electrophoresis | 第106页 |
| 4.2.5 Genome specific primers for PCR amplification | 第106-107页 |
| 4.2.6 PCR amplification | 第107-108页 |
| 4.2.7 Gel electrophoresis, gene purification and sequencing | 第108页 |
| 4.2.8 Ligation of gene into p GEM-T Easy vector | 第108页 |
| 4.2.9 Transformation Protocol | 第108-109页 |
| 4.3 Results | 第109-110页 |
| 4.4 Discussion | 第110-111页 |
| CHAPTER V Transcript analysis of wheat MADS-box genes during vegetative and reproductivedevelopment | 第111-138页 |
| 5.1 Introduction | 第111-112页 |
| 5.2 Materials and methods | 第112-113页 |
| 5.2.1 Plant material and treatments | 第112页 |
| 5.2.2 Seeds sterilization | 第112-113页 |
| 5.2.3 Plant growth conditions | 第113页 |
| 5.2.4 Samples collection | 第113页 |
| 5.3 RNA Isolation | 第113-114页 |
| 5.4 cDNA synthesis for RT-PCR and PCR conditions | 第114-115页 |
| 5.5 cDNA confirmation and PCR conditions | 第115-116页 |
| 5.6 Primers designing for RT-PCR amplification | 第116页 |
| 5.7 Semi-quantitative RT-PCR and PCR conditions | 第116-119页 |
| 5.8 Results | 第119-125页 |
| 5.8.1 Transcript analysis of hexaploid wheat MADS-box genes during various developmental stages | 第119-125页 |
| 5.9 Discussion | 第125-138页 |
| 5.9.1 Differential expression of type II MADS-box genes in wheat,Brachypodium and rice | 第125-136页 |
| 5.9.2 Expression profiles of duplicated genes | 第136-138页 |
| CHAPTER VI Transcript analysis of wheat MADS-box genes during abiotic stress | 第138-148页 |
| 6.1 Introduction | 第138-140页 |
| 6.2 Materials and methods | 第140-141页 |
| 6.2.1 Plant Material | 第140页 |
| 6.2.2 Seeds sterilization | 第140页 |
| 6.2.3 Plant growth conditions | 第140页 |
| 6.2.4 Plant treatments | 第140页 |
| 6.2.5 Collection of plant material | 第140-141页 |
| 6.2.6 RNA Isolation | 第141页 |
| 6.2.7 cDNA synthesis and PCR conditions | 第141页 |
| 6.2.9 Primers designing for RT-PCR amplification | 第141页 |
| 6.2.10 Semi-quantitative RT-PCR and PCR conditions | 第141页 |
| 6.3 Results | 第141-145页 |
| 6.3.1 Seedlings stress treatment | 第141-143页 |
| 6.3.2 Leaf stress treatment | 第143-145页 |
| 6.4 Discussion | 第145-148页 |
| 6.4.1 Salt stress | 第146页 |
| 6.4.2 Drought stress | 第146-147页 |
| 6.4.3 Cold stress | 第147页 |
| 6.4.4 Functional divergence of wheat MADS-box gene pairs during abiotic stress | 第147-148页 |
| CONCLUSION | 第148-149页 |
| REFERENCES | 第149-174页 |
| APPENDIX | 第174-180页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第180-182页 |
| RESUME | 第182-185页 |
